Itu perbedaan utama Antara elektroforesis gel 1D dan 2D adalah sifat yang digunakan untuk pemisahan protein pada elektroforesis gel. Elektroforesis gel 1D hanya memisahkan protein berdasarkan berat molekul sementara elektroforesis gel 2D memisahkan protein berdasarkan titik iso-listrik dan berat molekulnya.
Pemisahan protein dengan elektroforesis gel adalah teknik penting untuk mengkarakterisasi protein. Protein memiliki sifat yang bervariasi; Oleh karena itu, pemisahan lebih kompleks dibandingkan dengan pemisahan DNA dengan elektroforesis gel agarosa.
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu elektroforesis gel 1D
3. Apa itu elektroforesis gel 2D
4. Kesamaan antara elektroforesis gel 1D dan 2D
5. Perbandingan berdampingan - elektroforesis gel 1D vs 2D dalam bentuk tabel
6. Ringkasan
Elektroforesis gel 1D, juga dikenal sebagai satu dimensi elektroforesis gel, adalah metode pemisahan protein berdasarkan berat molekul. Pemisahan protein terutama terjadi menggunakan elektroforesis gel poliakrilamida. Berdasarkan konsep elektroforesis gel, molekul terpisah pada sifatnya dengan berat dan muatan molekul.
Oleh karena itu, untuk memberikan muatan seragam pada protein, pengobatan natrium dodecyl sulfate (SDS) dilakukan sebelum elektroforesis gel. SDS mendenaturasi protein dan memberikan muatan negatif yang seragam pada protein; Saat penerapan medan listrik terjadi, protein bermigrasi ke terminal positif berdasarkan berat molekulnya. Dengan demikian, dalam pemisahan, hanya satu properti yang dipertimbangkan. Inilah sebabnya mengapa metode ini disebut sebagai elektroforesis gel 1D.
Gambar 01: Elektroforesis Gel 1D
Selama elektroforesis gel 1D, protein dipisahkan berdasarkan berat molekulnya. Dalam hal ini, molekul berat yang lebih rendah bermigrasi lebih cepat dalam gel dibandingkan dengan protein dengan berat molekul tinggi. Dengan demikian, protein berat tinggi tetap dekat dengan sumur.
Elektroforesis gel 2D atau elektroforesis gel dua dimensi memisahkan protein berdasarkan dua sifat. Dua sifat adalah titik iso-listrik dari protein dan berat molekul. Metode pemisahan protein ini meningkatkan resolusi pemisahan protein. Titik protein iso-listrik tergantung pada pH di mana protein netral.
Gambar 02: Elektroforesis Gel 2D
Dengan demikian, dalam elektroforesis gel 2D, protein dibiarkan berjalan pada gradien pH tetap dalam dimensi pertama. Dalam dimensi kedua, protein dipisahkan menggunakan elektroforesis gel poliakrilamida vertikal atau horizontal. Dengan demikian, protein terpisah sesuai dengan berat molekulnya dalam dimensi kedua.
Selain itu, metode elektroforesis gel ini meningkatkan resolusi pemisahan protein. Oleh karena itu, protein yang terpisah lebih murni. Namun, biaya teknik ini jauh lebih tinggi dari satu dimensi gel elektroforesis.
Perbedaan utama antara elektroforesis gel 1D dan 2D adalah bahwa elektroforesis gel 1D memisahkan protein yang hanya berdasarkan pada berat molekul sementara elektroforesis gel 2D memisahkan protein berdasarkan kedua titik iso-listrik dan berat molekul molekul. Karena perbedaan dasar antara elektroforesis gel 1D dan 2D, resolusi pemisahan protein dan biaya kedua teknik juga bervariasi. Elektroforesis gel 2D menunjukkan resolusi tinggi dari elektroforesis gel 1D. Namun, elektroforesis gel 2D lebih mahal daripada elektroforesis gel 1D.
Di bawah infografis merangkum perbedaan antara elektroforesis gel 1D dan 2D.
Pemisahan protein bergantung pada banyak faktor. Elektroforesis gel 1D memisahkan protein yang hanya berdasarkan pada berat molekul. Namun, elektroforesis gel dua dimensi atau 2D meningkatkan resolusi pemisahan protein. Selanjutnya, elektroforesis gel 2D memisahkan protein berdasarkan titik iso-listrik dan berat molekul. Oleh karena itu, data ini penting untuk pemrosesan protein hilir dan di bidang proteomik. Dengan demikian, ini adalah ringkasan perbedaan antara elektroforesis gel 1D dan 2D.
1. Galeva, Nadezhda, dan Michailaltermann. “Perbandingan elektroforesis gel satu dimensi dan dua dimensi sebagai alat pemisahan untuk analisis proteomik mikrosom hati tikus: sitokrom p450 dan protein membran lainnya.Proteomik, u.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional, Juni 2002, tersedia di sini.
1. “Elektroforesis - Mengisi Sumur Gel 1D Dengan Campuran Protein” oleh Jean -Etienne Poirrier - Mengisi Sumur Gel 1D dengan Campuran Protein (CC BY -SA 2.0) Via Commons Wikimedia
2. “Elektroforesis 2d” oleh National Institute of Health - Center for Cancer Research Nanobiology Program, National Institute of Health (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia