Apa perbedaan antara halorhodopsin dan bacteriorhodopsin

Itu perbedaan utama antara halorhodopsin dan bakteriorhodopsin adalah halorhodopsin adalah pompa klorida yang digerakkan oleh cahaya yang ditemukan di archaea sedangkan bakteriorhodopsin adalah pompa proton yang digerakkan oleh cahaya yang ditemukan di archaea.

Halorhodopsin dan bakteriorhodopsin adalah protein membran heptahelikal. Mereka juga dikenal sebagai archaea rhodopsins. Secara umum, keduanya ditemukan di membran ungu, bagian dari Halobacterium salinarum membran sel. Halorhodopsin adalah pompa klorida berbasis cahaya yang memungkinkan ion mengalir dari sisi ekstraseluler ke sisi sitoplasma. Di sisi lain, bakteriorhodopsin adalah pompa proton yang digerakkan oleh cahaya yang memungkinkan ion mengalir dari sisi sitoplasma ke sisi ekstraseluler. Oleh karena itu, halorhodopsin dan bakteriorhodopsin adalah dua benjolan ion yang digerakkan oleh cahaya yang ditemukan di archaea, terutama di halobacteria.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu halorhodopsin 
3. Apa itu Bacteriorhodopsin
4. Kesamaan - halorhodopsin dan bakteriorhodopsin
5. Halorhodopsin vs bakteriorhodopsin dalam bentuk tabel
6. Ringkasan - halorhodopsin vs bacteriorhodopsin

Apa itu halorhodopsin?

Halorhodopsin adalah protein retina dari archaeon Halobacterium salinarum, yang menggunakan energi lampu hijau (500 hingga 650nm) untuk mengangkut ion klorida ke dalam sel terhadap potensial membran. Penyerapan kalium klorida oleh sel -sel ini oleh pompa ion seperti halorhodopsin diperlukan untuk menjaga keseimbangan osmotik selama pertumbuhan sel. Selain itu, pompa anion berbasis cahaya menghemat sejumlah besar energi metabolisme. Halorhodopsin melipat menjadi topologi helix tujuh-transmembran dengan loop pendek yang saling berhubungan. Heliks (bernama A ke G) diatur dalam struktur seperti busur dan mengelilingi molekul retina yang terikat secara kovalen melalui basa Schiff ke asam amino lisin yang dikonservasi (LYS-242) pada helix G. Bagian melintang halorhodopsin dengan residu penting untuk transfer klorida. Itu adalah jalur anion yang mungkin.

Gambar 01: halorhodopsin

Penyerapan foton oleh halorhodopsin memulai siklus katalitik, yang mengarah ke pengangkutan anion ke dalam sel. Siklus ini dapat dijelaskan dalam hal enam langkah isomerisasi (i), transportasi ion (t), dan perubahan aksesibilitas (sakelar s). Selain itu, metode penting untuk analisis struktur dan fungsi halorhodopsin adalah kemungkinan memproduksi protein yang dimodifikasi secara khusus dengan mutagenesis yang diarahkan ke lokasi dan ekspresi berlebih homolog.

Apa itu Bacteriorhodopsin?

Bacteriorhodopsin dikenal sebagai pompa proton yang digerakkan oleh cahaya di archaea seperti Halobacterium salinarum. Bacteriorhodopsin adalah protein yang digunakan oleh archaea, terutama oleh Halobacteria, kelas euryachaeota. Ini bertindak sebagai pompa proton yang menangkap energi cahaya dan menggunakan energi ini untuk memindahkan proton melintasi membran keluar dari sel. Gradien proton yang dihasilkan kemudian dikonversi menjadi energi kimia.

Gambar 02: Bacteriorhodopsin

Bacteriorhodopsin adalah protein membran integral 27 kDa. Elemen berulang dari kisi heksagonal terdiri dari tiga rantai protein yang identik, masing -masing diputar 120 derajat relatif terhadap yang lain. Selain itu, setiap monomer memiliki tujuh heliks alfa transmembran dan ekstraseluler menghadap beta-sheet dua untai. Selain itu, gaya motif protein yang dihasilkan oleh protein retina ini digunakan oleh ATP synthase untuk menghasilkan ATP. Oleh karena itu, dengan mengekspresikan bakteriorhodopsin, sel -sel archaea mampu mensintesis ATP tanpa adanya sumber karbon.

Apa kesamaan antara halorhodopsin dan bacteriorhodopsin?

• Halorhodopsin dan bakteriorhodopsin termasuk dalam subfamili dari protein membran heptahelikal.
• Keduanya adalah protein retina.
• Mereka juga dikenal sebagai archaea rhodopsins.
• Mereka adalah benjolan ion yang digerakkan oleh cahaya.
• Keduanya hadir di membran ungu, bagian dari Halobacterium salinarum membran sel.
• Mereka memiliki fungsi khusus yang sangat penting untuk kelangsungan hidup Halobacteria.

Apa perbedaan antara halorhodopsin dan bacteriorhodopsin?

Halorhodopsin adalah pompa klorida yang digerakkan oleh cahaya yang ditemukan di archaea, sedangkan bakteriorhodopsin adalah pompa proton yang digerakkan oleh cahaya yang ditemukan di archaea. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara halorhodopsin dan bacteriorhodopsin. Selain itu, halorhodopsin adalah pompa klorida yang digerakkan oleh cahaya yang memungkinkan ion mengalir dari ekstraseluler ke sisi sitoplasma. Di sisi lain, bakteriorhodopsin adalah pompa proton yang digerakkan oleh cahaya yang memungkinkan ion mengalir dari sitoplasma ke sisi ekstraseluler.

Infografis di bawah ini menyajikan perbedaan antara halorhodopsin dan bakteriorhodopsin dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -halorhodopsin vs bacteriorhodopsin

Halorhodopsin dan bakteriorhodopsin adalah dua benjolan ion yang digerakkan oleh cahaya yang ditemukan di archaea, terutama halobacteria. Halorhodopsin adalah pompa klorida yang digerakkan oleh cahaya, sedangkan bakteriorhodopsin adalah pompa proton yang digerakkan oleh cahaya. Halorhodopsin memungkinkan aliran ion dari ekstraseluler ke sisi sitoplasma. Sebaliknya, bakteriorhodopsin memungkinkan aliran ion dari sitoplasma ke sisi ekstraseluler. Jadi, ini merangkum perbedaan antara halorhodopsin dan bacteriorhodopsin.

Referensi:

1. “Halorhodopsin."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.
2. “Bacteriorhodopsin."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.

Gambar milik:

1. "Halorhodopsin PS" oleh ASW-Hamburg-karya sendiri (CC BY-SA 4.0) Via Commons Wikimedia
2. “BacTeriorhodopsin Retinal” oleh Darekk2 - Dibuat Menggunakan Corel Draw dan Adobe Photoshop Elements. (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia