Perbedaan antara VNTR dan STR

Perbedaan antara VNTR dan STR

Perbedaan utama - VNTR vs STR
 

Studi DNA memiliki kegunaan yang sangat besar dalam memahami dan menentukan hubungan filogenetik, mendiagnosis penyakit genetik dan memetakan genom organisme. Beberapa teknik yang terkait dengan analisis DNA digunakan untuk identifikasi gen tertentu atau urutan DNA dalam kumpulan DNA yang tidak diketahui. Mereka dikenal sebagai penanda genetik. Penanda genetik digunakan dalam biologi molekuler untuk mengidentifikasi variasi genetik antara individu dan spesies. Variabel Nomor Tandem Repeat (VNTR) dan Short Tandem Repeat (STR) adalah dua jenis penanda genetik yang menunjukkan polimorfisme di antara individu. Kedua tipe adalah DNA berulang yang nonkode yang merupakan pengulangan tandem. Mereka diatur dengan cara kepala -ke -ekor dengan kromosom. VNTR adalah bagian dari genom di mana urutan nukleotida pendek diulang beberapa kali. STR adalah bagian lain dari DNA dalam genom yang diatur sebagai unit berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas nukleotida dalam seratus kali. Perbedaan utama antara VNTR dan STR adalah jumlah nukleotida dalam urutan berulang. Unit berulang VNTR terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida sementara unit berulang STR terdiri dari 2 hingga 13 nukleotida. VNTR dan STR digunakan secara luas dalam studi forensik.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu vntr 
3. Apa itu str
4. Kesamaan antara VNTR dan STR
5. Perbandingan berdampingan - VNTR vs STR dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu vntr?

Pengulangan tandem adalah urutan singkat DNA yang diulangi di head to tail fashion di lokus kromosom tertentu. Tidak ada urutan atau nukleotida lain dalam pengulangan tandem. Ada beberapa jenis pengulangan tandem dalam genom. VNTR adalah jenis pengulangan tandem di antara mereka yang memiliki unit berulang yang terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida. VNTR adalah jenis miniSatellite. Pengulangan tandem ini dapat ditemukan di banyak kromosom. Mereka diselingi dalam genom manusia dan terletak terutama di daerah subtelomerik kromosom.

 VNTRS menunjukkan polimorfisme berulang tandem di antara individu. Panjang VNTR di lokasi tertentu kromosom sangat bervariasi di antara individu karena variasi dalam jumlah unit berulang yang diatur dalam bagian DNA tersebut. Oleh karena itu, VNTR dapat digunakan sebagai alat yang kuat dalam identifikasi individu dan analisis VNTR digunakan di banyak bidang termasuk genetika, penelitian biologi, forensik dan pencetakan jari DNA. VNTRS adalah penanda genetik pertama yang digunakan untuk mengukur engraftment transplantasi sumsum tulang.  VNTR juga merupakan penanda polimorfik pertama yang digunakan dalam profil DNA dalam forensik.

Gambar 01: Variasi VNTR pada enam orang

Analisis VNTR dilakukan melalui pembatasan fragmen panjang polimorfisme diikuti oleh hibridisasi selatan. Oleh karena itu, diperlukan sampel DNA yang relatif besar. Interpretasi profil vntr juga bermasalah. Karena keterbatasan ini, penggunaan VNTR dalam genetika forensik telah terbatas dan digantikan oleh analisis STR.

Apa itu str?

STR adalah bagian DNA yang sangat berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas unit pengulangan nukleotida yang diselenggarakan dengan cara tandem. STR mirip dengan VNTR. Tetapi bervariasi dari VNTR dari jumlah nukleotida dalam urutan berulang dan jumlah pengulangan. STR adalah jenis mikrosatelit.

Analisis STR yang terlibat dalam mengukur jumlah pasti unit berulang. STR sangat bervariasi di antara individu, mirip dengan VNT. Profil STR berbeda dari orang ke orang. Oleh karena itu, analisis STR digunakan dalam biologi molekuler untuk membandingkan lokus spesifik pada DNA dari dua atau lebih sampel. Oleh karena itu STR dianggap sebagai penanda genetik yang kuat dalam biologi molekuler. Ini menyediakan alat yang sangat baik untuk identifikasi individu karena tingkat polimorfisme yang tinggi dan panjang yang relatif pendek.

Saat ini, STR adalah alat polimorfisme genetik yang paling umum dianalisis dalam genetika forensik. Sebagian besar pekerjaan santai forensik melibatkan analisis polimorfik STR. Lokus stres tersebar di seluruh genom. Ada ribuan STR yang terletak di kromosom yang dapat digunakan dalam analisis forensik. Analisis STR tidak melibatkan polimorfisme panjang pembatasan seperti analisis VNTR. Analisis STR tidak memotong DNA dengan enzim pembatasan. Probe spesifik digunakan untuk memasang daerah yang diinginkan pada DNA dan menggunakan teknik PCR, panjang STR ditentukan.

Gambar 02: Variasi STR antara sampel

Apa kesamaan antara vntr dan str?

  • VNTR dan STR adalah DNA nonkode.
  • Keduanya adalah pengulangan tandem.
  • Keduanya menunjukkan polimorfisme di antara individu karena perbedaan panjang bagian DNA.
  • Keduanya digunakan sebagai penanda genetik yang kuat dalam pencetakan jari DNA dan dalam studi forensik.

Apa perbedaan antara VNTR dan STR?

Vntr vs str

VNTR adalah DNA berulang nonkode yang memiliki urutan nukleotida pendek yang diulangi dengan cara tandem. STR adalah bagian DNA yang sangat berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas unit pengulangan nukleotida yang diselenggarakan dengan cara tandem.
Ukuran
VNTRS lebih besar dari STR. STR lebih kecil dari VNTR.
Jumlah nukleotida dalam urutan berulang
Unit berulang VNTR terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida. Unit pengulangan STR terdiri dari 2 hingga 13 nukleotida.

Ringkasan - VNTR VS STR

VNTR dan STR adalah dua penanda genetik yang kuat yang digunakan dalam biologi molekuler, terutama di bidang genetika forensik. VNTR adalah jenis miniSatellite dan STR adalah microsatellite. VNTR dan STR adalah nonkode, DNA yang sangat berulang. Mereka adalah pengulangan tandem. Struktur umum VNTR dan STR adalah sama. Namun, jumlah nukleotida dalam urutan berulang dan panjangnya berbeda. VNTR memiliki urutan berulang terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida. STR memiliki urutan berulang yang terdiri dari 2 hingga 13 nukleotida. Inilah perbedaan antara VNTR dan STR.

Unduh Versi PDF dari VNTR VS Str

Anda dapat mengunduh versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi pdf di sini perbedaan antara VNTR dan STR.

Referensi:

1. “Ilmu genetika forensik.CRG - Dewan untuk Genetika yang Bertanggung Jawab. N.P., N.D. Web. Tersedia disini. 10 Juli 2017.
2. “Analisis STR.”Wikipedia. Wikimedia Foundation, 22 Mar. 2017. Web. Tersedia disini. 10 Juli 2017.

Gambar milik:

1. "D1S80DEMO" oleh Palewhalegail di Inggris Wikipedia (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia