Perbedaan antara probe dan primer
Perbedaan utama - Probe vs Primer
Probe molekuler adalah fragmen DNA atau RNA kecil yang mengenali urutan komplementer dalam DNA atau RNA dan memungkinkan identifikasi urutan target. Primer adalah bentangan kecil DNA atau RNA yang berfungsi sebagai titik awal untuk sintesis DNA. Primer dan probe hibridisasi dengan nukleotida komplementer dari DNA templat atau DNA target. Namun, perbedaan utama antara probe dan primer adalah itu Primer diperlukan untuk replikasi DNA sementara probe diperlukan untuk mendeteksi urutan spesifik dalam sampel DNA.
ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu penyelidikan
3. Apa itu primer
4. Perbandingan berdampingan - probe vs primer
5. Ringkasan
Apa itu penyelidikan?
Probe adalah fragmen kecil DNA atau RNA yang digunakan untuk mendeteksi DNA target atau RNA dalam sampel dengan hibridisasi molekuler. Mereka juga dikenal sebagai penanda molekuler. Panjang probe dapat bervariasi (100 hingga 1000 pangkalan), dan probe nukleotida saling melengkapi dengan bagian dari urutan target. Untuk kemudahan deteksi, probe diberi label dengan isotop radioaktif atau dengan pewarna atau antibodi fluoresen. Probe mengikat dengan basis komplementer dari urutan target dan mengungkapkan keberadaan DNA target atau RNA dalam sampel. Ada dua metode utama probe pelabelan: labeling akhir dan terjemahan Nick. Probe dikategorikan ke dalam berbagai jenis termasuk probe DNA, probe RNA, probe cDNA dan probe oligonukleotida sintetis, dan mereka disiapkan menggunakan teknik yang berbeda.
Probe adalah alat penting di banyak bidang mikroba dan molekuler seperti virologi, patologi forensik, pengujian ayah, sidik jari DNA, deteksi penyakit genetik, RFLP, sitogenetik molekuler, in situ hibridisasi, dll.
Gambar 01: Probe berlabel fluoresensi yang digunakan dalam ikan untuk deteksi patogen
Apa itu primer?
Primer adalah fragmen DNA atau RNA pendek yang berfungsi sebagai inisiator untuk sintesis DNA. Enzim DNA polimerase menambahkan nukleotida ke kelompok 3 'OH dari urutan primer dan mensintesis untai baru yang saling melengkapi dengan DNA template. Primer adalah fragmen yang sangat pendek dengan panjang 18 hingga 20 nukleotida. Mereka secara kimia disintesis di laboratorium in vitro Amplifikasi DNA (PCR). Primer dapat memiliki urutan nukleotida karena dirancang oleh pengguna. Mereka disintesis agar sesuai dengan basis pelengkap DNA template. Oleh karena itu, ia dapat memiliki urutan nukleotida. Primer sangat penting untuk replikasi DNA karena DNA polimerase tidak dapat mensintesis DNA baru tanpa sepotong DNA yang sudah ada sebelumnya. Saat merancang primer untuk PCR, hal -hal berikut perlu dipertimbangkan:
- Primer harus mengandung nukleotida komplementer ke ujung mengapit DNA yang ingin memperkuat.
- Primer harus memiliki suhu leleh antara 55 - 65 0C
- Konten G dan C harus antara 50 hingga 60%.
Dua primer digunakan dalam PCR sebagai maju dan mundur untuk mereplikasi kedua untai DNA sampel. Primer biasanya digunakan untuk melakukan sequencing PCR dan DNA.
Gambar 02: Annealing primer dalam PCR
Apa perbedaan antara probe dan primer?
Probe vs Primer | |
| Probe adalah fragmen kecil DNA/RNA yang digunakan untuk mendeteksi keberadaan urutan target dalam sampel dengan hibridisasi molekuler. | Primer adalah bentangan kecil DNA atau RNA yang berfungsi sebagai titik awal untuk replikasi DNA. |
| Fungsi | |
| Ini mendeteksi keberadaan urutan spesifik dalam sampel DNA atau RNA. | Ini bertindak sebagai titik awal untuk sintesis DNA. |
| Panjang | |
| Panjang dapat berada di kisaran 100 - 1000 pangkalan | Panjang umumnya sekitar 18 - 20 pangkalan |
| Mengikat dengan urutan komplementer | |
| Probe hibridisasi dengan basis pelengkap dari urutan target | Anneal primer dengan basis pelengkap untai DNA. |
| Pelabelan | |
| Probe diberi label untuk kemudahan deteksi | Primer umumnya tidak diberi label |
| Gunakan dalam PCR | |
| Probe tidak digunakan dalam PCR | Primer digunakan dalam PCR |
Ringkasan - Probe vs Primer
Probe adalah fragmen kecil dari urutan DNA atau RNA yang dapat hibridisasi dengan nukleotida komplementer untuk mendeteksi urutan target dalam sampel. Probe diberi label secara radioaktif, imunologis atau fluoresensi untuk melihat adanya urutan target. Primer adalah fragmen DNA atau RNA yang sangat kecil yang bertindak sebagai titik awal in vitro Amplifikasi DNA. DNA polimerase mengidentifikasi primer grup 3 'OH dan memprakarsai pembangunan untai baru yang saling melengkapi dengan template. Probe dan primer bekerja sama dengan hibridisasi dengan nukleotida komplementer. Dengan demikian, perbedaan utama antara probe dan primer adalah fungsi utama mereka.
Referensi:
1.”Primer (Biologi Molekuler).”Wikipedia. Wikimedia Foundation, 02 Feb. 2017. Web. 01 mar. 2017.
2."Probe hibridisasi.”Wikipedia. Wikimedia Foundation, 30 Des. 2016. Web. 01 mar. 2017
3.”Primer (Biologi Molekuler)."Primer (Biologi Molekuler) - Topik ScienceDirect. N.P., N.D. Web. 01 mar. 2017
Gambar milik:
1. “Ikan untuk Identifikasi Patogen Bakteri” oleh Pepetps Togopic Ivan Akira Magnus Mansketimothy W. Ford -(CC BY -SA 3.0) Via Commons Wikimedia
2. "Primer RevComp Melted2" oleh Richard Wheeler (Zephyris) - karya sendiri (CC BY -SA 3.0) Via Commons Wikimedia
