Perbedaan antara ikan dan cgh

Itu perbedaan utama Antara ikan dan cgh adalah itu Ikan adalah teknik molekuler yang mendeteksi urutan DNA spesifik pada kromosom menggunakan probe berlabel fluoresensi, sedangkan CGH adalah teknik sitogenetik molekuler lain yang mendeteksi perubahan dalam DNA genomik.

Analisis sitogenetik memainkan peran penting dalam kedokteran ketika mendeteksi kelainan kromosom seperti aneuploidies, penghapusan, duplikasi, dan pengaturan ulang, dll. Kelainan kromosom akhirnya menyebabkan penyakit genetik seperti kanker, infertilitas, sindrom Down, sindrom Klinefelter, sindrom Turner, leukemia, dll. Ada berbagai metode sitogenetik molekuler untuk mendeteksi cacat dan penyakit yang disebutkan di atas. Di antara mereka, ikan (hibridisasi in situ fluoresen) dan CGH (hibridisasi genomik komparatif) adalah dua teknik hibridisasi yang kuat. Namun, kedua metode memiliki pro dan kontra.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu ikan 
3. Apa itu CGH
4. Kesamaan antara ikan dan cgh
5. Perbandingan berdampingan - ikan vs cgh dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu ikan?

Ikan adalah teknik hibridisasi asam nukleat yang dilakukan pada bagian atau bagian jaringan, di seluruh jaringan atau sel. Ini adalah metode berbasis probe. Teknik ini tergantung pada teori pemasangan basa komplementer Watson Crick, menghasilkan hibrida DNA - DNA atau hibrida DNA - RNA, yang dengan demikian dapat mendeteksi gen yang bermutasi atau dapat mengidentifikasi gen yang diinginkan. Lebih lanjut, teknik ini menggunakan sekuens DNA untai tunggal, sekuens DNA untai ganda, sekuens RNA untai tunggal atau oligonukleotida sintetis yang disiapkan menggunakan terjemahan Nick sebagai probe yang komplementer dengan urutan gen yang menarik. Selain itu, fitur terpenting dari teknik ini adalah pelabelan probe dengan pewarna fluoresensi. Dengan demikian, probe mengikat dengan bagian pelengkap kromosom dan memudahkan untuk dideteksi.

Selain itu, ikan adalah metode yang sangat sensitif dan spesifik. Oleh karena itu, ini adalah teknik umum dalam penelitian dan diagnosis keganasan hematologis dan tumor padat. Tapi, ikan menunjukkan resolusi rendah. Ini juga membutuhkan pengetahuan sebelumnya tentang kelainan target untuk merancang urutan penyelidikan.

Gambar 01: Ikan

Ada banyak aplikasi ikan, terutama dalam diagnostik molekuler penyakit menular untuk mengidentifikasi keberadaan patogen dan untuk mengkonfirmasi patogen melalui diagnostik molekuler. Selain itu, ikan adalah teknik yang umum digunakan di bidang biologi perkembangan, kariotipe dan analisis filogenetik dan pemetaan fisik kromosom.

Apa itu CGH?

Hibridisasi genomik komparatif (CGH) adalah teknik sitogenetik molekuler berbasis DNA lain yang dapat mendeteksi perubahan sekuens DNA genomik. Metode ini adalah metode canggih yang dapat menganalisis modifikasi kromosom dan gen untuk mendeteksi perubahan atau perubahan dalam urutan DNA genomik. Selanjutnya, CGH membutuhkan isolasi dan fragmentasi DNA dari sampel eksperimental dan sampel referensi. Kemudian, sampel harus diberi label menggunakan dua pewarna fluorescent yang berbeda (biasanya merah dan hijau). Kemudian, kedua sampel dicampur dan diizinkan untuk hibridisasi kompetitif. Langkah terakhir adalah analisis sampel untuk perubahan DNA seperti duplikasi gen, kehilangan gen, dll. Terutama, ini mengukur perbedaan jumlah salinan DNA antara sampel uji dan sampel kontrol.

Gambar 02: CGH

Versi lain dari CGH tersedia sekarang; Ini adalah metode yang lebih canggih daripada CGH normal. Ini adalah teknik yang disebut CGH atau ACGH berbasis array. ACGH memungkinkan identifikasi yang tepat dari penghapusan gen atau urutan dalam ribuan urutan dalam satu percobaan tunggal.

Apa kesamaan antara ikan dan cgh?

• Ikan dan CGH adalah dua teknik molekuler.
• Ikan dan CGH bergantung pada hibridisasi asam nukleat.
• Juga, kedua teknik membutuhkan probe yang dirancang untuk mendeteksi target DNA tertentu.
• Kami menggunakannya untuk diagnosis penyakit genetik pra -kelahiran dan pasca -kelahiran.
• Selain itu, baik Fish dan CGH adalah alat yang sangat kuat untuk mempelajari perubahan genomik.
• Mereka menggunakan pewarna fluorescent untuk memberi label probe.

Apa perbedaan antara ikan dan cgh?

Ikan adalah seorang in situ Prosedur hibridisasi yang menggunakan probe fluoresen untuk mendeteksi sekuens DNA spesifik, sedangkan CGH adalah teknik hibridisasi molekuler yang mendeteksi perubahan sekuens DNA genomik. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara ikan dan CGH.

Selain itu, ikan membutuhkan pengetahuan sebelumnya tentang kelainan target untuk merancang urutan penyelidikan, sedangkan CGH tidak memerlukan pengetahuan sebelumnya. Juga, perbedaan lebih lanjut antara FISH dan CGH adalah bahwa ikan menunjukkan resolusi terbatas sementara ACGH menunjukkan resolusi tinggi.

Infografis di bawah ini merangkum perbedaan antara ikan dan CGH.

Ringkasan -Ikan vs CGH

Ikan dan CGH adalah dua teknik sitogenetik molekuler yang memfasilitasi deteksi urutan gen yang menarik. Ikan memfasilitasi deteksi urutan DNA spesifik pada kromosom menggunakan probe berlabel fluoresensi sementara CGH memfasilitasi deteksi perubahan dalam DNA genomik. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara ikan dan CGH.

Referensi:

1. “Fluorescence in situ hibridisasi (FISH)” Nature News, Nature Publishing Group, tersedia di sini.
2. Hester, Susan D, dkk. “Perbandingan teknologi hibridisasi genomik komparatif di seluruh platform microarray.”Jurnal Teknik Biomolekul: JBT, Asosiasi Fasilitas Sumber Daya Biomolekul, APR. 2009, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. “Uji Ikan ViewRNA multipleks di sel Jurkat dan HeLa” oleh Ryan Jeffs - karya sendiri (CC BY -SA 3.0) Via Commons Wikimedia
2. “CGH Schema” oleh Mbaudis (Talk) (Unggah) - Pekerjaan Sendiri (CC oleh 2.5) Via Commons Wikimedia