Perbedaan antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatika

Itu perbedaan utama Antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatika adalah itu Homologi mengacu pada pernyataan tentang leluhur evolusioner umum dari dua urutan sementara kesamaan mengacu pada tingkat kemiripan antara dua urutan.

Bioinformatika adalah bidang sains yang menggabungkan biologi, rekayasa informasi, ilmu komputer, matematika dan statistik untuk menganalisis dan menafsirkan data biologis. Homologi dan kesamaan adalah dua istilah yang kami gunakan di bidang bioinformatika. Kita dapat dengan mudah menghitung kesamaan sebagai persentase residu serupa dengan panjang perataan tertentu. Namun, kami tidak dapat menghitung homologi karena itu bisa benar atau salah dan biasanya bergantung pada hipotesis yang digunakan.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu homologi dalam bioinformatika
3. Apa kesamaan dalam bioinformatika
4. Kesamaan antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatika
5. Perbandingan berdampingan -homologi vs kesamaan dalam bioinformatika dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu homologi dalam bioinformatika?

Homologi dalam bioinformatika mengacu pada homologi biologis antara DNA, RNA dan sekuens protein yang didefinisikan dalam hal sifat leluhur bersama dalam pohon kehidupan evolusioner kehidupan. Dengan kata lain, itu adalah keturunan evolusioner yang umum dari dua urutan. Alasan kejadian seperti itu bisa disebabkan oleh peristiwa spesiasi (ortolog), peristiwa transfer gen horizontal (xenolog) atau peristiwa duplikasi (paralog).

Gambar 01: Kesejajaran urutan berganda

Dimungkinkan untuk menyimpulkan homologi antara DNA, RNA atau protein dengan asam amino atau kesamaan urutan nukleotida mereka. Kesamaan yang signifikan berfungsi sebagai properti bukti yang kuat untuk menyimpulkan bahwa dua urutan terkait dengan urutan leluhur yang sama dengan perubahan evolusioner. Penyelarasan beberapa urutan menunjukkan daerah dari setiap urutan dengan sifat homolog.

Apa kesamaan dalam bioinformatika?

Dalam bioinformatika, kesamaan menilai kesamaan antara dua protein atau urutan nukleotida. Ada dua langkah utama untuk proses ini. Langkah awalnya adalah penyelarasan pasangan, yang membantu menemukan penyelarasan optimal antara dua urutan (termasuk celah) menggunakan algoritma seperti Blast, Fasta, dan LaLign. Setelah penyelarasan pasangan, perlu untuk mendapatkan dua parameter kuantitatif dari masing-masing perbandingan pasangan-bijaksana. Mereka adalah identitas dan kesamaan.  Dalam ledakan, kesamaan pencarian dikenal sebagai positif.

Gambar 02: Alignment berpasangan

Mutasi konservatif terjadi ketika asam amino bermutasi ke residu yang sama sambil menjaga sifat fisiokimia. Sebagai contoh, jika arginin bermutasi menjadi lisin dengan muatan positif +1, diterima karena kedua asam amino serupa dalam properti dan tidak mengubah protein yang diterjemahkan. Oleh karena itu, pengukuran kesamaan tergantung pada kriteria bagaimana dua residu asam amino satu sama lain.

Apa kesamaan antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatika?

• Homologi dan kesamaan adalah dua istilah teknis yang kami temui dalam bioinformatika.
• Selain itu, kedua istilah merujuk pada analisis molekuler dari sekuens.

Apa perbedaan antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatika?

Homologi mengacu pada pernyataan tentang leluhur evolusioner umum dari dua urutan sementara kesamaan mengacu pada tingkat kemiripan antara dua urutan. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatika. Selain itu, homologi tidak dapat dihitung karena itu bisa benar atau salah dan biasanya bergantung pada hipotesis sementara kesamaan dapat dengan mudah dihitung sebagai persentase residu yang serupa dengan panjang selarasan tertentu. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan yang signifikan antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatika.

Infografis berikut mencantumkan perbedaan antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatika.

Ringkasan -Homologi vs Kesamaan dalam Bioinformatika

Singkatnya, perbedaan utama antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatika terletak pada definisi mereka. Homologi adalah pernyataan leluhur evolusioner umum dari dua urutan sementara kesamaan adalah kemiripan antara dua urutan. Homologi terjadi karena ortolog, paralog, dan xenolog. Saat menyimpulkan kesamaan, dimungkinkan untuk menggunakan algoritma seperti Fasta, Blast, dan Lalign. Homologi tidak dapat dinyatakan sebagai perhitungan, tetapi kesamaan dapat dinyatakan sebagai persentase residu serupa dengan panjang selaras tertentu. Dengan demikian, ini adalah ringkasan perbedaan antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatika.

Referensi:

1." Homolog.”Homolog - Bioinformatika.Org wiki, tersedia di sini.
2. “Identitas dan Kesamaan - Ukuran Kuantitatif.Identitas dan kesamaan - ukuran kuantitatif, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. “Kutipan dari beberapa urutan penyelarasan protein TMEM66” oleh Wikid25 - Open Source ClustalW dan sekuens dari Database Protein NCBI Publik (CC0) melalui Commons Wikimedia
2. "Global Pairwise Alignment" oleh Alfat003 - karya sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia