Perbedaan antara perbaikan eksisi dasar dan perbaikan eksisi nukleotida
Perbedaan Utama - Perbaikan Eksisi Basis vs Perbaikan Eksisi Nukleotida
DNA sering mengalami kerusakan karena berbagai faktor internal dan eksternal. Namun sistem perbaikan seluler segera dan terus -menerus memperbaiki kerusakan sebelum menjadi mutasi atau sebelum ditransfer ke generasi berikutnya. Ada tiga jenis sistem perbaikan eksisi dalam sel: perbaikan eksisi nukleotida (NER), perbaikan eksisi dasar (BER), dan perbaikan ketidakcocokan DNA (MMR) untuk memperbaiki kerusakan DNA untai tunggal. Perbedaan utama antara perbaikan eksisi basa dan perbaikan eksisi nukleotida adalah bahwa Perbaikan Eksisi Dasar adalah sistem perbaikan sederhana yang bekerja dalam sel untuk memperbaiki kerusakan nukleotida tunggal yang disebabkan secara endogen ketika Perbaikan eksisi nukleotida adalah sistem perbaikan kompleks yang bekerja dalam sel untuk memperbaiki daerah yang relatif lebih besar dan rusak disebabkan secara eksogen.
ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu perbaikan eksisi dasar
3. Apa itu perbaikan eksisi nukleotida
4. Perbandingan Berdampingan - Perbaikan Eksisi Dasar vs Perbaikan Eksisi Nukleotida
5. Ringkasan
Apa itu perbaikan eksisi dasar?
Perbaikan Eksisi Dasar adalah versi paling sederhana dari sistem perbaikan DNA yang dimiliki sel. Ini digunakan untuk memperbaiki kerusakan kecil dalam DNA. Basis DNA dimodifikasi karena deaminasi atau alkilasi. Ketika ada kerusakan dasar, DNA glikosilase mengenali dan mengaktifkan sistem perbaikan eksisi dasar dan memulihkannya dengan bantuan enzim AP endonuklease, DNA polimerase, dan DNA ligase. Langkah -langkah berikut terlibat dalam sistem BER.
- Pengakuan dan Penghapusan Basis yang salah atau rusak oleh DNA glikosilase untuk membuat situs abasic (situs kehilangan dasar -Apiurinic atau apirimidinic situs).
- Sayatan situs abasic oleh endonuklease apurinic/apyrimidinic
- Penghapusan fragmen gula yang tersisa oleh lyase atau fosfodiesterase
- Pengisian celah oleh DNA polimerase
- Penyegelan nick oleh ligase DNA
Gambar 01: Jalur perbaikan eksisi dasar
Apa itu perbaikan eksisi nukleotida?
Perbaikan Eksisi Nukleotida (NER) adalah sistem perbaikan eksisi DNA yang penting dalam sel. Itu mampu memperbaiki dan mengganti daerah yang rusak hingga 30 pangkalan dan diarahkan oleh untai templat yang tidak rusak. Kerusakan DNA umum terjadi karena radiasi ultraviolet dan NER melindungi DNA dengan memperbaiki kerusakan tersebut segera sebelum menjadi mutasi dan masuk ke generasi mendatang atau menyebabkan penyakit. NER secara khusus memberikan perlindungan terhadap mutasi yang disebabkan secara tidak langsung oleh faktor -faktor eksogen seperti karsinogen lingkungan dan kimia. Ner terlihat di hampir semua organisme, dan mengakui kerusakan yang menyebabkan distorsi signifikan dalam heliks DNA.
Proses NER melibatkan aksi banyak protein seperti XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, dll. dan hasilnya melalui beberapa mekanisme pemotongan dan pasta. Protein -protein tersebut sangat penting untuk penyelesaian proses perbaikan, dan cacat pada salah satu protein NER sangat penting dan dapat menyebabkan sindrom resesif yang langka: Xeroderma pigmentosum (XP), Sindrom Cockayne (CS) dan bentuk fotosensitif dari gangguan rambut rapuh, Trichothiodystrophy (TTD).
Gambar 02: Perbaikan Eksisi Nukleotida
Apa perbedaan antara perbaikan eksisi dasar dan perbaikan eksisi nukleotida?
Perbaikan Eksisi Dasar vs Perbaikan Eksisi Nukleotida | |
| Perbaikan Eksisi Dasar (BER) adalah sistem perbaikan DNA yang terjadi dalam sel. | Perbaikan Eksisi Nukleotida (NER) adalah jenis lain dari sistem perbaikan DNA yang ditemukan dalam sel. |
| Mengenali adduksi DNA | |
| BER perbaikan kerusakan pada aduk DNA kecil. | Perbaikan ner adduct DNA besar. |
| Kerusakan DNA | |
| BER Mengenali kerusakan yang tidak menyebabkan distorsi signifikan pada heliks DNA. | Ner mengenali kerusakan yang menyebabkan distorsi signifikan pada heliks DNA. |
| Penyebab kerusakan DNA | |
| BER memperbaiki kerusakan yang disebabkan oleh mutagen endogen. | Ner perbaikan kerusakan yang disebabkan oleh mutagen eksogen. |
| Kompleksitas | |
| BER adalah sistem perbaikan paling tidak kompleks | Itu lebih kompleks dari BER. |
| Perlu protein | |
| BER tidak memerlukan protein lain. | Ner membutuhkan beberapa produk gen, terutama protein, untuk membedakan daerah yang rusak dan tidak rusak. |
| Kesesuaian | |
| BER cocok untuk mengoreksi kerusakan pangkalan tunggal. | Ner cocok untuk mengganti daerah yang rusak. |
Ringkasan -Perbaikan Eksisi Dasar vs Perbaikan Eksisi Nukleotida
NER dan BER adalah dua jenis proses perbaikan eksisi DNA yang ditemukan dalam sel. BER mampu memperbaiki kerusakan kecil yang disebabkan secara endogen sementara NER mampu memperbaiki daerah kerusakan hingga 30 panjang pasangan basa yang sebagian besar disebabkan oleh eksogen. BER berbeda dari NER di substrat jenis yang diakui dan dalam acara pembelahan awal. BER juga dapat mengenali kerusakan yang tidak disebabkan oleh distorsi yang signifikan dalam heliks DNA sementara NER mengenali distorsi yang signifikan dari heliks DNA. Inilah perbedaan antara perbaikan eksisi dasar dan eksisi nukleotida.
Gambar milik:
1. “DNA Repair Base Excersion EN” oleh Ladyofhats - (domain publik) via Commons Wikimedia
2. “Representasi skematis dari model untuk jalur perbaikan eksisi nukleotida yang dikendalikan oleh protein UVR” oleh Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakissu, Kenji Fukui, Noriko Norkau, Noriko Norkau, Noriko Norkau, Noriko Norkau, Noriko Norkau, Noriko Noriko Noriko, Noriko Norkau, Noriko Noriko Noriko, Noriko Norkau, Noriko Noriko, Noriko Noriko Muka CC oleh 1.0) Via Commons Wikimedia
Referensi:
1. Kim, Yun-Jeong, dan David M. Wilson. “Tinjauan Biokimia Perbaikan Eksisi Dasar.Farmakologi molekuler saat ini. U.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional, Jan. 2012. Web. 14 Mar. 2017.
2. Boer, Jan de, dan Jan H.J. Hoeijmakers. “Perbaikan eksisi nukleotida dan sindrom manusia.”Karsinogenesis. Oxford University Press, 01 Mar. 2000. Web. 28 Mar. 2017
3. Hoogstraten et al. “Deteksi kerusakan DNA serbaguna oleh genom global protein perbaikan eksisi nukleotida XPC.”Jurnal Ilmu Sel. Perusahaan Biologi Ltd, 01 September. 2008. Web. 28 Mar. 2017
