Itu perbedaan utama Antara elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida adalah elektroforesis gel agarosa menggunakan gel agarosa yang dituangkan secara horizontal untuk memisahkan fragmen DNA yang relatif lebih besar, sedangkan elektroforesis gel poliakrilamida menggunakan gel poliakrilamida yang dituangkan secara vertikal untuk memisahkan fragmen asam nukleat yang lebih pendek.
Elektroforesis adalah jenis teknik yang menggunakan medan listrik yang diterapkan di seluruh matriks gel untuk memisahkan biomolekul seperti DNA, RNA, dan protein. Pemisahan biomolekul seperti DNA, RNA, dan protein melalui elektroforesis didasarkan pada muatan dan ukuran. Sampel dimuat ke dalam sumur gel. Kemudian, medan listrik diterapkan di seluruh gel. Lapangan menyebabkan molekul bermuatan negatif bergerak ke arah elektroda positif. Matriks gel bertindak sebagai saringan molekuler yang melaluinya molekul terkecil lewat atau bepergian dengan cepat sementara molekul yang lebih besar bergerak perlahan. Ini memungkinkan pemisahan molekul berdasarkan muatan dan ukuran. Oleh karena itu, elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida adalah dua jenis teknik elektroforesis gel yang terutama membantu memisahkan molekul berdasarkan ukuran dan muatannya.
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu elektroforesis gel agarosa
3. Apa itu elektroforesis gel poliakrilamida
4. Kesamaan -elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida
5. Agarose vs elektroforesis gel poliakrilamida dalam bentuk tabel
6. Ringkasan -Agarose vs elektroforesis gel poliakrilamida
Elektroforesis gel agarosa adalah teknik yang menggunakan gel agarosa untuk memisahkan biomolekul seperti DNA dan RNA. Ini adalah teknik yang digunakan untuk memisahkan asam nukleat terutama berdasarkan ukuran. Senyawa utama yang disebut agarosa yang digunakan dalam teknik ini adalah polisakarida. Itu berasal dari rumput laut. Agarosa dapat dilarutkan dalam buffer mendidih dan kemudian dapat dituangkan ke dalam nampan yang disimpan secara horizontal. Di nampan, menjadi kokoh saat mendingin untuk membentuk lempengan. Gel agarosa dituangkan dengan sisir di tempat untuk membuat sumur ke mana asam nukleat seperti DNA atau RNA dimuat setelah gel dipadatkan.
Gambar 01: elektroforesis gel agarosa
Gel kemudian direndam dalam buffer yang sesuai, dan arus diterapkan di seluruh gel. DNA memiliki muatan negatif yang seragam yang tidak tergantung pada komposisi urutan molekul. Oleh karena itu, molekul DNA akan bermigrasi dari katoda (-) menuju anoda (+). Tingkat migrasi secara langsung tergantung pada ukuran molekul. Makromolekul terbesar memiliki waktu yang paling sulit menavigasi melalui gel. Di sisi lain, makromolekul yang lebih kecil tergelincir melalui gel dengan cepat dan cukup mudah.
Elektroforesis gel poliakrilamida (halaman) adalah teknik yang menggunakan gel poliakrilamida untuk memisahkan biomolekul. Ini adalah teknik yang banyak digunakan untuk memisahkan makromolekul biologis, biasanya protein dan asam nukleat, menurut mobilitas elektroforetiknya. Hidrasi akrilonitril menghasilkan pembentukan molekul akrilamida oleh Nitrile Hydratase. Akrilamida larut dalam air, dan pada penambahan inisiator radikal bebas, polimerisasi akrilamida, menghasilkan pembentukan gel poliakrilamida. Biasanya, peningkatan konsentrasi akrilamida menghasilkan penurunan ukuran pori dalam gel. Gel poliakrilamida dituangkan secara vertikal, tidak seperti gel agarosa.
Gambar 02: Elektroforesis gel poliakrilamida
Dalam elektroforesis gel poliakrilamida, molekul dapat berjalan di negara asalnya, menjaga struktur molekul tingkat tinggi. Metode ini disebut halaman asli. Atau, denaturant kimia juga dapat ditambahkan untuk menghilangkan struktur tingkat tinggi dan mengubah molekul menjadi molekul yang tidak terstruktur yang mobilitasnya hanya bergantung pada panjangnya. Jenis ini disebut SDS-PAGE.
Elektroforesis gel agarosa adalah teknik yang menggunakan gel agarosa yang dituangkan secara horizontal untuk memisahkan biomolekul, sedangkan elektroforesis gel poliakrilamida adalah teknik yang menggunakan gel poliakrilamida yang dituangkan secara vertikal untuk memisahkan biomolekul keluar. Ini adalah perbedaan utama antara elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida. Selain itu, elektroforesis gel agarosa digunakan untuk pemisahan DNA dan RNA, sedangkan elektroforesis gel poliakrilamida digunakan untuk pemisahan asam nukleat seperti DNA, RNA, atau protein.
Tabel berikut merangkum perbedaan antara elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida.
Elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida adalah dua jenis teknik elektroforesis gel yang digunakan dalam laboratorium biologi molekuler. Elektroforesis gel agarosa menggunakan gel agarosa untuk memisahkan biomolekul. Agarose umumnya tidak beracun bagi manusia, sedangkan poliakrilamida beracun bagi manusia. Selain itu, elektroforesis gel agarosa menunjukkan resolusi rendah sementara elektroforesis gel poliakrilamida menunjukkan resolusi yang lebih. Elektroforesis gel poliakrilamida menggunakan gel poliakrilamida untuk memisahkan biomolekul. Ini merangkum perbedaan antara elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida
1. “Elektroforesis gel agarosa."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.
2. “Elektroforesis gel poliakrilamida."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.
1. “Agarose Gel Electrophoresis” oleh PlaxColab (CC oleh 2.0) Via Flickr
2. “Elektroforesis Gel Polyacrylamide Protein” oleh Jean-Etienne Minh-Duy Poirrier dari Bruxelles, Belgia-Protein dalam Elektroforesis Gel 1D (CC BY-SA 2.0) Via Commons Wikimedia