Perbedaan antara CRISPR dan CRISPR Cas9

Itu perbedaan utama Antara Crispr dan Crispr Cas9 adalah itu CRISPR (dikelompokkan secara teratur mengepalai pengulangan palindromik pendek) adalah mekanisme pertahanan kekebalan prokariotik yang terjadi secara alami sementara CRISPR Cas9 adalah nuclease Cas9 yang dipandu RNA yang merupakan bagian dari sistem kekebalan adaptif CRISPR Adaptif.

CRISPR adalah sistem kekebalan pertahanan antivirus yang ditemukan pada bakteri dan archaea. Ini adalah keluarga sekuens DNA yang ditemukan dalam genom bakteri. Ini terdiri dari sekuens spacer yang berasal dari fragmen DNA bakteriofag yang sebelumnya menginfeksi mereka. Pada infeksi virus berikutnya, bakteri menggunakan urutan ini untuk menghancurkan DNA virus. Urutan CRISPR memiliki pengulangan palindromik pendek dan sekuens spacer. Selain itu, urutan spacer pengulangan CRISPR sering memiliki gen terkait yang kode untuk protein CAS. Cas9 adalah endonuklease yang dipandu RNA. Bersama dengan urutan CRISPR, protein Cas9 bertindak sebagai sistem kekebalan adaptif pada bakteri terhadap bakteriofag.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu CRISPR 
3. Apa itu CRISPR Cas9
4. Kesamaan antara CRISPR dan CRISPR Cas9
5. Perbandingan berdampingan - CRISPR vs CRISPR Cas9 dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu CRISPR?

Crispr berarti Clustered secara teratur mengulangi pengulangan palindromik pendek. Ini adalah sekelompok sekuens DNA yang ditemukan dalam genom bakteri. Ini bekerja sebagai mekanisme pertahanan alami pada bakteri, dan pertama kali diidentifikasi E. coli. Pada bakteri, ia bertindak sebagai perlindungan kekebalan adaptif, terutama terhadap bakteriofag. Oleh karena itu, ini adalah mekanisme spesifik urutan.

Gambar 01: CRISPR

Sistem CRISPR berisi beberapa urutan pengulangan DNA pendek. Pengulangan ini bersifat palindromik, memiliki urutan dasar yang sama saat membaca dari 5 'hingga 3' sementara yang lain memberikan urutan yang sama saat membaca dari 3 'hingga 5'.  Selain itu, pengulangan identik. Mereka terletak di antara urutan DNA "spacer" pendek yang tidak identik. Tetapi sekuens DNA spacer ini serupa atau cocok dengan DNA bakteriofag asing. Gen yang terkait dengan CRISPR dikenal sebagai gen terkait CRISPR atau gen CAS. Kode Gen CAS untuk protein CAS yang merupakan helikase atau nuklease. Helicases melepaskan DNA sementara nuklease memotong DNA. Secara keseluruhan, ketika mempertimbangkan CRISPR, itu adalah sistem kekebalan bakteri yang bekerja melawan bakteriofag (bakteri yang menginfeksi virus).

Apa itu CRISPR Cas9?

Cas9 atau CRISPR terkait protein 9 adalah endonuklease yang dipandu RNA bakteri. Oleh karena itu, ini adalah enzim yang mengenali dan memotong DNA target (terutama DNA bakteriofag) yang saling melengkapi dengan panduan RNA. Ini melakukan pembelahan spesifik untai. Protein Cas9 dikodekan oleh gen terkait CRISPR. CRISPR Cas9 adalah sistem nuclease CRISPR-CAS9 yang dipandu RNA yang dapat digunakan sebagai platform penargetan dan pengeditan DNA yang dapat diprogram RNA untuk pengeditan genom, gangguan transkripsional, modulasi epigenetik, dan pencitraan genom. Sistem CRISPR Cas9 ini sangat populer dalam sistem pengeditan genom saat ini.

Gambar 02: CRISPR Cas9

Saat ini, sistem CRISPR/CAS9 digunakan untuk mengubah atau memodifikasi genom mamalia dengan represi transkripsi atau aktivasi. Sel -sel mamalia dapat merespons istirahat DNA yang dimediasi CRISPR/CAS9 dengan mengadopsi mekanisme perbaikan. Ini dapat dilakukan dengan menggunakan metode gabungan akhir non-homolog (NHEJ) atau perbaikan yang diarahkan homologi (HDR). Kedua mekanisme perbaikan ini terjadi dengan memperkenalkan istirahat untai ganda. Ini menghasilkan pengeditan gen mamalia. NHEJ dapat menyebabkan ablasi mutasi gen dan dapat digunakan untuk menciptakan hilangnya efek fungsi. HDR dapat digunakan untuk memperkenalkan mutasi titik tertentu atau memperkenalkan segmen DNA dengan panjang yang bervariasi. Saat ini, sistem CRISPR/ CAS digunakan di bidang aplikasi terapeutik, biomedis, pertanian dan penelitian.

Apa kesamaan antara CRISPR dan CRISPR Cas9?

• Cas9 adalah bagian dari sistem CRISPR CAS.
• Sistem CRISPER CAS9 adalah sistem kekebalan tubuh yang ditemukan secara alami pada bakteri.

Apa perbedaan antara CRISPR dan CRISPR Cas9?

CRISPR adalah sekelompok sekuens DNA yang ditemukan dalam genom bakteri yang berfungsi sebagai sistem pertahanan alami terhadap bakteriofag. Ini terdiri dari pengulangan palindromik pendek yang dipotong secara teratur, spacer dan gen terkait. Sebaliknya, Cas9 adalah protein terkait CRISPR 9, yang merupakan enzim endonuklease berpemandu RNA. Itu mengenali dan memotong untaian ganda DNA virus. Faktanya, ini adalah bagian dari sistem pertahanan CRISPR. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara CRISPR dan CRISPR Cas9.

Ringkasan -CRISPR vs CRISPR Cas9

Sistem CRISPR CAS adalah sistem pertahanan mikroba. CRISPR adalah sekelompok urutan DNA yang terdiri dari pengulangan pendek palindromik, sekuens spacer dan gen terkait. Cas9 adalah salah satu protein CAS yang merupakan endonuklease berpemandu RNA. Protein CRISPR dan CAS9 membuat sistem kekebalan tubuh yang bekerja melawan infeksi bakteriofag pada bakteri. Protein Cas9 mampu memecah DNA virus asing dan mengganggu mereka. CRRNA memandu Cas9 untuk mengenali DNA virus. Oleh karena itu, sistem CRISPR Cas9 adalah sistem kekebalan tubuh alami yang ditemukan pada bakteri terhadap virus. Dengan demikian, ini adalah ringkasan perbedaan antara CRISPR dan CRISPR CAS9.

Referensi:

1. Jiang, Fuguo. “Struktur dan mekanisme CRISPR-CAS9." Ulasan Tahunan, Tersedia disini.

Gambar milik:

1. “4qyz.”Oleh Boghog - Karya Sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia
2. “GRNA-CAS9” 'oleh Marius Walter-karya sendiri (CC BY-SA 4.0) Via Commons Wikimedia