Perbedaan antara primer dan promotor

Itu perbedaan utama Antara primer dan promotor adalah itu Primer adalah urutan DNA pendek yang disintesis secara komersial yang digunakan dalam PCR untuk amplifikasi urutan DNA target sementara promotor adalah urutan DNA spesifik yang menyediakan situs pengikatan awal yang aman untuk RNA polimerase dan faktor transkripsi Untuk memulai transkripsi.

Primer dan promotor adalah dua jenis urutan DNA. Primer adalah fragmen kecil DNA yang dibutuhkan untuk reaksi berantai polimerase (PCR). Ini memiliki sekuens nukleotida pendek yang saling melengkapi ke ujung mengapit untai DNA. Ada dua jenis primer, dan mereka bekerja sebagai titik awal untuk sintesis untaian DNA baru. Sebaliknya, promotor adalah urutan DNA spesifik yang terletak di hulu ke situs inisiasi transkripsi gen. Ini secara langsung berinteraksi dengan komponen mekanisme transkripsi seperti RNA polimerase dan faktor transkripsi untuk mengontrol transkripsi DNA. Oleh karena itu, RNA polimerase dan faktor transkripsi lainnya mengikat urutan promotor dan memulai transkripsi.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu primer 
3. Apa itu promotor
4. Kesamaan antara primer dan promotor
5. Perbandingan berdampingan - promotor primer vs dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu primer?

Primer adalah urutan DNA pendek yang dirancang untuk amplifikasi urutan DNA target. Secara struktural, mereka memiliki urutan nukleotida pendek yang melengkapi ujung mengapit dari untaian ganda DNA. Mereka biasanya sekitar 20 nukleotida. Selama PCR, Taq polimerase mengkatalisasi penambahan nukleotida ke dalam urutan nukleotida yang sudah ada sebelumnya. Oleh karena itu, primer berfungsi sebagai titik awal untuk sintesis untaian baru. Taq polimerase hanya bekerja dalam arah 5 'hingga 3'. Oleh karena itu, sintesis DNA juga terjadi dalam arah 5 'hingga 3' yang sama. Karena DNA beruntai ganda, dua jenis primer diperlukan dalam PCR. Mereka dikenal sebagai primer maju dan primer terbalik, berdasarkan arah perpanjangan primer selama sintesis DNA.

Gambar 01: Primer

Forward Primer Anneals dengan Antisense DNA Strand dan memulai sintesis untai + gen ke arah 5 'hingga 3'. Ini memiliki urutan nukleotida pendek yang melengkapi ujung 3 'mengapit untai antisense. Terbalik Primer Anneals dengan Sense Strand dan memulai sintesis untaian komplementer dari untai pengkodean, yaitu - untai gen ke arah 5'to 3 '. Dengan demikian, primer terbalik dirancang komplementer ke ujung 3 'untai pengkodean. Baik primer terbalik dan maju penting untuk produksi jutaan hingga miliaran salinan daerah DNA tertentu yang ditargetkan atau tertarik.

Apa itu promotor?

Promotor adalah urutan DNA yang terletak di hulu atau di ujung 5 'situs inisiasi transkripsi gen. Ini menyediakan situs yang mengikat untuk RNA polimerase dan elemen pengatur tertentu untuk memulai transkripsi gen. Ini adalah urutan peraturan yang diperlukan untuk menyalakan atau mematikan gen. Ada urutan nukleotida spesifik dalam promotor. Itu bisa memiliki 100-1000 pasangan basa. Promotor menunjukkan arah transkripsi. Selain itu, ini menunjukkan untai indera yang harus ditranskripsi.

Gambar 02: Promotor gen

Ada tiga jenis elemen promotor sebagai promotor inti, promotor proksimal dan promotor distal. Promotor inti adalah bagian minimal dari promotor yang diperlukan untuk memulai transkripsi. Terletak paling proksimal dengan kodon start. Tata Box adalah daerah yang dilestarikan yang ditemukan di banyak promotor inti eukariotik. Ditemukan 25 hingga 35 pasangan basa di hulu dari situs awal transkripsi. Promotor proksimal ditemukan lebih hulu dari promotor inti. Secara umum, terletak 250 pasangan basa di hulu untuk kodon start dan berisi elemen pengaturan primer. Promotor distal ditemukan di hulu untuk promotor proksimal, dan berisi elemen peraturan tambahan. Promotor bakteri memiliki dua elemen urutan pendek di promotor mereka. Tataat adalah urutan konsensus yang terletak di -10 promotor bakteri sedangkan TTGACA adalah urutan konsensus di -35. Mereka dikenal sebagai elemen -10 dan elemen -35.

Apa kesamaan antara primer dan promotor?

• Primer dan promotor adalah dua jenis urutan DNA.
• Mereka terdiri dari urutan nukleotida.
• Baik primer dan promotor penting untuk ekspresi gen.

Apa perbedaan antara primer dan promotor?

Primer adalah urutan nukleotida pendek yang dirancang untuk amplifikasi DNA target. Sebaliknya, promotor adalah urutan DNA regulasi spesifik yang ditemukan di hulu dari situs inisiasi transkripsi suatu gen. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara primer dan promotor. Primer sekitar 20 pasangan basa panjang sementara promotor dapat memiliki 100 -1000 pasangan basa. Secara fungsional, primer berfungsi sebagai urutan awal untuk sintesis untai baru sementara promotor mengontrol transkripsi gen dengan menyediakan situs pengikatan untuk RNA polimerase dan faktor transkripsi lainnya.

Selain itu, seorang promotor didefinisikan sebagai arah transkripsi dan menunjukkan untai indera suatu gen. Secara struktural, primer adalah urutan DNA pendek untai tunggal sementara promotor adalah urutan DNA beruntai ganda panjang.

Info-grafik di bawah ini Tabulasi lebih banyak perbandingan terkait dengan perbedaan antara primer dan promotor.

Ringkasan -Promotor Primer vs

Primer adalah sekuens nukleotida pendek yang saling melengkapi dengan ujung mengapit double-strand target. Dua jenis primer digunakan dalam PCR. Mereka berfungsi sebagai urutan awal untuk sintesis untaian baru. Primer dirancang secara komersial, dan mereka adalah urutan yang stabil suhu. Di sisi lain, promotor adalah urutan regulasi gen yang terletak di hulu ke situs inisiasi transkripsi. Promotor mengontrol transkripsi gen. Mereka menyediakan situs pengikatan untuk RNA polimerase dan faktor transkripsi untuk memulai transkripsi. Dengan demikian, ini adalah ringkasan perbedaan antara primer dan promotor.

Referensi:

1. “Addgene: Promotor”. Addgene.Org, 2020, tersedia di sini.
2. “Primer (Biologi Molekuler)”. En.Wikipedia.Org, 2020, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Primers RevComp" oleh Zephyris - karya sendiri (CC BY -SA 3.0) Via Commons Wikimedia
2. “Struktur Gen Eukaryote 2 Annotated” oleh Thomas Shafee - Shafee T, Lowe R (2017). “Struktur gen eukariotik dan prokariotik”. Wikijournal of Medicine 4 (1). Doi: 10.15347/WJM/2017.002. ISSN 20024436 (CC oleh 4.0) Via Commons Wikimedia