Perbedaan antara exome dan transkriptome

Perbedaan utama - transkriptome exome vs
 

Gen yang berisi daerah pengkodean dan non-coding di dalamnya. Urutan pengkodean dikenal sebagai ekson, dan urutan non-coding dikenal sebagai intron.  Urutan nukleotida dari ekson gen mewakili kode genetik gen untuk mensintesis protein spesifik. Oleh karena itu, ekson tetap dalam molekul mRNA. Total wilayah ekson genom dikenal sebagai exome, dan merupakan bagian penting dari genom. Kode genetik gen dikonversi menjadi kode genetik molekul mRNA, yang diperlukan untuk produksi protein. Seluruh molekul mRNA ditranskripsi dalam sel atau populasi sel pada suatu waktu dikenal sebagai transkriptome. Perbedaan utama antara exome dan transkriptome adalah itu Exome mewakili urutan daerah ekson genom ketika Transkriptom mewakili total mRNA sel atau jaringan pada waktu tertentu.

ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu exome
3. Apa itu transkriptome
4. Perbandingan berdampingan - transkriptome exome vs
5. Ringkasan

Apa itu exome?

Gen terdiri dari ekson, intron dan urutan pengaturan. Ekson adalah daerah gen yang ditranskripsi ke dalam urutan mRNA selama transkripsi. Intron dan daerah non-coding lainnya dihapus selama transkripsi. Urutan nukleotida ekson menentukan kode genetik gen yang mensintesis protein spesifiknya kode. Hanya ekson yang tersisa dalam mRNA protein. Koleksi ekson dalam genom dikenal sebagai exome dari suatu organisme. Itu mewakili bagian dari genom yang diekspresikan dalam gen. Pada manusia, exome menyumbang 1% dari genom. Ini adalah bagian pengkode protein dari genom manusia.

Gambar 01: Exome

Apa itu transkriptome?

Transkriptom adalah kumpulan semua transkrip pengkode protein dan non-coding (RNA) dalam jaringan yang diberikan. Transkriptom mewakili kumpulan molekul mRNA total yang diekspresikan oleh gen dalam sel atau jaringan. Transkriptom sel dapat bervariasi dengan transkriptome jenis sel lain. Transkriptom juga dinamis - berubah seiring waktu sebagai respons terhadap rangsangan internal dan eksternal. Bahkan dalam jaringan yang sama atau dalam jenis sel yang sama, transkriptome dapat berubah setelah beberapa menit.

Transkriptome berbeda dari exome suatu organisme. Transkriptome hanya mencakup urutan exome yang diekspresikan. Meskipun exome sel tetap sama, transkriptom berbeda di antara sel karena ekspresi gen tidak sama untuk semua sel atau jaringan. Hanya gen penting yang diekspresikan dalam sel dan jaringan yang berbeda. Ekspresi gen adalah proses spesifik jaringan atau tipe sel. Itu diatur oleh berbagai faktor termasuk faktor lingkungan. Oleh karena itu, transkriptome dapat bervariasi dengan kondisi lingkungan eksternal.

Transkriptome digunakan sebagai prekursor untuk studi proteomik. Semua protein berasal dari urutan mRNA. Modifikasi translasi dapat mengakibatkan perubahan protein. Namun, transkriptome memberikan informasi dasar penting untuk studi proteomik.

Gambar 02: Transkriptom sel induk embrionik

Apa perbedaan antara exome dan transkriptome?

Ringkasan -transkriptome exome vs

Ekson adalah urutan pengkodean gen dan menentukan urutan mRNA dari protein. Kumpulan urutan pengkodean ini (ekson) dikenal sebagai exome dari suatu organisme. Gen ditranskripsikan ke dalam molekul mRNA sebelum membuat protein. Total molekul mRNA sel atau jaringan pada waktu tertentu dikenal sebagai transkriptome. Transkriptom mewakili gen yang secara aktif diekspresikan ke dalam mRNA pada waktu tertentu. Transkriptome adalah sel dan jaringan spesifik dan mempengaruhi dengan kondisi lingkungan. Inilah perbedaan antara exome dan transkriptome.

Referensi:
1.Sarah et al, “Penangkapan yang ditargetkan dan sekuensing paralel yang sangat paralel dari dua belas eksom manusia." Alam. U.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional, 10 September. 2009. Web. 01 Apr. 2017
2.Mutz et al. “Analisis transkriptome menggunakan sekuensing generasi berikutnya.”Elsevier: Locator Artikel. N.P., September. 2012. Web. 01 Apr. 2017

Gambar milik:
1."Transkriptom Sel Pluripoten" oleh Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., The Pluripotent Transcriptome (10 Oktober 2008), STEMBOOK, ED. Komunitas Penelitian Sel Induk, Buku Bintang, DOI/10.3824/STEMBOOK.1.24.1, http: // www.buku induk.org. - [1] DirectStemBook Gambar 2 Transkriptom sel pluripoten.Grskovic, m. dan Ramalho-Santos, M., The Pluripotent Transcriptome (10 Oktober 2008), STEMBOOK, ED. Komunitas Penelitian Sel Induk, Buku Bintang, DOI/10.3824/STEMBOOK.1.24.1, (CC dengan 3.0) Via Commons Wikimedia