Perbedaan antara ferredoxin dan rubredoxin
Itu perbedaan utama antara ferredoxin dan rubredoxin adalah itu ferredoxin memiliki potensi redoks yang jauh lebih rendah dibandingkan dengan rubredoxin.
Baik ferredoxin dan rubredoxin adalah protein yang mengandung besi. Namun, kita dapat menemukan ferredoxin dalam bentuk bakteri dan pada tanaman karena itu adalah protein kloroplas. Namun, rubredoxin adalah protein yang hanya terjadi pada bakteri dan archaea. Kedua senyawa ini memiliki struktur yang sangat mirip.
ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu ferredoxin
3. Apa itu rubredoxin
4. Perbandingan berdampingan -ferredoxin vs rubredoxin dalam bentuk tabel
5. Ringkasan
Apa itu ferredoxin?
Ferredoxin adalah protein yang mengandung zat besi-sulfur. Itu terlibat dalam memediasi transfer elektron dalam berbagai reaksi metabolisme. Ini adalah protein kecil yang larut dalam air, dan ada di kloroplas. Atom-atom besi dan sulfur dalam protein ini diatur dalam kelompok zat besi-sulfur. Mereka dapat bertindak sebagai kapasitor biologis dengan menerima dan mengeluarkan elektron. Di sini, keadaan oksidasi atom besi berubah dari +2 menjadi +3. Oleh karena itu, mereka bertindak sebagai agen transfer elektron dalam reaksi redoks yang terjadi di lingkungan biologis. Secara relatif, potensi redoks protein ini rendah. Molekul protein ferredoksin dapat mengandung dua, tiga atau empat atom besi per molekul protein. Ada tiga jenis ferredoxins yang umum: Fe2S2 Ferredoxins, Fe4S4 ferredoxins dan fe3S4 ferredoxins.
Peran utama ferredoxin adalah mengalokasikan elektron energi tinggi dalam kloroplas, dan protein ini terlibat dalam mendistribusikan elektron yang diperlukan untuk fiksasi karbon dioksida, reduksi nitril, reduksi sulfit, sintesis glutamat, aliran elektron siklik, dll.
Apa itu rubredoxin?
Rubredoxin adalah protein yang mengandung zat besi yang dapat ditemukan di bakteri dan archaea. Ini adalah jenis protein dengan berat molekul rendah (biasanya protein adalah senyawa berat molekul tinggi). Namun, tidak seperti ferredoxin, protein rubredoxin tidak mengandung sulfida anorganik. Peran utama rubredoksin adalah bahwa ia berpartisipasi dalam mekanisme transfer elektron dalam reaksi redoks yang terjadi dalam sistem biologis.
Saat mempertimbangkan struktur rubredoxin, itu mengandung atom besi sentral yang memiliki hampir geometri tetrahedral. Keempat kelompok yang terikat pada atom besi ini adalah residu sistein. Mayoritas protein rubredoksin adalah spesies kimia yang larut dalam air. Namun, ada beberapa spesies yang tidak larut yang ada sebagai protein yang terikat membran. E.G. Rubredoxin-a.
Selama mekanisme transfer elektron, keadaan oksidasi atom besi sentral berubah dari +2 menjadi +3. Kita dapat dengan mudah mengenali perubahan keadaan oksidasi karena warna berubah dari merah menjadi tidak berwarna. Selama perubahan ini, ion logam tetap dalam keadaan putaran tinggi karena sangat membantu untuk meminimalkan perubahan struktural protein. Biasanya, potensi reduksi rubredoksin lebih tinggi dari ferredoxin; itu dalam kisaran +50 mV hingga -50 mV.
Apa perbedaan antara ferredoxin dan rubredoxin?
Ferredoxin dan rubredoxin adalah senyawa protein yang mengandung besi dan sulfur sebagai komponen. Perbedaan utama antara ferredoxin dan rubredoxin adalah bahwa ferredoxin memiliki potensi redoks yang jauh lebih rendah dibandingkan dengan rubredoxin. Potensi redoks ferredoxin adalah sekitar -420 mV, dan potensi redoks rubredoksin berkisar dari -50 hingga +50 mV. Selain itu, ferredoxin dapat mengandung dua, tiga atau empat atom besi per molekul protein, tetapi dalam rubredoksin, ada satu atom besi sentral. Namun, kedua molekul ini memiliki geometri tetrahedral yang sangat mirip di sekitar atom besi.
Selain itu, ferredoxin mengandung sulfur anorganik sebagai komponen dalam molekul protein, tetapi tidak ada sulfur anorganik pada rubredoksin. Saat mempertimbangkan kejadiannya, ferredoxin dapat terjadi di kedua bentuk bakteri dan pada tanaman, tetapi rubredoksin terjadi pada bakteri dan archaea.
Tabulasi di bawah ini merangkum perbedaan antara ferredoxin dan rubredoxin.
Ringkasan -ferredoxin vs rubredoxin
Ferredoxin dan rubredoxin adalah senyawa protein yang mengandung besi dan sulfur sebagai komponen. Perbedaan utama antara ferredoxin dan rubredoxin adalah bahwa ferredoxin memiliki potensi redoks yang jauh lebih rendah dibandingkan dengan rubredoxin.
Referensi:
1. Chipperfield, J.R. “Besi | Sifat dan tekad." Encyclopedia of Food Sciences and Nutrition, 2003, hlm. 3367-3373., doi: 10.1016/B0-12-227055-X/00650-7.
Gambar milik:
1. “3p1m.PDB1 ”oleh JMOL Development Team - JMOL (CC0) via Commons Wikimedia
2. "PDB 1S24 EBI" oleh Jawahar Swaminathan dan Staf MSD di European Bioinformatics Institute - (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia
