Perbedaan antara ekstraksi DNA dan RNA

Perbedaan utama - ekstraksi DNA vs RNA
 

Studi DNA dan RNA adalah aspek vital untuk memahami konsep dasar biologi molekuler, bioteknologi, dan genetika. Ekstraksi sampel DNA dan RNA murni diperlukan untuk melakukan prosedur eksperimental selama studi ini. Perbedaan utama antara ekstraksi DNA dan RNA adalah itu Proses ekstraksi DNA memurnikan DNA sementara ekstraksi RNA memurnikan RNA. Proses ekstraksi DNA memiliki tiga langkah berbeda: lisis sel dan katabolisme lipid dan protein membran, penggumpalan katabolit dengan larutan garam pekat dan presipitasi DNA dengan etanol. Prosedur tiga langkah dapat terdiri dari dua langkah opsional. Proses pemurnian RNA terdiri dari empat langkah berbeda: penambahan guanidium tiosianat untuk lisis sel, denaturasi protein termasuk ribonuklease, pemisahan RNA dengan penambahan kloroform dan fenol dan pencucian endapan menggunakan etanol.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu ekstraksi DNA
3. Apa itu ekstraksi RNA
4. Kesamaan antara ekstraksi DNA dan RNA
5. Perbandingan berdampingan - ekstraksi DNA vs RNA dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu ekstraksi DNA?

Ekstraksi DNA adalah proses fisik dan kimia yang digunakan untuk memurnikan DNA dari sampel. Ekstraksi DNA adalah aspek penting dalam konteks biologi molekuler dan ilmu forensik. Prosesnya adalah tiga langkah dasar. Awalnya, sel -sel yang menarik harus diperoleh. Selanjutnya, lisis sel difasilitasi untuk memecahkan membran sel, yang membuka sel dan memaparkan sitoplasma bersama dengan DNA. Surfaktan atau deterjen lain dapat digunakan untuk membran lipid dari membran sel sementara protein yang ada dikatabolisme oleh protease. Ini merupakan langkah opsional. Setelah sel dilisiskan, penggumpalan molekul yang dikatabolisme difasilitasi oleh larutan garam terkonsentrasi. Diikuti oleh sentrifugasi larutan yang memisahkan gumpalan puing dari DNA. Pada tahap ini, DNA yang dibedakan dicampur dengan reagen dan garam yang digunakan selama siklus sel.

Gambar 01: Ekstraksi DNA

Untuk memurnikannya lebih lanjut, langkah -langkah berikut dapat digunakan. Salah satu metode adalah presipitasi etanol, yang melibatkan pencampuran etanol es dingin dengan sampel DNA yang terpisah. DNA tidak larut dalam alkohol dan dengan demikian menghasilkan pelet karena agregasi molekul DNA bersama -sama.  Sodium asetat ditambahkan dalam proses ini untuk meningkatkan tingkat presipitasi dengan meningkatkan kekuatan ionik. Selain proses presipitasi etanol, proses ekstraksi fenol-kloroform juga dapat diinduksi untuk ini. Dalam metode ini, fenol mendenaturasi protein yang ada dalam sampel. Setelah disentrifugasi, protein terdenaturasi akan tetap dalam fase organik sedangkan molekul DNA yang dicampur dengan kloroform akan hadir dalam fase berair. Kloroform akan menghilangkan residu fenol. Setelah ekstraksi selesai, DNA tetap dilarutkan dalam buffer TE atau air ultra murni.

Apa itu ekstraksi RNA?

Pemurnian RNA adalah proses yang digunakan RNA dari sampel biologis. Karena adanya ribonuklease dalam sel dan jaringan, proses ini rumit. Enzim ribonuclease memiliki kemampuan untuk mendegradasi RNA dengan cepat. Sifat kimia ribonucleases sangat stabil, dan sulit untuk menonaktifkannya. Menetralkan ribonucleases adalah pilihan. Karena enzim ini ada di mana -mana dalam sel dan jaringan, teknik khusus dikembangkan untuk ekstraksi RNA. Dari banyak metode, metode umum adalah ekstraksi guanidinium thiocynate-phenol-chloroform.

Gambar 02: Ekstraksi RNA

Metode ekstraksi guanidinium thiocynate-phenol-chloroform tergantung pada sentrifugasi dan pemisahan fase. Campuran yang akan disentrifugasi terdiri dari sampel berair dan larutan jenuh air yang terdiri dari fenol dan kloroform. Setelah disentrifugasi, solusinya terdiri dari fase berair atas dan fase organik yang lebih rendah di bawah kondisi pH netral (pH 7-8). RNA hadir dalam fase air. Fase organik biasanya terdiri dari protein yang dilarutkan dalam fenol dan lipid yang dilarutkan dalam kloroform. Agen chaotropic (molekul yang memiliki kemampuan untuk memecahkan ikatan hidrogen antara molekul air) ditambahkan; Ini dikenal sebagai, guanidinium thiocyanate. Agen ini memiliki kemampuan untuk denature protein yang meliputi ribonuklease yang dapat menurunkan RNA dan terlibat dalam lisis sel. Ini juga memisahkan rRNA dari protein ribosom. Langkah terakhir pemurnian RNA adalah mencuci presipitasi fase berair dengan etanol. RNA juga bisa dimurnikan menggunakan nitrogen cair.

Apa kesamaan antara ekstraksi DNA dan RNA?

• Kedua proses ekstraksi menggunakan bahan kimia berbahaya seperti fenol dan kloroform.
• Sentrifugasi adalah teknik penting untuk kedua proses.
• Etanol digunakan untuk mencuci endapan dan mendapatkan DNA atau RNA yang dimurnikan.

Apa perbedaan antara ekstraksi DNA dan RNA?

Ringkasan -Ekstraksi DNA vs RNA

Ekstraksi DNA dan RNA adalah aspek vital dari prosedur eksperimental untuk studi biologi molekuler, genetika, dan bioteknologi. Kedua proses melibatkan reagen yang sama, tetapi ekstraksi RNA menggunakan reagen khusus yang dikenal sebagai guanidium tiosianat yang mengurangi aktivitas ribonuklease. Ini adalah perbedaan utama antara ekstraksi DNA dan RNA.

Unduh Ekstraksi DNA Versi PDF RNA

Anda dapat mengunduh versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi pdf di sini perbedaan antara ekstraksi DNA dan RNA

Referensi:

1. Chomczynski, p, dan n sacchi. “Metode satu langkah isolasi RNA dengan ekstraksi asam guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform.”Biokimia analitik., U.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional, April. 1987, tersedia di sini. Diakses 31 Agustus. 2017
2. Hindawi. “DNA, RNA, dan ekstraksi protein: masa lalu dan masa kini.“Biomed Research International, Hindawi, 30 Nov. 2009, tersedia di sini. Diakses 31 Agustus. 2017.

Gambar milik:

1. "DNA diekstraksi dari Alpukat" oleh Mike Seyfang - Awalnya Diposting ke Flickr As Success (CC oleh 2.0) Via Commons Wikimedia
2. “PHOH-CHCL3 Extraction” oleh Squidonius (Talk)-Karya Sendiri (Teks Asli: Buatan Sendiri) (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia