Perbedaan antara fragmen Klenow dan DNA polimerase 1

Itu perbedaan utama Antara fragmen klenow dan DNA polimerase 1 adalah itu Fragmen klenow adalah sebagian besar DNA polimerase 1 yang tidak memiliki aktivitas eksonuklease 5 'hingga 3' sementara DNA polimerase adalah enzim dari E. coli yang memiliki ketiga domain termasuk aktivitas exonuclease 5 'hingga 3'.

DNA polimerase adalah salah satu enzim kunci yang terlibat dalam replikasi DNA dalam organisme hidup. Ada berbagai bentuk enzim DNA polimerase yang ditemukan dalam eukariota dan prokariota berdasarkan ukuran dan bentuk. DNA polimerase 1, 2 dan 3 hanya ditemukan pada organisme prokariotik, dan mereka memainkan peran yang berbeda dalam replikasi DNA. DNA polimerase 1 memiliki tiga domain dengan polimerase 5 'hingga 3', 3 'hingga 5' aktivitas eksonuklease dan aktivitas eksonuklease 5 'hingga 3'. Fragmen Klenow adalah produk proteolitik dari DNA polimerase 1. Itu memiliki 5 hingga 3 'polimerase dan 3' hingga 5 'aktivitas eksonuklease dari DNA polimerase 1 utuh, tetapi tidak memiliki aktivitas eksonuklease 5' hingga 3 '.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu fragmen klenow 
3. Apa itu DNA polimerase 1
4. Kesamaan antara fragmen Klenow dan DNA polimerase 1
5. Perbandingan berdampingan - fragmen klenow vs DNA polimerase 1 dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu fragmen klenow?

Fragmen Klenow adalah sebagian besar DNA polimerase 1. Tidak seperti DNA polimerase 1, 5 'hingga 3' aktivitas eksonuklease tidak terlihat pada fragmen klenow karena tidak memiliki domain eksonuklease 5 'hingga 3' ke depan. Fragmen Klenow diproduksi dengan mencerna DNA polimerase 1 dengan protease yang disebut subtilisin, yang merupakan enzim pencernaan protein. Dalam beberapa aplikasi, aktivitas eksonuklease 3 'hingga 5' dari fragmen klenow menjadi tidak diinginkan. Itu dapat dihilangkan dengan memperkenalkan mutasi pada gen yang mengkodekan fragmen klenow. Enzim yang dihasilkan yang hanya memiliki aktivitas polimerase 5 'hingga 3' dikenal sebagai fragmen exo-klenow. Secara morfologis, fragmen klenow menyerupai tangan kanan manusia. Ini memiliki domain eksonuklease N-terminal 3'-5 'dan domain C-terminal polimerase yang dipisahkan oleh sekitar 30 a.

Gambar 01: Fragmen Klenow dan DNA polimerase 1

Fragmen Klenow adalah alat penting dalam teknik biologis molekuler. Fragmen klenow memiliki banyak kegunaan. Mereka sangat penting dalam kloning ujung tumpul untuk menghasilkan fragmen tumpul. Fragmen klenow dapat menghilangkan overhang 3 '. Selain itu, fragmen klenow digunakan untuk mensintesis DNA untai ganda dari untai tunggal. Selain itu, mereka digunakan untuk menyiapkan probe berlabel radioaktif menggunakan aktivitas DNA polimerase DNA DNA 5'to 3 '.

Apa itu DNA polimerase 1?

DNA polimerase 1 (Pol 1) adalah enzim yang ditemukan dalam prokariota yang diperlukan untuk replikasi DNA bakteri. Ini adalah tipe pertama dari DNA polimerase yang ditemukan oleh Arthur Kornberg pada tahun 1956. Pol 1 adalah polimerase paling berlimpah E. coli. Itu dikodekan oleh gen pola dan terdiri dari 928 asam amino. Itu terdiri dari tiga domain. Ketiga domainnya memenuhi fungsi yang berbeda. Dua Domain Melakukan Aktivitas Eksonuklease 5 'Sampai 3' dan 3 'hingga 5' Aktivitas Eksonuklease. Karena aktivitas yang dimiliki oleh Pol 1, ini populer sebagai enzim perbaikan DNA daripada enzim replikasi DNA. Domain ketiga memiliki kemampuan untuk mengkatalisasi beberapa polimerisasi (5 'hingga 3') sebelum rilis DNA templat dan menghubungkan fragmen Okazaki bersama dengan mengisi DNA baru dan menghapus primer RNA.

Gambar 02: DNA polimerase

Pol 1 terisolasi dari E coli secara luas digunakan dalam aplikasi molekuler. Namun, begitu Taq polimerase ditemukan, itu menggantikan E coli Pol 1 dalam teknologi PCR. Taq polimerase adalah jenis polimerase DNA termostabil yang dimiliki Pol 1.

Apa kesamaan antara fragmen klenow dan DNA polimerase 1?

• Fragmen Klenow adalah sebagian besar DNA polimerase 1.
• Mereka memiliki aktivitas DNA DNA DNA DNA 5'to 3 'dan aktivitas eksonuklease 3'To 5' yang memediasi pengoreksian.
• Mereka digunakan untuk berbagai tujuan.

Apa perbedaan antara fragmen klenow dan DNA polimerase 1?

Perbedaan utama antara fragmen klenow dan DNA polimerase 1 adalah bahwa fragmen klenow tidak memiliki aktivitas eksonuklease 5 'hingga 3' sementara DNA polimerase 1 memiliki aktivitas eksonuklease 5 'hingga 3'. Oleh karena itu, fragmen klenow memiliki dua domain, sedangkan DNA polimerase 1 memiliki ketiga domain.

Di bawah infografis menunjukkan lebih banyak detail perbedaan antara fragmen klenow dan DNA polimerase 1.

Ringkasan -Klenow Fragmen vs DNA Polymerase 1

DNA polimerase 1 adalah enzim E. coli yang memiliki tiga domain sebagai domain polimerisasi 5 'hingga 3', domain eksonuklease 3 'hingga 5' dan domain 5 'hingga 3' '. Fragmen Klenow adalah sebagian besar DNA polimerase. Tidak memiliki satu domain DNA polimerase 1, yang merupakan domain eksonuklease 5 'hingga 3'. Perbedaan utama antara fragmen klenow dan DNA polimerase 1 adalah bahwa fragmen klenow tidak memiliki domain eksonuklease 5 'hingga 3' sementara DNA polimerase 1 memiliki domain eksonuklease 5 'hingga 3'.

Referensi:

1. “DNA Polymerase I - Tinjauan Umum | Topik ScienceDirect ”. Sciencedirect.Com, 2020, tersedia di sini.
2. "Fragmen Klenow". En.Wikipedia.Org, 2020, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Polymerasedomains" oleh (tidak diketahui) "molekul bulan ini", Maret 2000 - Bank Data Protein, (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia
2. "DNA Polymerase" von Yikrazuul - Eigenes Werk (CC BY -SA 3.0) Via Commons Wikimedia