Perbedaan antara genotipe dan pengurutan
Perbedaan utama - genotipe vs sekuensing
Genotip dan pengurutan adalah dua teknik yang dilakukan untuk mendapatkan informasi tentang asam nukleat, terutama DNA suatu organisme. Perbedaan utama antara genotip dan pengurutan adalah itu Genotip adalah proses menentukan varian genetik yang dimiliki individu menggunakan penanda sementara sekuensing adalah penentuan urutan yang benar dari urutan nukleotida dalam fragmen DNA yang diberikan.
ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu genotipe
3. Apa yang diurutkan
4. Perbandingan berdampingan - genotipe vs sekuensing
5. Ringkasan
Apa itu genotipe?
Genotip adalah penentuan susunan genetik individu yang menggunakan urutan DNA dan penanda dan perbandingan dan identifikasi warisannya. Genotip penting dalam biologi evolusioner, biologi populasi, taksonomi, ekologi, dan genetika organisme. Ini dapat dilakukan dengan berbagai teknik termasuk sekuensing DNA, reaksi rantai polimerase, pembatasan panjang fragmen polimorfisme (RFLP), deteksi polimorfik yang diamplifikasi secara acak, polimorfisme panjang fragmen yang diamplifikasi (AFLP), mikroarray DNA, dll.
Genotip melibatkan pengurutan fragmen kecil tertentu dari sekuens DNA dan menemukan keterkaitan komposisi genetik dengan orang lain yang menggunakan penanda genetik. Ini menentukan polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) di antara individu atau alel spesifik. Genotipe berlaku untuk berbagai organisme termasuk manusia. Ini juga berlaku untuk mikroorganisme seperti virus, jamur dll. dan dapat digunakan untuk menentukan varian genetiknya dengan profil referensi. Dalam epidemiologi molekuler dan mikrobiologi forensik, pengendalian patogen, terutama mikroorganisme, dilakukan dengan informasi yang diperoleh dari genotipe. Genotip sangat penting dalam analisis silsilah. Manusia genotipe untuk mengkonfirmasi keibuan dan ayah. Genotipe akan mengungkapkan alel gen yang dominan dan resesif yang memutuskan ciri -ciri spesifik.
Figur_1: genotipe rflp
Apa yang diurutkan?
Sequencing adalah proses menentukan urutan nukleotida yang benar dalam fragmen DNA atau RNA yang diberikan. Hampir semua informasi yang diperlukan untuk pertumbuhan dan pengembangan suatu organisme dikodekan dalam genomnya. Ketersediaan teknik untuk memproduksi dan memisahkan beberapa ratus nukleotida panjang asam nukleat yang menyebabkan pengembangan prosedur menentukan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA yang diberikan. Berbagai jenis metode pengurutan tersedia saat ini. Metode pengurutan ini, bersama dengan teknologi untuk konstruksi perpustakaan genom yang mewakili seluruh genom suatu organisme, memfasilitasi pengurutan seluruh genom organisme itu, membuat analisis mendalam tentang struktur gen, fungsi gen, lokasi gen, ekspresi gen, pemetaan gen, daerah pengatur gen dll.
Genom total dari banyak virus, beberapa bakteri, archaebacteria, ragi dan beberapa organisme lain telah diurutkan dan dipetakan. Proyek Genom Manusia telah memungkinkan untuk mengurutkan dan memetakan seluruh genom manusia dan menerbitkan rancangan pertamanya pada tahun 2003. Ini adalah tonggak utama dalam kemajuan biologi. Urutan genom manusia sekarang digunakan di sektor medis untuk mengidentifikasi penyebab genetik penyakit langka, risiko penyakit layar pada bayi baru lahir, mengidentifikasi detail genetik kanker yang berbeda, mengembangkan terapi baru, dan mengembangkan alat diagnostik baru, dll.
Di dunia tanaman, genom padi dan genom Arabidopsis telah diurutkan. Pengetahuan tentang urutan ini tidak diragukan lagi akan merevolusi pemahaman kita tentang bagaimana sel dan organisme berfungsi.
Figure_2: Autoradiograph of Sanger Sequencing
Apa perbedaan antara genotip dan sekuensing?
Genotipe vs sekuensing | |
| Genotip adalah proses menentukan komposisi genetik individu dan memeriksa kelompok atau taksonomi organisme itu. | Sequencing adalah proses menentukan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA yang diberikan. |
| Teknik | |
| RFLP, Sequencing Gen, PCR, Microarrays DNA, AFLP dll. | Sequencing Sanger, Sequencing Gilbert, Pyrosequencing, Sequencing Generasi Berikutnya, Sequencing Shotgun Dll. |
| Kekhawatiran utama | |
| Ini lebih peduli tentang apakah perbedaan genotipe memberikan perbedaan fenotipe aktual. | Ini lebih peduli tentang urutan nukleotida dan perbedaannya dan perubahan dengan organisme lain. |
Ringkasan -genotipe vs sekuensing
Genotip dan sekuensing berguna untuk mempelajari informasi genetik organisme. Genotip adalah proses menentukan variasi genotipe di antara individu dan menemukan kategori mereka. Sequencing adalah proses menentukan urutan nukleotida yang benar dalam fragmen yang berminat atau wilayah DNA. Kedua teknik memberikan informasi penting tentang gen dan genom.
Referensi:
1. “Metode genotipe.”Metode dalam Biologi Molekuler (Clifton, N.J.). U.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional, N.D. Web. 20 Feb. 2017.
2. Akey, J. M., D. Sosnoski, e. Parra, s. Dios, k. Heister, b. Su, c. Bonilla, l. Jin, dan m. D. Shriver. “Analisis kurva peleburan SNP (MCSNP ): pendekatan bebas gel dan murah untuk genotipe SNP.”Bioteknik 30.2 (2001): 358-67. Web.
Gambar milik:
1. “RFLP Genotyping” oleh (tidak diketahui) - National Institutes of Health (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia
2. "Radioactive Fluorescent" oleh Abizar di Inggris Wikipedia (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia
