Itu perbedaan utama Antara Knockout dan Knockdown adalah bahwa Knockout Gen adalah teknik di mana gen yang menarik sepenuhnya dihilangkan (keadaan tidak beroperasi) untuk mempelajari fungsi gen sementara knockdown gen adalah teknik lain di mana gen yang menarik dibungkam Untuk menyelidiki peran gen tertentu dalam sistem biologis.
Teknik genetik yang berbeda beroperasi untuk menyelidiki fungsi gen dalam sistem biologis hidup. Knockout dan knockdown gen adalah dua teknik seperti itu. Teknik -teknik ini membantu para ilmuwan untuk mengidentifikasi aspek fungsional dari gen yang berbeda dalam organisme hidup.
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu KO Gene
3. Apa itu knockdown gen
4. Kesamaan antara KO gen dan knockdown
5. Perbandingan Berdampingan - Knockout Gen Vs Knockdown Dalam bentuk tabel
6. Ringkasan
Knockout gen adalah teknik genetik yang membuat satu atau lebih gen tidak beroperasi dalam organisme hidup. Ini juga merupakan proses mematikan atau menghapus gen organisme. Aplikasi utama dari teknik ini adalah mempelajari fungsi gen. Proses ini mengevaluasi efek gen yang hilang atau dihapus. Proses KO juga melibatkan enzim dan teknik splicing tertentu.
Gambar 01: Knockout Gene
Ada beberapa variasi dalam teknik knockout gen berdasarkan jumlah gen yang terlibat. Mereka KO ganda (Knockout dari dua gen), KO tiga kali lipat (KO tiga gen) dan Knockout empat kali lipat (KO empat gen). Knockout gen selanjutnya diklasifikasikan menjadi dua kelompok; KO heterozigot dan KO homozigot.
Knockdown gen adalah prosedur eksperimental di mana prosedur ini menekan atau mengurangi ekspresi gen atau gen tertentu dari suatu organisme. Pembungkaman gen adalah definisi umum untuk knockdown gen. Selama prosedur ini, aktivasi atau degradasi mRNA yang dihasilkan melibatkan gangguan RNA (RNAi), RNA kecil (siRNA) dan RNA jepit rambut pendek (shRNA).
Gambar 02: Pembungkaman Gen
Penggunaan utama knockdown gen adalah untuk menyelidiki peran gen tertentu dalam sistem biologis. Oleh karena itu, teknik ini mencapai studi onkogen (Bcl-2 dan p53) dan gen yang menyebabkan penyakit neurologis, infeksi virus dan penyakit herediter.
Knockout gen vs knockdown | |
Knockout gen adalah dalam operasi gen (penghapusan gen dari DNA) dari suatu organisme melalui teknik genetik yang berbeda. | Knockdown gen adalah prosedur eksperimental untuk menekan (mengurangi atau diam) ekspresi gen atau gen tertentu dari suatu organisme. |
Fungsi | |
Memfasilitasi studi fungsi gen dengan menganalisis hasil gen yang hilang. | Memfasilitasi studi onkogen, gen yang menyebabkan penyakit neurologis, infeksi virus, dan penyakit herediter. |
Keterlibatan agen RNA | |
Keterlibatan agen RNA tidak signifikan dalam teknik ini. | Proses tersebut melibatkan agen -agen seperti siRNA, shRNA, dan RNAi untuk menonaktifkan mRNA. |
Penggunaan Agen Kimia | |
Agen enzimatik digunakan. | Tidak ada agen kimia seperti itu yang digunakan. |
Efek pada gen | |
Benar -benar menghilangkan gen dari DNA. | Menekan atau membungkam gen. |
Klasifikasi | |
KO ganda, knockout triple dan knockout quadruple dan knockout heterozigot dan homozigot adalah berbagai jenis KO gen. | Tidak ada sistem klasifikasi seperti itu yang tersedia untuk pembungkaman gen. |
Dua teknik yang kita bahas di sini; Knockout dan knockdown gen, adalah metode untuk menyelidiki fungsi gen yang berbeda. Knockout gen benar -benar membuat gen tidak beroperasi sementara gen knockdown membungkam gen yang menarik. Namun, kedua prosedur mencegah ekspresi gen. Agen yang berbeda mampu mencapai kedua proses ini. Knock Out Gen adalah jenis penghapusan sementara knockdown gen adalah jenis inaktivasi. Inilah perbedaan antara gen knock out dan knockdown.
1.Shaffer, Catherine. “Knockout gen versus knockdown."Berita-Medis.net, 12 Feb. 2018. Tersedia disini
2.“Knockout gen.Berita Alam, Grup Penerbitan Alam. Tersedia disini
1.'Knockout Mice5006-300'by Maggie Bartlett, NHGRI. (Domain publik) via commons wikimedia
2.'Rnai-Simplified'by Matzke Ma, Matzke Ajm (2004) Menanam benih paradigma baru. PLOS BIOL 2 (5): E133 doi: 10.1371/Jurnal.pbio.0020133., (CC dengan 2.5) Via Commons Wikimedia