Perbedaan antara kandidat gen dan gwas

Itu perbedaan utama Antara kandidat gen dan gwas adalah itu Pendekatan gen kandidat menyelidiki variasi genetik dalam sejumlah kecil gen yang ditentukan sebelumnya sementara GWA menyelidiki seluruh genom untuk variasi genetik yang umum di balik kondisi penyakit tertentu.

Pendekatan gen kandidat dan studi asosiasi genome-lebar (GWAS) adalah dua metode yang penting untuk mendeteksi kerentanan genetik terhadap penyakit. Pendekatan gen kandidat didasarkan pada sejumlah kecil gen yang telah ditentukan sebelumnya sementara GWAS didasarkan pada pengujian seluruh genom. Oleh karena itu, pendekatan gen kandidat membutuhkan pengetahuan sebelumnya tentang gen dengan relevansi dengan penyakit, tidak seperti GWAS.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu kandidat gen 
3. Apa itu gwas
4. Kesamaan antara kandidat gen dan gwas
5. Perbandingan Berdampingan - Gen Kandidat vs GWAS dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu kandidat gen?

Pendekatan gen kandidat adalah salah satu teknik yang menyelidiki hubungan antara variasi genetik dalam gen yang ditentukan sebelumnya dan fenotip atau keadaan penyakit. Dalam pendekatan ini, perlu untuk memiliki pengetahuan sebelumnya tentang dampak fungsional biologis gen pada sifat atau penyakit yang dimaksud. Berdasarkan pengetahuan ini, sejumlah kecil gen dipilih dan dianalisis untuk variasi genetik.

Gambar 01: Pendekatan Gen Kandidat

Pemilihan gen dilakukan berdasarkan relevansi biologis, fisiologis dan fungsional dengan penyakit yang dimaksud dalam pendekatan ini. Pendekatan ini sering dirancang sebagai studi kasus-kontrol.

Apa itu gwas?

GWAS adalah singkatan dari Genome-Wide Association Study. Ini juga mengacu pada studi asosiasi seluruh genom. Studi -studi ini berfokus terutama pada studi observasional. Mereka menganalisis varian genetik dari individu yang berbeda yang biasanya dikaitkan dengan sifat tertentu. Seluruh genom penting untuk analisis GWAS.

GWAS adalah alat penting dalam analisis polimorfisme nukleotida tunggal yang terkait dengan berbagai kondisi penyakit. Ini adalah studi perbandingan dari berbagai polimorfisme nukleotida tunggal di seluruh populasi yang luas. Sampel studi GWAS sangat tinggi; Oleh karena itu, ini juga mengambil format studi kohort cross-sectional.

Gambar 02: GWAS

Studi GWAS pertama terjadi sehubungan dengan infark miokard dan menganalisis gen yang terkait dengan infark miokard. Saat ini, GWAS memainkan peran penting dalam menentukan latar belakang genetik penyakit kompleks dengan etiologi yang tidak diketahui.

Apa kesamaan antara kandidat gen dan gwas?

• Pendekatan gen kandidat dan GWA adalah teknik yang menganalisis hubungan genetik antara genotipe dan fenotipe penyakit.
• Kedua pendekatan membantu memahami dasar genetik kerentanan terhadap penyakit.

Apa perbedaan antara kandidat gen dan gwas?

Pendekatan gen kandidat didasarkan pada gen kandidat atau gen yang telah ditentukan sebelumnya, sedangkan GWAS didasarkan pada seluruh genom. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara gen kandidat dan GWAS. Juga, dalam pendekatan gen kandidat, pemilihan gen diperlukan saat tidak diperlukan di GWAS.

Selain itu, pendekatan gen kandidat membutuhkan pengetahuan sebelumnya tentang gen yang relevan dengan penyakit, sementara itu tidak diperlukan untuk GWAS.

Infografis di bawah ini memberikan perbandingan yang lebih rinci terkait dengan perbedaan antara gen kandidat dan GWAS.

Ringkasan - Gen Kandidat vs Gwas

Gen Calon dan GWAS adalah dua studi asosiasi gen. Pendekatan gen kandidat berfokus pada variasi genetik yang terkait dengan penyakit dalam sejumlah kecil gen yang ditentukan sebelumnya. Sebaliknya, GWAS menyelidiki variasi genetik yang terkait dengan penyakit dalam seluruh genom. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara gen kandidat dan GWAS. Kedua metode itu penting dalam memahami dasar genetik kerentanan terhadap penyakit.

Referensi:

1. “Gen Calon - Tinjauan Umum | Topik ScienceDirect ”. Sciencedirect.Com, 2020, tersedia di sini.
2. “Gen Calon”. En.Wikipedia.Org, 2020, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. “Peringkat-kandidat-penyakit-genes-dari-gen-ekspresi-dan-protein-interaksi-a-katz-centrality-pose.0024306.G001 ”oleh Zhao J, Yang T, Huang Y, Holme P - File gambar dari Zhao J, Yang T, Huang Y, Holme P (2011). “Peringkat Calon Penyakit Gen dari Ekspresi Gen dan Interaksi Protein: Pendekatan Berbasis Katz-Centralitas”. PLoS satu. Doi: 10.1371/Jurnal.roti manis.0024306. PMID 21912686. PMC: 3166320 (CC oleh 3.0) Via Commons Wikimedia
2. “Manhattan Plot” oleh M. Kamran Ikram et al - Ikram MK et al (2010) Empat lokus baru (19q13, 6q24, 12q24, dan 5q14) mempengaruhi sirkulasi mikro in vivo. PLOS GENET. 2010 28 Okt; 6 (10): E1001184. doi: 10.1371/Jurnal.PGEN.1001184.G001 (CC dengan 2.5) Via Commons Wikimedia