Perbedaan antara serin dan tirosin rekombinase

Itu perbedaan utama Antara serin dan tirosin rekombinase adalah itu di dalam serin rekombinase, serin adalah asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi, Sementara dalam tirosin rekombinase, tirosin adalah asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi.

Rekombinasi spesifik lokasi (rekombinasi spesifik lokasi konservatif) adalah jenis teknik rekombinasi genetik di mana pertukaran untai DNA terjadi antara segmen yang memiliki tingkat homologi urutan tertentu. Rekombinase spesifik lokasi mengatur proses rekombinasi spesifik lokasi. Enzim ini dikelompokkan menjadi dua keluarga sebagai keluarga serine rekombinase dan keluarga tirosin rekombinase. Nama-nama tersebut berasal dari residu asam amino nukleofilik yang dilestarikan yang ada di dua kelas rekombinase di atas yang digunakan untuk menyerang DNA dan yang menjadi terkait secara kovalen dengan itu selama pertukaran untai dalam rekombinasi spesifik lokasi lokasi lokasi lokasi situs spesifik lokasi lokasi lokasi lokasi lokasi situs lokasi lokasi lokasi situs.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu serine recombinase
3. Apa itu tirosin recombinase
4. Kesamaan antara serin dan tirosin rekombinase
5. Perbandingan berdampingan - serin vs tirosin rekombinase dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu serine recombinase?

Dalam metode rekombinasi spesifik lokasi, dua sekuens DNA pendek ('situs target') dipotong pada titik-titik tertentu di kedua untai, dan ujung pemotongan bergabung kembali dengan pasangan baru. Teknologi rekombinasi spesifik lokasi adalah alat genomik dalam rekayasa genetika yang bergantung pada enzim rekombinase untuk menggantikan bagian target DNA. Banyak sistem rekombinasi spesifik lokasi telah ditemukan untuk melakukan penataan ulang DNA ini untuk tujuan yang berbeda. Tetapi semua enzim rekombinase ini milik dua keluarga. Serine recombinase adalah salah satunya. Mereka dapat memediasi hingga tiga jenis penataan ulang DNA: integrasi, eksisi dan inversi.

Gambar 01: Serine recombinase

Rekombinase spesifik situs seperti serine recombinase melakukan penataan ulang DNA dengan mengenali dan mengikat ke urutan DNA pendek (situs target), di mana mereka memecah tulang punggung DNA. Kemudian, pertukaran dua heliks DNA terjadi dan bergabung kembali dengan untaian DNA terjadi. Dalam serin rekombinase, serin adalah asam amino yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi. Selama pembelahan DNA, ikatan protein-DNA terbentuk melalui reaksi transesterifikasi. Ikatan fosfodiester digantikan oleh ikatan fosfoserin antara gugus 5'fosfat di lokasi pembelahan dan gugus hidroksil dari residu serin yang dilestarikan. Bond baru menyimpan energi yang dikeluarkan untuk membelah DNA di lokasi target. Energi ini kemudian digunakan untuk bergabung kembali dengan DNA ke gugus hidroksil deoksiribosa yang sesuai di situs lain. Contoh serin rekombinase adalah resolvas serin/invertases dan integrase serin.

Apa itu tirosin recombinase?

Tyrosine recombinase adalah kelas enzim lain yang mengatur rekombinasi spesifik situs konservatif. Seperti yang dijelaskan sebelumnya, tirosin recombinase juga melakukan penataan ulang DNA dengan cara yang sama dengan mengenali dan mengikat ke urutan DNA pendek (situs target), di mana mereka membelah tulang punggung DNA. Kemudian, pertukaran dua heliks DNA dan bergabung kembali dengan untaian DNA terjadi.

Gambar 02: Tyrosine recombinase

Tetapi dalam tirosin rekombinase, tirosin adalah asam amino yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi. Fitur umum dari kelas ini adalah residu tirosin nukleofilik yang dilestarikan yang menyerang DNA-fosfat scissile untuk membentuk hubungan 3'-fosfotyrosine. Tyrosine Recombinases (A1) dan Tyrosine Integrases (A2) adalah gugus enzim yang menonjol dalam keluarga enzim tirosin rekombinase.

Apa kesamaan antara serin dan tirosin rekombinase?

• Mereka adalah kelas enzim rekombinase.
• Keduanya mengatur rekombinasi spesifik lokasi.
• Mereka adalah protein.
• Reaksi kimia dasar adalah sama untuk keduanya.
• Keduanya mengkatalisasi reaksi transesterifikasi.

Apa perbedaan antara serin dan tirosin recombinase?

Dalam serin rekombinase, serin adalah asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi. Di sisi lain, dalam tirosin rekombinase, tirosin adalah asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi lokasi. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara serin dan tirosin rekombinase. Fitur umum serin recombinase adalah bahwa ia membentuk ikatan fosfoserin dengan DNA, sedangkan tirosin recombinase membentuk ikatan fosfotyrosine dengan DNA selama proses rekombinasi spesifik lokasi situs-situs.

Infografis di bawah ini mencantumkan perbedaan antara serin dan tirosin rekombinase dalam bentuk tabel.

Ringkasan -Serine vs Tyrosine Recombinase

Rekombinasi dapat terjadi antara molekul DNA yang serupa seperti pada homolog rekombinasi atau molekul yang berbeda seperti pada rekombinasi non-homolog. Rekombinasi spesifik lokasi adalah jenis rekombinasi genetik di mana pertukaran untaian DNA terjadi di antara segmen yang memiliki setidaknya tingkat homologi urutan tertentu. Itu dikatalisis oleh rekombinase. Sebagian besar rekombinase dikelompokkan menjadi dua keluarga: serin rekombinase dan tirosin rekombinase. Serine recombinase menggunakan serin sebagai asam amino nukleofilik untuk menyerang DNA selama proses rekombinasi spesifik lokasi. Tyrosine recombinase menggunakan tirosin sebagai asam amino nukleofilik untuk menyerang DNA selama proses rekombinasi spesifik lokasi. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan utama antara serin dan tirosin rekombinase.

Referensi:

1. “Rekombinasi khusus situs.”Wikipedia, Wikimedia Foundation, 30 Desember. 2020, tersedia di sini.
2. Grindley, Nigel D.F. “Mekanisme rekombinasi spesifik lokasi.Ulasan tahunan, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Surot" oleh Juergen Bode - karya sendiri (CC BY -SA 3.0) Via Commons Wikimedia

2. "Stswap" oleh Juergen Bode - karya sendiri (CC BY -SA 3.0) Via Commons Wikimedia