Perbedaan antara CD dan ORF

Itu perbedaan utama Antara CD dan ORF adalah itu CDS adalah bahwa urutan nukleotida aktual dari gen yang diterjemahkan menjadi protein sedangkan ORF adalah hamparan urutan DNA yang dimulai dengan situs inisiasi terjemahan (Mulai kodon) dan diakhiri dengan situs terminasi terjemahan (stop codon).

Gen memiliki urutan pengkodean (CDS). Ini terdiri dari ekson total gen dan kodon awal dan kodon stop. Itu adalah bagian sebenarnya dari gen yang menerjemahkan dan menghasilkan protein. Bingkai bacaan terbuka atau ORF adalah urutan nukleotida yang terletak di antara kodon start dan kodon stop. Tidak ada kodon stop di dalam ORF yang mengganggu kode genetik yang diterjemahkan menjadi protein. Dalam prokariota, CD dan ORF gen adalah sama.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu CD 
3. Apa itu orf
4. Kesamaan antara CD dan ORF
5. Perbandingan berdampingan - CDS vs ORF dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu CD?

CD atau urutan pengkodean adalah bagian dari gen yang benar -benar diterjemahkan menjadi protein. Itu terdiri dari ekson dan dua kodon yang dikenal sebagai kodon AUG dan stop codon. CDS tidak mengandung dua wilayah yang tidak diterjemahkan: 5 'UTR dan 3 ”UTR. Selain itu, intron tidak termasuk dalam CD.

Gambar 01: Urutan pengkodean

Jika dibandingkan dengan seluruh genom individu, urutan pengkodean adalah sebagian kecil. Urutan pengkodean terdiri dari urutan nukleotida yang diperlukan untuk membuat urutan asam amino dari protein. Oleh karena itu, CD adalah ekson terkonsentrasi yang dapat dibagi menjadi kembar tiga nukleotida atau kodon. Kodon memunculkan asam amino.

Apa itu ORF?

Bingkai bacaan terbuka atau ORF adalah bentangan kontinu dari urutan nukleotida yang dimulai dengan kodon awal dan diakhiri dengan kodon stop. Dengan kata -kata sederhana, ORF mengacu pada wilayah urutan nukleotida yang terletak di antara kodon start dan stop. Di antaranya, tidak ada kodon berhenti mengganggu ORF. Urutan nukleotida antara kodon start dan stop encodes untuk asam amino. Secara umum, kodon mulai adalah ATG saat stop kodon adalah TAG, TAA, dan TGA. ORF memberikan protein fungsional saat ditranskripsi dan diterjemahkan. Oleh karena itu, ORF termasuk kodon start, beberapa kodon di wilayah tengah dan kodon stop. Menariknya, ORF memiliki panjang yang dapat dibagi tiga.

Gambar 02: Bingkai baca terbuka

Dalam prokariota, karena tidak ada intron, ORF adalah urutan pengkodean gen yang ditranskripsi langsung ke mRNA. Oleh karena itu, CD dan PRF sama dalam prokariota. Saat mencari gen dalam prokariota, mudah untuk mendeteksi ORF dan menemukan gen dalam prokariota.  Dalam eukariota, karena ada intron, ORF adalah urutan kodon yang terbentuk setelah pemrosesan atau splicing RNA. ORF adalah bukti yang membantu prediksi gen karena ORF panjang cenderung menjadi bagian dari gen.

Apa kesamaan antara CD dan ORF?

• Dalam prokariota, CD dan ORF adalah sama.
• Keduanya memiliki kodon mulai dan stop codon.
• Mereka memiliki sejumlah nukleotida yang dapat dibagi tiga.
• Begitu mereka menerjemahkan, mereka menghasilkan urutan asam amino.

Apa perbedaan antara CD dan ORF?

CDS adalah bagian aktual dari gen yang diterjemahkan menjadi protein sedangkan ORF adalah hamparan DNA antara kodon awal dan kodon stop. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara CD dan ORF. Selain itu, CD tidak mengandung intron, tetapi ORF mungkin mengandung intron. CDS transkrip sepenuhnya menjadi urutan mRNA lengkap sementara ORF dapat menjadi bagian dari urutan mRNA. Dengan demikian, ini adalah perbedaan lain antara CD dan ORF.

Di bawah tabulasi infografis berdampingan perbedaan antara CD dan ORF.

Ringkasan -CDS vs ORF

CD dan ORF adalah dua bagian penting dari suatu gen. CDS mengacu pada wilayah aktual DNA yang diterjemahkan menjadi protein. ORF adalah urutan DNA yang dimulai dengan kodon awal "ATG" dan diakhiri dengan salah satu dari tiga kodon terminasi (TAA, TAG atau TGA). ORF mungkin menjadi bagian dari mRNA lengkap dari suatu gen. Namun, urutan pengkodean gen transkrip untuk menyelesaikan urutan mRNA. Semua CDS adalah ORFS. Tetapi tidak semua ORF adalah CDSS. Dengan demikian, ini merangkum perbedaan antara CD dan ORF.

Referensi:

1. “Bingkai baca terbuka.”Wikipedia, Wikimedia Foundation, 27 Nov. 2020, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Wilayah pengkodean dalam DNA" oleh Pragpats - karya sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia
2. "Sampleorf" oleh LuongDl - karya sendiri (domain publik) melalui Commons Wikimedia