Perbedaan antara QTL dan GWAS

Itu perbedaan utama Antara QTL dan GWAS bergantung pada jenis urutan yang digunakan dalam analisis. QTL menggunakan lokus gen linkage untuk menganalisis sifat -sifat fenotipik yang terkait dengan pewarisan poligenik sementara GWAS menggunakan seluruh sekuens genom untuk menganalisis polimorfisme nukleotida tunggal dari kondisi tertentu.

Peta QTL dan GWA memainkan peran penting dalam analisis genetik untuk sifat yang berbeda. Selain itu, mereka penting dalam menganalisis berbagai kondisi penyakit dengan etiologi yang tidak diketahui. Selain itu, pengurutan memainkan peran kunci dalam kedua teknik. Teknik -teknik ini selanjutnya dapat digabungkan dengan teknik throughput tinggi lainnya untuk meningkatkan akurasi dan presisi.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu qtl 
3. Apa itu gwas
4. Kesamaan antara QTL dan GWAS
5. Perbandingan berdampingan - QTL vs GWAS dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu qtl?

QTL adalah singkatan dari Lokus sifat kuantitatif. Ini adalah wilayah DNA yang terkait dengan sifat fenotipik. Secara umum, QTL menimbulkan efek poligenik. Distribusi QTL bervariasi, dan jumlah QTL menunjukkan tingkat variasi sifat fenotipik tertentu. Selain itu, mereka biasanya mengkodekan untuk mendasari sifat berkelanjutan dan bukan sifat diskrit.

Setelah identifikasi daerah QTL, penting untuk mengurutkan area QTL tertentu. Selain itu, untuk melakukan investigasi dan penelitian mudah, mengurutkan dan menyimpan data urutan daerah QTL umum terjadi dengan keterlibatan bioinformatika. Kami menyebut teknik ini pemetaan QTL. Selanjutnya, database membangun dengan urutan wilayah QTL.

Gambar 01: qtl scan

Selanjutnya, aplikasi urutan QTL terutama bergantung pada alat blast, di mana kesamaan urutan dapat ditentukan. Penting dalam menyimpulkan hubungan antar organisme. Selain itu, penting dalam menentukan kompleksitas fenotipe poligenik tertentu. Itu juga menentukan evolusi sifat tertentu.

Saat ini, analisis QTL dikombinasikan dengan teknik throughput tinggi lainnya seperti microarray DNA. Ini penting dalam analisis ekspresi fenotipe. Saat ini, para ilmuwan sangat tertarik untuk mengembangkan database QTL karena daerah QTL bertanggung jawab atas banyak sifat penting dari berbagai spesies.

Apa itu gwas?

GWAS berarti Studi Asosiasi Luas Genome. Ini juga mengacu pada seluruh studi asosiasi genom. Studi -studi ini berfokus terutama pada studi observasional. Ini menganalisis varian genetik dari individu yang berbeda yang biasanya dikaitkan dengan sifat tertentu. Selain itu, seluruh genom penting untuk analisis GWAS.

Gambar 02: GWAS

GWAS adalah alat penting dalam analisis polimorfisme nukleotida tunggal yang terkait dengan berbagai kondisi penyakit. Ini juga merupakan studi perbandingan dari berbagai polimorfisme nukleotida tunggal di seluruh populasi yang luas. Selain itu, sampel penelitian GWAS sangat tinggi; Oleh karena itu, ini juga mengambil format studi kohort cross-sectional.

Selain itu, studi GWAS pertama terjadi sehubungan dengan infark miokard dan menganalisis gen yang terkait dengan infark miokard. Saat ini, GWAS memainkan peran penting dalam menentukan latar belakang genetik penyakit kompleks dengan etiologi yang tidak diketahui.

Apa kesamaan antara QTL dan GWAS?

• Mereka mengandalkan data urutan DNA untuk analisis.
• Keduanya terkait dengan latar belakang genetik dari berbagai karakter.
• Selain itu, mereka membutuhkan alat bioinformatika untuk menyimpulkan dan menafsirkan hasil.
• Mereka dilakukan pada populasi besar.

Apa perbedaan antara QTL dan GWAS?

QTL Menganalisis Ciri -ciri fenotipik yang terkait dengan pewarisan poligenik menggunakan lokus gen terkait sementara GWAS menganalisis polimorfisme nukleotida tunggal dari kondisi tertentu menggunakan seluruh sekuens genom. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara QTL dan GWAS. Pemetaan QTL relatif merupakan teknik yang kurang kompleks daripada GWA karena membutuhkan sekuensing genom utuh.

Infografis di bawah ini merangkum perbedaan antara QTL dan GWAS dalam bentuk tabel.

Ringkasan -QTL vs GWAS

Pemetaan QTL dan GWAS memainkan peran utama dalam menentukan latar belakang genetik dari berbagai sifat fenotipik. Mereka juga membantu dalam menganalisis latar belakang genetik penyakit yang berbeda. Peta Pemetaan QTL Gen hubungan yang bertanggung jawab atas sifat berkelanjutan, dan juga melibatkan pemetaan gen pewarisan poligenik. Gwas, di sisi lain, terjadi dengan seluruh genom analisis untuk polimorfisme nukleotida tunggal. Selain itu, ini terjadi di seluruh populasi yang lebih besar. Dengan demikian, ini adalah ringkasan perbedaan antara QTL dan GWAS.

Referensi:

1. Liu, Ruixian, dkk. “Analisis GWAS dan Identifikasi QTL dari Ciri Kualitas Serat dan Komponen Hasil dalam Kapas Dataran Tinggi Menggunakan Penanda SNP Kepadatan Tinggi."Perbatasan dalam Ilmu Tanaman, Perbatasan Media S.A., 13 September. 2018, tersedia di sini.
2. “Gwas vs. Pemetaan QTL?"Posting terbaru, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. “Contoh QTL-Scan Wide Genome dari PLOS Biology” oleh-Styrkarsdottir U, Cazier JB, Kong A, Rolfsson O, Larsen H, dkk O. (2003) Hubungan osteoporosis dengan kromosom 20p12 dan asosiasi dengan BMP2. PLOS BIOL 1 (3): E69 (CC oleh 2.5) Via Commons Wikimedia
2. “GWAS Disease Allele Effect” oleh Bush WS dan Moore JH - Bush WS, Moore JH (2012) Bab 11: Studi Asosiasi Genome -Seluruh Genome. PLOS Comput Biol 8 (12): E1002822. doi: 10.1371/Jurnal.PCBI.1002822, (CC dengan 2.5) Via Commons Wikimedia