Perbedaan antara ekstraksi DNA tanaman dan hewan

Itu perbedaan utama Antara ekstraksi DNA tumbuhan dan hewan adalah itu Dalam ekstraksi DNA tanaman, perlu untuk memecahkan dinding sel dengan menggiling jaringan dalam es kering atau nitrogen cair untuk melepaskan kandungan seluler saat dalam ekstraksi DNA hewan, tidak perlu melakukan langkah ini karena sel -sel hewan tidak memiliki dinding sel.

DNA genom adalah bahan genetik sel tanaman dan hewan. DNA genomik unik untuk setiap tumbuhan atau hewan individu. Ekstraksi DNA DNA berkualitas baik adalah prasyarat untuk penelitian molekuler. DNA organisme diekstraksi untuk identifikasi, diagnosis penyakit, deteksi gen dan urutan spesifik, tujuan forensik, pengujian ayah, pengurutan genom, dan pengembangan obat, dll. Metode ekstraksi DNA bervariasi tergantung pada jenis sel - apakah itu sel hewani atau sel tanaman.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu ekstraksi DNA tanaman
3. Apa itu ekstraksi DNA hewani
4. Kesamaan antara ekstraksi DNA tumbuhan dan hewan
5. Perbandingan Berdampingan -Tumbuhan vs Ekstraksi DNA Hewan Dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu ekstraksi DNA tanaman?

DNA dalam sel tanaman diekstraksi untuk berbagai studi molekuler. Diperlukan untuk mengekstraksi DNA genom murni yang utuh. Oleh karena itu, ada berbagai jenis protokol ekstraksi DNA yang berbeda dari protokol ekstraksi DNA dari sel hewan. Ini karena sel -sel tanaman memiliki dinding sel yang harus rusak untuk mengeluarkan isi seluler.

Ekstraksi biasanya dilakukan dengan menggiling jaringan tanaman dalam es kering atau nitrogen cair menggunakan mortar dan alu. Kemudian membran sel terganggu, dan konten seluler diambil ke dalam buffer ekstraksi. Ini biasanya dilakukan dengan menggunakan deterjen; SDS (natrium dodecyl sulfate) atau buffer CTAB (cetyltrimethylammonium bromide). DNA yang dilepaskan dilindungi dari nuklease endogen menggunakan agen pengkelat seperti EDTA. Selain itu, protein dipisahkan dari DNA menggunakan kloroform atau fenol.

Gambar 01: Ekstraksi DNA tanaman

Tanaman mensintesis polisakarida dan polifenol, termasuk flavonoid dan metabolit sekunder lainnya. Senyawa ini mengganggu ekstraksi DNA genom murni. Oleh karena itu, sebagian besar protokol ekstraksi DNA tanaman melibatkan langkah lain, seperti teknik gradien kepadatan cesium klorida untuk menghilangkan senyawa ini.

Sebagian besar protokol ekstraksi DNA merekomendasikan penggunaan sampel daun segar untuk ekstraksi DNA. Beberapa metode tidak termasuk bahan kimia berbahaya seperti nitrogen cair dan fenol. Protokol CTAB (Cetyl trimethylammonium bromide) adalah protokol ekstraksi DNA tanaman yang populer yang memfasilitasi ekstraksi DNA genom tanaman berkualitas tinggi berkualitas tinggi.  Ini adalah metode yang sederhana, aman, andal, dan hemat biaya untuk ekstraksi DNA tanaman. Sebagian besar metode lain adalah versi yang dimodifikasi dari metode CTAB.

Apa itu ekstraksi DNA hewani?

Ekstraksi DNA hewan adalah ekstraksi DNA genomik dari sel hewan untuk analisis molekuler. Tidak seperti ekstraksi DNA tanaman, kerusakan dinding sel tidak diperlukan untuk sel hewan karena mereka tidak memiliki dinding sel. Sel darah adalah jenis sel hewan yang paling umum digunakan untuk berbagai tujuan.

Gambar 02: Ekstraksi DNA

Metode fenol-kloroform adalah salah satu pilihan terbaik untuk sel darah. Hasil dan kualitas DNA tinggi saat mengekstraksi DNA dari metode ini. Ini adalah protokol ekstraksi DNA cair-cair, dan metode ini memisahkan molekul DNA berdasarkan kelarutannya dalam larutan yang tidak bercampur. Fenol, kloroform dan isoamil alkohol adalah tiga bahan teratas dari metode ini.

Apa kesamaan antara ekstraksi DNA tumbuhan dan hewan?

• Selama ekstraksi DNA tanaman dan hewan, membran sel harus terganggu.
• DNA harus dilindungi dari nuklease endogen.
• Selain itu, geser DNA harus dicegah.
• Kit komersial tersedia untuk ekstraksi DNA tanaman dan DNA hewan.
• Sebagian besar metode ekstraksi DNA tanaman dan hewan membutuhkan modifikasi dan standardisasi berkelanjutan.

Apa perbedaan antara ekstraksi DNA tumbuhan dan hewan?

Perbedaan utama antara ekstraksi DNA tanaman dan hewan adalah bahwa ekstraksi DNA tanaman membutuhkan penggilingan jaringan tanaman dalam es kering atau nitrogen cair untuk memecahkan dinding sel sementara ekstraksi DNA hewani tidak memerlukan langkah ini karena sel -sel hewan tidak memiliki a dinding sel. Metode CTAB adalah salah satu metode terbaik untuk ekstraksi DNA tanaman sedangkan metode fenol-kloroform adalah salah satu metode terbaik untuk ekstraksi DNA hewan.

Infografis di bawah ini tabulasi perbedaan antara ekstraksi DNA tanaman dan hewan.

Ringkasan -Ekstraksi DNA Tanaman vs Hewan

Metode yang berbeda tersedia untuk ekstraksi DNA dari jenis sel yang berbeda. Oleh karena itu, protokol ekstraksi DNA tanaman berbeda dari protokol ekstraksi sel DNA hewan. Ekstraksi DNA tanaman membutuhkan gangguan dinding sel, membran sel dan membran nuklir sementara ekstraksi DNA hewan membutuhkan kerusakan membran sel dan membran nuklir. Lebih penting lagi, ekstraksi DNA sel hewan tidak memerlukan gangguan dinding sel dengan menggiling dalam es kering atau nitrogen cair. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara ekstraksi DNA tanaman dan hewan.

Referensi:

1. “Ekstraksi DNA fenol kloroform: Dasar -dasar, persiapan bahan kimia dan protokol."Pendidikan Genetik, 10 Jan. 2020, tersedia di sini.
2. Aljanabi, l. Lupakan, dkk. “Ekstraksi DNA genomik berkualitas tinggi dari berbagai pesanan tanaman yang menerapkan metode berbasis CTAB yang dimodifikasi.”Buletin Pusat Penelitian Nasional, Springeropen, 1 Jan. 1999, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Laboratorium sains. Ekstraksi DNA pisang ”oleh Manolacamboni - karya sendiri (CC oleh 4.0) Via Commons Wikimedia
2. “Gambar 17 01 02” oleh CNX OpenStax -(CC oleh 4.0) Via Commons Wikimedia