Perbedaan antara berjalan kromosom dan melompat

Perbedaan utama - berjalan kromosom vs melompat
 

Berjalan kromosom dan melompat kromosom adalah dua alat teknis yang digunakan dalam biologi molekuler untuk menemukan gen pada kromosom dan pemetaan fisik genom. Berjalan kromosom adalah teknik yang digunakan untuk mengkloning gen target di perpustakaan genom dengan isolasi berulang dan kloning klon yang berdekatan dari perpustakaan genomik. Jumping Chromosomal adalah versi khusus dari jalan kromosom yang mengatasi breakpoint dari berjalan kromosom. Berjalan kromosom hanya dapat mengurutkan dan memetakan panjang kromosom yang kecil sementara lompatan kromosom memungkinkan pengurutan sebagian besar kromosom. Ini adalah perbedaan utama antara berjalan kromosom dan lompatan kromosom.

ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Chromosome Walking
3. Apa itu kromosom melompat
4. Perbandingan berdampingan - Chromosome Walking vs Jumping
5. Ringkasan

Apa itu Chromosome Walking?

Chromosome Walking adalah alat yang mengeksplorasi daerah urutan kromosom yang tidak diketahui dengan menggunakan fragmen pembatasan yang tumpang tindih. Dalam berjalan kromosom, bagian dari gen yang diketahui digunakan sebagai probe dan dilanjutkan dengan mengkarakterisasi panjang penuh kromosom yang akan dipetakan atau diurutkan. Ini beralih dari penanda ke panjang target. Dalam berjalan kromosom, ujung masing -masing fragmen yang tumpang tindih digunakan untuk hibridisasi untuk mengidentifikasi urutan berikutnya.

Probe disiapkan dari bagian akhir DNA yang dikloning dan disubkloning. Kemudian mereka digunakan untuk menemukan fragmen yang tumpang tindih berikutnya. Semua urutan tumpang tindih ini digunakan untuk membangun peta genetik kromosom dan menemukan gen target. Ini adalah metode menganalisis bentangan panjang DNA dengan fragmen yang tumpang tindih kecil dari perpustakaan genomik yang dibangun kembali.

Teknik berjalan kromosom - langkah -langkah

1. Isolasi fragmen DNA yang mengandung gen atau penanda yang diketahui di dekat gen target

2. Persiapan peta pembatasan dari fragmen yang dipilih dan mensubklonkan wilayah akhir dari fragmen untuk digunakan sebagai probe
3. Hibridisasi probe dengan fragmen yang tumpang tindih berikutnya
4. Persiapan peta pembatasan fragmen 1 dan subkloning wilayah akhir fragmen 1 untuk digunakan sebagai probe untuk identifikasi fragmen yang tumpang tindih berikutnya.
5. Hibridisasi probe dengan fragmen yang tumpang tindih berikutnya 2

6. Persiapan peta pembatasan fragmen 2 dan subkloning dari daerah akhir fragmen 2 untuk berfungsi sebagai probe untuk identifikasi fragmen yang tumpang tindih berikutnya

Langkah -langkah di atas harus dilanjutkan sampai gen target atau hingga 3 'akhir dari total urutan urutan.

Gambar 01: Teknik berjalan kromosom

Berjalan kromosom adalah aspek penting dari sitogenetik dalam menemukan SNP dari banyak organisme dan menganalisis penyakit yang ditransmisikan secara genetik dan menemukan mutasi gen yang relevan.

Apa itu kromosom melompat?

Jumping kromosom adalah teknik yang digunakan dalam biologi molekuler untuk pemetaan fisik genom organisme. Teknik ini diperkenalkan untuk mengatasi penghalang jalan kromosom yang muncul setelah menemukan daerah DNA berulang selama proses kloning. Oleh karena itu, teknik lompat kromosom dapat dianggap sebagai versi khusus dari berjalan kromosom.  Ini adalah metode yang cepat dibandingkan dengan berjalan kromosom dan memungkinkan melewati urutan DNA berulang yang tidak rentan dikloning selama berjalan kromosom. Lompatan kromosom mempersempit kesenjangan antara gen target dan penanda yang tersedia untuk pemetaan genom.

Alat lompat kromosom dimulai dengan pemotongan DNA spesifik dengan endonuklease dan ligasi pembatasan khusus dari fragmen menjadi loop sirkuler. Kemudian primer yang dirancang dari urutan yang diketahui digunakan untuk mengurutkan loop sirkularisasi. Primer ini memungkinkan melompat dan mengurutkan secara alternatif. Oleh karena itu, ia dapat melewati urutan DNA yang berulang dan dengan cepat berjalan melalui kromosom untuk pencarian gen target.

Penemuan gen mengkodekan untuk penyakit fibrosis kistik dilakukan dengan menggunakan alat lompat kromosom. Dikombinasikan bersama, lompatan kromosom dan berjalan dapat meningkatkan proses pemetaan genom.

Gambar 02: Kromosom melompat

Apa perbedaan antara berjalan kromosom dan melompat?

Ringkasan -Chromosome Walking vs Jumping

Jalan kromosom sering diterapkan ketika diketahui bahwa gen tertentu terletak di dekat gen yang sebelumnya dikloning dalam kromosom dan dimungkinkan untuk mengidentifikasinya dengan isolasi berulang klon genomik yang berdekatan dari perpustakaan genomik. Namun, ketika daerah DNA berulang ditemukan selama teknik berjalan kromosom, prosesnya tidak dapat dilanjutkan. Oleh karena itu, teknik ini pecah dari titik itu. Jumping kromosom adalah alat biologis molekuler yang mengatasi batasan ini untuk memetakan genom. Ini melewati daerah DNA berulang ini yang sulit dikloning dan membantu dalam pemetaan fisik genom. Ini adalah perbedaan utama antara berjalan kromosom dan melompat.

Referensi:
1. Nakaseko, Yukinobu, Yasuhisa Adachi, Shin-ichi Funahashi, Osami Niwa, dan Mitsuhiro Yanagida. “Berjalan kromosom menunjukkan urutan berulang yang sangat homolog hadir di semua daerah sentromer ragi fisi.Jurnal Embo. U.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional, Mei 1986. Web. 22 Mar. 2017
2. Taheri, Ali. “Berjalan dan melompat kromosom.Kemajuan dalam rekayasa genetika. Omics International, 30 Okt. 2013. Web. 22 Mar. 2017