Apa perbedaan antara DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi

Itu perbedaan utama Antara DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi adalah bahwa DNA bebas sel adalah berbagai bentuk DNA yang secara bebas beredar dalam darah sementara sirkulasi DNA tumor adalah DNA turunan tumor terfragmentasi yang bersirkulasi dalam darah.

DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi adalah dua jenis asam nukleat yang bersirkulasi. Asam nukleat yang bersirkulasi ditemukan oleh mandel dan logam pada tahun 1948. Kemudian, ditemukan bahwa jumlah asam nukleat yang bersirkulasi pada pasien yang sakit secara signifikan tinggi. Penemuan ini pertama kali dilakukan sehubungan dengan pasien lupus. Selain itu, asam nukleat yang bersirkulasi memiliki nilai prognostik yang lebih tinggi dan dapat digunakan sebagai biomarker untuk mendeteksi berbagai penyakit.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu DNA bebas sel 
3. Apa DNA tumor yang beredar
4. Kesamaan -DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi
4. DNA bebas sel vs DNA tumor sirkulasi dalam bentuk tabel
5. Ringkasan -DNA bebas sel vs DNA tumor yang bersirkulasi

Apa itu DNA bebas sel?

DNA bebas sel (CF DNA) mengacu pada berbagai bentuk DNA seperti sirkulasi DNA tumor, DNA mitokondria bebas sel, dan DNA janin bebas sel, dll., yang secara bebas beredar dalam darah. Peningkatan kadar DNA bebas sel diamati pada penyakit lanjut seperti kanker, trauma, sepsis, infark miokard, diabetes, stroke, penyakit sel sabit, dll. Selain kanker dan pengobatan janin, DNA bebas sel adalah biomarker yang berguna untuk banyak penyakit. DNA ini dapat digunakan untuk mendeteksi penolakan cangkok transplantasi juga. Mereka juga digunakan dalam menentukan stres biasa, penegasan seks prenatal, dan dalam pengujian ayah.

Gambar 01: DNA bebas sel

DNA bebas sel biasanya merupakan molekul ekstraseluler untai ganda dari DNA. Ini terdiri dari fragmen kecil (50 hingga 200 bp) dan fragmen yang lebih besar (21 kb). Selain itu, telah diakui sebagai biomarker yang dapat diandalkan untuk diagnosis kanker prostat dan payudara. DNA bebas sel terutama beredar dalam aliran darah sebagai nukleosom.  Nukleosom adalah kompleks nuklir histone dan DNA. CF DNA dapat dikuantifikasi menggunakan berbagai teknik seperti PCR, sekuensing paralel yang besar, spektrometri ultraviolet, pewarnaan picogreen, dan ELISA. Karena deteksi DNA CF dalam aliran darah adalah metode yang cepat, mudah, tidak invasif, berulang, di masa depan, itu akan menjadi biomarker potensial untuk mendiagnosis banyak penyakit seperti penyakit rematik autoimun dan tumor.

Apa DNA tumor yang beredar?

DNA tumor yang bersirkulasi (CT DNA) adalah DNA turunan tumor terfragmentasi yang bersirkulasi dalam darah. Itu memiliki asal tumor. Karena tumor yang bersirkulasi dapat mencerminkan seluruh genom tumor, ia telah mendapatkan ketertarikan yang luas untuk utilitas potensial dalam pengaturan klinis. Biopsi cair, yang mengambil darah, dapat digunakan untuk menguji tumor yang bersirkulasi.

Gambar 02: DNA tumor yang bersirkulasi

Proses biologis yang kemungkinan terlibat dalam melepaskan DNA CT termasuk apoptosis dan nekrosis dari sel yang sekarat atau pelepasan aktif dari sel tumor. Dalam jaringan yang sehat, infiltrasi fagosit dapat membersihkan DNA CT. Selain itu, berbagai teknik dapat digunakan dalam menganalisis DNA tumor yang bersirkulasi seperti PCR digital tetesan, berseri-seri, Capp-seq (sekuensing dalam), sekuensing aman, dan sekuensing dupleks.

Apa kesamaan antara DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi?

• DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi adalah dua jenis asam nukleat yang bersirkulasi.
• Mereka terdiri dari nukleotida.
• Kedua jenis dapat digunakan sebagai penanda potensial untuk mendiagnosis berbagai penyakit dalam pengaturan klinis.
• Mereka ditemukan dalam aliran darah.
• Keduanya adalah bentuk ekstraseluler dari molekul DNA.
• Mereka berdua dibersihkan dengan infiltrasi fagosit.

Apa perbedaan antara DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi?

DNA bebas sel adalah berbagai bentuk DNA seperti sirkulasi DNA tumor, DNA mitokondria bebas sel dan DNA janin bebas sel, dll., yang secara bebas bersirkulasi dalam darah, sementara sirkulasi DNA tumor adalah DNA turunan tumor terfragmentasi yang bersirkulasi dalam darah. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi. Selanjutnya, DNA bebas sel bersirkulasi dalam fragmen mulai dari 50-220 bp saat bersirkulasi DNA tumor bersirkulasi dalam fragmen mulai dari 134-144 bp.

Infografis berikut menyajikan perbedaan antara DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -DNA bebas sel vs DNA tumor yang bersirkulasi

Asam nukleat yang bersirkulasi dilemparkan ke dalam aliran darah melalui mekanisme yang diatur atau kebetulan. DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi adalah dua jenis asam nukleat yang bersirkulasi. DNA bebas sel adalah berbagai bentuk DNA seperti sirkulasi DNA tumor, DNA mitokondria bebas sel, DNA janin bebas sel yang secara bebas bersirkulasi dalam darah sementara DNA tumor yang bersirkulasi adalah DNA tumor yang terfragmentasi yang bersirkulasi dalam darah. Dengan demikian, ini merangkum perbedaan antara DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi.

Referensi:

1. Suraj, Shankar, dkk. “Sirkulasi Asam Nukleat: Analisis Kejadiannya dalam Keganaan."Laporan Biomedis, D.A. Spandidos, Jan. 2017.
2. “Apa yang beredar DNA tumor dan bagaimana ini digunakan untuk mendiagnosis dan mengelola kanker?”Medlineplus, u.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional, 28 Juli 2021.

Gambar milik:

1. “DNA yang diturunkan donor bebas sel” oleh NIH Image Gallery (CC BY-NC 2.0) Via Flickr
2. "CtDNA dalam sirkulasi" oleh Racheljunewong - karya sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia