Apa perbedaan antara endonuclease pembatasan tipe 1 2 dan 3

Itu perbedaan utama Antara tipe 1 2 dan 3 pembatasan endonuclease adalah bahwa situs pembelahan endonuclease restriksi tipe 1 adalah acak dan jauh dari situs pengakuan, sedangkan situs pembelahan endonuclease pembatasan tipe 2 berada di situs pengakuan dan situs pembelahan endonuclease pembatasan tipe 3 adalah 20-30 pasangan basa hilir di hilir dari situs pengakuan.

Pembatasan Endonuklease atau Enzim Pembatasan adalah enzim yang membantu membelah DNA menjadi fragmen di atau dekat situs pengakuan spesifik dalam molekul yang dikenal sebagai situs pembatasan. Mereka termasuk dalam kelas enzim kelompok endonuklease yang lebih luas. Pembatasan endonucleases umumnya diklasifikasikan ke dalam lima jenis sesuai dengan strukturnya, situs pengakuan spesifik di mana mereka memotong substrat DNA mereka, dan berdasarkan jika situs pengakuan dan pembelahan dipisahkan satu sama lain atau tidak. Untuk memotong atau membelah DNA, semua enzim restriksi menghasilkan dua sayatan, sekali melalui setiap tulang punggung gula-fosfat dari heliks ganda DNA. Enzim pembatasan hadir dalam bakteri dan archaea untuk memberikan mekanisme pertahanan terhadap invasi virus.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa endonuclease pembatasan tipe 1
3. Apa endonuclease pembatasan tipe 2
4. Apa endonuclease pembatasan tipe 3
5. Kesamaan - Tipe 1 2 dan 3 Pembatasan Endonuclease
6. Tipe 1 vs 2 vs 3 endonuclease restriksi dalam bentuk tabel
7. Ringkasan - Tipe 1 vs 2 vs 3 Endonuclease Pembatasan

Apa endonuclease pembatasan tipe 1?

Endonuklease pembatasan tipe 1 adalah kompleks enzim dengan aktivitas pembatasan dan metilase. Itu diidentifikasi dalam dua jenis berbeda E. coli. Enzim restriksi tipe 1 dipotong di situs yang berbeda dan merupakan jarak acak dari situs pengakuan. Pembelahan di situs acak ini mengikuti proses translokasi DNA. Enzim ini bersifat multifungsi dan memiliki kemampuan untuk pencernaan pembatasan dan aktivitas modifikasi tergantung pada status metilasi DNA yang ditargetkan. CO-Factors S-adenosyl methionine (Adomet), hidrolised adenosin triphosphate (ATP), dan ion magnesium (Mg ²⁺) sangat penting untuk aktivitas penuh mereka.

Enzim pembatasan tipe 1 terdiri dari tiga subunit yang disebut HSDR, HSDM, dan HSDS. HSDR diperlukan untuk pencernaan pembatasan. HSDM diperlukan untuk penambahan gugus metil untuk meng -host DNA. Proses ini dikenal sebagai aktivitas methyltransferase. HSDS diperlukan untuk pengakuan situs pengikatan DNA tertentu. Ini juga penting dalam pencernaan pembatasan serta aktivitas methyltransferase.

Apa endonuclease pembatasan tipe 2?

Endonuclease restriksi tipe 2 adalah jenis enzim restriksi yang membantu dalam membelah DNA pada posisi tertentu, baik di dalam atau dekat dengan situs pengenalan restriksi. Mereka membentuk homodimer dengan situs pengakuan yang tidak terbagi dan palindromik, dengan panjang empat hingga delapan nukleotida. Enzim pembatasan tipe 2 tidak memerlukan ATP atau Adomet untuk aktivitasnya, tetapi MG²⁺ diperlukan sebagai kofaktor. Enzim ini membantu dalam pembelahan ikatan fosfodiester dari DNA helix ganda. Mereka bersatu di tengah kedua untaian untuk menghasilkan ujung tumpul atau bersatu pada posisi terhuyung -huyung meninggalkan overhang yang dikenal sebagai ujung lengket.

Endonuklease restriksi tipe 2 adalah enzim restriksi yang paling sering tersedia karena mereka menghasilkan fragmen diskrit dengan pencernaan pembatasan dengan memotong khusus pada atau dekat dengan situs pengakuan. Endonuklease pembatasan tipe 2 milik keluarga besar; Oleh karena itu, mereka dibagi menjadi subfamili berdasarkan penyimpangan dari karakteristik khas enzim ini. Subkategori ini termasuk tipe 2b, 2e, 2f, 2g, 2s, dan 2t.

Apa endonuclease pembatasan tipe 3?

Endonuclease restriksi tipe 3 adalah jenis enzim restriksi yang mengenali dua urutan non-palindromik terpisah yang berorientasi terbalik. Mereka biasanya membelah DNA sekitar 20-30 pasangan basa di hilir situs pengakuan. Enzim ini terdiri dari lebih dari satu subunit. Mereka juga membutuhkan ATP dan Adomet untuk aktivitas mereka. Enzim pembatasan tipe 3 sangat penting dalam mekanisme modifikasi pembatasan DNA prokariotik. Enzim ini membantu melindungi organisme dari menyerang DNA asing.

Enzim tipe 3 adalah protein hetero-oligomer dan multifungsi yang terdiri dari dua subunit. Mereka res dan mod. Subunit res penting dalam pencernaan pembatasan; Namun, ia tidak memiliki aktivitas enzimatik sendiri. Subunit mod membantu dalam pengakuan sekuens DNA yang spesifik untuk sistem dan merupakan modifikasi methyltransferase. Enzim restriksi tipe 3 juga mengenali 5-6 pasangan basa panjang urutan DNA asimetris panjang dan membelah pasangan basa 25-27 di hilir untuk meninggalkan tonjolan 5 'untai pendek untai tunggal. Enzim ini hanya methylate satu untai DNA dan cukup untuk melindungi dari pencernaan pembatasan.

Apa kesamaan antara endonuclease pembatasan tipe 1 2 dan 3?

• Tipe 1, tipe 2, dan endonuklease restriksi tipe 3 adalah tiga enzim restriksi.
• Mereka bertanggung jawab atas pembelahan DNA di situs tertentu yang disebut situs pengakuan restriksi dalam molekul.
• Mereka termasuk dalam kelas endonuclease yang lebih luas.
• Mereka membuat dua sayatan, sekali di masing-masing dari dua tulang punggung gula-fosfat dari helix ganda DNA.
• Mereka hadir di bakteri dan archaea.
• Selain itu, mereka membantu melindungi dari virus yang menyerang.
• Ketiga enzim memiliki kemampuan untuk pencernaan pembatasan dan aktivitas methyltransferase.
• Enzim pembatasan memotong DNA asing melalui pencernaan pembatasan.
• Methyltransferase adalah enzim modifikasi yang ada di ketiga enzim.

Apa perbedaan antara endonuclease pembatasan tipe 1 2 dan 3?

Situs pembelahan endonuclease restriksi tipe 1 adalah acak dan jauh dari situs pengakuan, sedangkan dalam endonuclease pembatasan tipe 2, berada di situs pengakuan. Sedangkan, dalam pembatasan tipe 3 endonuclease, situs pembelahan adalah 20-30 pasangan basa hilir dari situs pengakuan. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara endonuclease pembatasan Tipe 1 2 dan 3. Selain itu, endonuklease pembatasan tipe 1 terdiri dari tiga subunit dan dianggap sebagai enzim bifungsional dengan aktivitas pembatasan dan metilase. Endonuclease pembatasan tipe 2 terdiri dari dua subunit dan memiliki pembatasan dan aktivitas metilase terpisah. Dan, endonuklease pembatasan tipe 3 terdiri dari lebih dari satu subunit, biasanya dua, dan juga merupakan enzim bifungsional dengan aktivitas pembatasan dan metilase.

Infografis di bawah ini menyajikan perbedaan antara endonuklease restriksi tipe 1 2 dan 3 dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -Tipe 1 vs 2 vs 3 Endonuclease Pembatasan

Pembatasan endonuclease membantu membelah DNA menjadi fragmen di atau dekat situs pengakuan spesifik dalam molekul. Tipe 1, tipe 2 dan tipe 3 restriksi endonuclease adalah tiga enzim restriksi. Situs pembelahan endonuclease pembatasan tipe 1 adalah acak dan jauh dari situs pengakuan. Situs pembelahan endonuclease restriksi tipe 2 berada di situs pengakuan, sedangkan situs pembelahan endonuclease pembatasan tipe 3 adalah 20-30 pasangan basa di hilir situs pengakuan. Jadi, ini merangkum perbedaan antara endonuclease restriksi tipe 1 2 dan 3.

Referensi:

1. Loenen, w. A., et al. “Enzim pembatasan tipe I dan kerabat mereka."Penelitian Asam Nukleat, Vol. 42, no. 1, 2013, pp. 20-44.
2. Rao, Desirazu n., et al. “Enzim Modifikasi Pembatasan Tipe III: Perspektif Historis."Penelitian Asam Nukleat, Vol. 42, no. 1, 2013, pp. 45-55.
3. “Pembatasan endonucleases."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.

Gambar milik:

1. "Langkah Kloning Molekuler" oleh Alexpicardal97 - Karya Sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia
2. “Situs Pembatasan Hindiii dan Sticky Ends Vector” oleh Helixitta - Karya Sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia
3. “Polimorfisme Panjang Fragmen Pembatasan” oleh Lolyas39 - Karya Sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia