Apa perbedaan antara SF1 dan SF2

Itu perbedaan utama Antara SF1 dan SF2 adalah kemampuan mereka untuk melepaskan asam nukleat. Sementara SF1 hanya melepaskan DNA, SF2 melepaskan DNA dan RNA.

Helicase adalah salah satu enzim kunci yang mengambil bagian dalam proses replikasi DNA serta dalam proses perbaikan DNA. Peran utama helikase adalah mengambil bagian dalam proses pelepasan untuk memfasilitasi pemisahan molekul DNA untai ganda. Aktivitas enzim sangat penting selama fase inisiasi replikasi DNA. Helikas dibagi sebagai Sever Family 1 Dan Sever Family 2 terutama berdasarkan perbedaan struktural mereka. Di dalam setiap keluarga super, ada lebih banyak jenis helikase.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu SF1  
3. Apa itu SF2
4. Kesamaan -SF1 dan SF2
5. SF1 vs SF2 dalam bentuk tabel
6. Ringkasan -SF1 vs SF2

Apa itu SF1?

Super Family 1 Helicase adalah jenis helikase yang terdiri dari struktur heksamerik di samping protein inti internal, yang menggambarkan aktivitas helikase. SF1 Helicase adalah salah satu kelas helicase terbesar dan dapat dikategorikan lebih lanjut sebagai SF1A Helicases dan SF1B Helicases. Protein seperti PCRA, Rep dan UVRD, termasuk dalam kelas helikas SF1A. Sebagai perbandingan, protein seperti RecA dan DDA termasuk dalam kelas helikase SF1B. Fungsi helikas SF1 sangat bervariasi. Beberapa fungsi vital helikase SF1 termasuk replikasi DNA, rekombinasi DNA, pemrosesan fragmen Okazaki, pembentukan telomer, dan perbaikan eksisi nukleotida kerusakan DNA. Pada beberapa spesies bakteri, jenis helikase SF1 juga mengambil bagian dalam membantu transfer gen horizontal melalui konjugasi. Selain itu, dalam virus, helikase SF1 membantu replikasi virus.

Gambar 01: Aksi Helicase

Ada banyak motif berbeda yang terkait dengan struktur helikas SF1. Mereka mengandung setidaknya 7 motif yang dilestarikan di antara semua jenis helikase SF1 yang berbeda (Q, I, IA, II, III, IV, V, dan VI). Struktur SF1 helicase adalah kristal, di mana motif dikelompokkan bersama. Ada saku pengikat ATP yang khas antara motif dan situs pengikatan DNA. Domain yang tidak dilestarikan didistribusikan untuk mempertahankan integritas struktural molekul helikase. Domain ini dapat bervariasi antara helikase SF1A dan helikas SF1B.

Apa itu SF2?

Super Family 2 Helicase adalah salah satu kelompok superfamili helicase yang paling beragam. Ada banyak jenis helikase SF2 seperti helikase seperti RECQ, RECG - seperti helikas, rad3/xpd dan ns3 helikas. Beberapa enzim pembatasan, seperti enzim pembatasan tipe I, juga termasuk dalam kategori ini. Fungsi umum helikas SF2 adalah pelepasan DNA untai ganda. Namun, beberapa jenis helikase SF2 tidak memiliki kemampuan untuk sepenuhnya bertindak sebagai enzim helikase. Helikase SF2 juga banyak digunakan dalam pemrosesan RNA. Keluarga kotak mati helikas SF2 mengambil bagian dalam pemrosesan RNA, termasuk transkripsi, splicing, pemrosesan terjemahan dan perakitan kompleks RNA-protein.

Gambar 02: Helicase

Struktur helicase SF2 juga mengandung motif yang dilestarikan. Namun, beberapa domain sedikit berbeda dari helicase SF1. Mereka juga mengandung domain pengikat ATP selain dari domain pengikat DNA.

Apa kesamaan antara SF1 dan SF2?

• SF1 dan SF2 menunjukkan aktivitas helicase.
• Selain itu, keduanya mengambil bagian dalam replikasi dan rekombinasi DNA.
• SF1 dan SF2 terdiri dari motif yang dilestarikan.
• Keduanya memiliki domain pengikat ATP dan domain pengikat DNA.
• Bentuk-bentuk ini adalah protein multi-domain.
• Selain itu, jika mutasi terjadi di kedua jenis, itu akan menghasilkan efek yang merusak.
• Baik SF1 dan SF2 sangat penting untuk memastikan kesinambungan siklus sel.
• SF1 dan SF2 ditemukan dalam prokariota dan juga dalam eukariota.

Apa perbedaan antara SF1 dan SF2?

SF1 dan SF2 adalah dua keluarga super helicase. Mereka menunjukkan keragaman yang luas. Perbedaan utama antara SF1 dan SF2 adalah bahwa SF1 terutama terlibat dalam pelepasan DNA, sedangkan SF2 juga mengambil bagian dalam pemrosesan RNA selama transkripsi dan terjemahan. Saat membandingkan motif protein yang berbeda, SF1 dan SF2 terutama berbeda berdasarkan motif III dan motif IV. Meskipun mereka memiliki kesamaan struktural, helikase SF1 membentuk struktur heksamerik toroidal sementara SF2 tidak membentuk pengaturan struktural ini.

Perbedaan lain antara SF1 dan SF2 adalah bahwa helikase SF1 lebih memilih nukleotida adenin lebih banyak, sedangkan helikase SF2 lebih suka kelima nukleotida untuk ditargetkan untuk melepaskan diri. Saat membandingkan arah yang melepas, helikas SF1 hanya mentranslokasi dalam arah 5 'hingga 3', sedangkan helikase SF2 memiliki kemampuan untuk mentranslokasi bersama dengan asam nukleat di kedua arah kedua arah.

Infografis di bawah ini menyajikan perbedaan antara SF1 dan SF2 dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -SF1 vs SF2

Helicases adalah kelompok enzim yang sangat penting dan beragam yang mengambil bagian dalam replikasi DNA. Namun, karena keanekaragamannya yang tinggi, enzim dikategorikan ke dalam superfamili. SF1 dan SF2 adalah dua keluarga super helikas terbesar. Sementara SF1 terutama terkait dengan pemrosesan yang terkait dengan DNA, SF2 dikaitkan dengan pemrosesan DNA dan RNA. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara SF1 dan SF2. Selain itu, SF1 dan SF2 juga berbeda dalam pengaturan struktural mereka karena SF2 tidak membentuk struktur heksamerik. Mutasi pada helikase SF1 dan SF2 akan menyebabkan perkembangan kanker setelah disregulasi siklus sel dan mekanisme vital lainnya seperti perbaikan DNA.

Referensi:

1. Fairman-Williams, Margaret E, dkk. “SF1 dan SF2 Helicases: Family Matters."Pendapat saat ini dalam biologi struktural, u.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional, Juni 2010.
2. Raney, Kevin D, dkk. “Struktur dan mekanisme helikas SF1 DNA.“Kemajuan dalam Kedokteran Eksperimental dan Biologi, U.S. National Library of Medicine, 2013.

Gambar milik:

1. “Replikasi DNA EN” oleh Ladyofhats Mariana Ruiz - Karya Sendiri (Teks Asli: Karya Sendiri. Gambar yang diganti namanya dari file: replikasi DNA.svg) (domain publik) melalui commons wikimedia
2. "4M4W" oleh Liu, b., Eliason, w.K., Steitz, t.A.; Visualisasi Penulis: Pengguna: Astrojan - RCSB (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia