Istilah penumpukan gel dan pemisah gel digunakan dalam menjelaskan teknik SDS-PAGE. Elektroforesis gel SDS-PAGE atau Sodium Dodecyl sulfate-poliakrilamida adalah teknik laboratorium yang digunakan untuk memisahkan molekul protein berdasarkan berat molekulnya. Teori di balik teknik ini adalah bahwa protein dengan bobot molekul yang berbeda menunjukkan tingkat migrasi yang berbeda; Molekul dengan berat molekul rendah bermigrasi lebih cepat sedangkan molekul dengan berat molekul tinggi bermigrasi secara perlahan. Media untuk migrasi adalah gel. Ada dua jenis gel yang disebut sebagai gel penumpukan dan memisahkan gel. Itu perbedaan utama Antara menumpuk gel dan memisahkan gel adalah itu pH dari gel stacking adalah 6.8 sedangkan pH gel pemisah adalah 8.8.
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa yang menumpuk gel
3. Apa yang memisahkan gel
4. Hubungan antara penumpukan gel dan memisahkan gel
5. Perbandingan berdampingan - gel stacking vs memisahkan gel dalam bentuk tabel
6. Ringkasan
Gel penumpukan adalah gel poliakrilamida terkonsentrasi rendah yang ditempatkan di bagian atas gel penyelesaian yang lebih terkonsentrasi (memisahkan gel) dalam teknik SDS-PAGE. Gel penumpukan digunakan untuk meningkatkan resolusi elektroforesis. Resolusi meningkat karena perbedaan antara konsentrasi gel penumpukan dan penyelesaian gel yang berpengaruh pada protein dalam sampel. Karena konsentrasi poliakrilamida dalam penumpukan gel rendah, ukuran pori lebih tinggi. Ini juga membantu meningkatkan pemisahan.
Gel penumpukan adalah gel poliakrilamida longgar dengan pori -pori besar sekitar 7% poliakrilamida. Pori -pori ini tidak bertindak sebagai penghalang yang cukup besar untuk molekul protein besar. Karenanya gel ini sedikit mempengaruhi mobilitas protein tersebut. Ini membuat pemisahan sesuai dengan mobilitas dan ukuran protein dengan memusatkannya di antara dua gel.
Gambar 01: SDS-PAGE Acrylamide Gel
PH dari gel stacking adalah 6.8. PH -nya bersifat asam dari pada penyelesaian gel dengan 2 unit pH. PH ini menyiratkan kekuatan ionik yang lebih rendah karenanya resistensi listrik yang lebih tinggi. Ini memicu mobilitas protein daripada partikel bermuatan lainnya yang ada dalam gel.
Memisahkan gel atau penyelesaian gel SDS-PAGETECHNIQUE adalah gel poliakrilamida yang sangat terkonsentrasi yang ditempatkan di bagian atas gel susun terkonsentrasi rendah. Gel pemisah mengandung jumlah poliakrilamida yang tinggi (10%). PH gel ini dipertahankan sebagai pH = 8.8, yang merupakan tingkat pH yang lebih tinggi dari pada penumpukan gel.
Gambar 02: Alat elektroforesis gel
Ketika molekul protein mencapai gel pemisah, migrasi molekul tersebut melambat karena gel pemisah adalah gel konsentrasi tinggi dengan ukuran pori kecil yang dapat bertindak sebagai penghalang yang cukup besar untuk pergerakan molekul protein protein. Perlambat ini memungkinkan protein lain bermigrasi perlahan untuk mengejar ketinggalan, menghasilkan pita yang sempit dan terkonsentrasi di antara kedua gel.
Menumpuk gel vs pemisah gel | |
Gel penumpukan adalah gel poliakrilamida terkonsentrasi rendah yang ditempatkan di bagian atas gel penyelesaian yang lebih terkonsentrasi (memisahkan gel) dalam teknik SDS-PAGE. | Memisahkan gel atau penyelesaian gel dari teknik SDS-PAGE adalah gel poliakrilamida yang sangat terkonsentrasi yang ditempatkan di bagian atas gel susun terkonsentrasi rendah. |
Penempatan | |
Gel penumpukan ditempatkan pada gel penyelesaian (memisahkan). | Gel pemisah ditempatkan di bagian bawah wadah yang digunakan untuk elektroforesis gel. |
Konsentrasi | |
Konsentrasi gel susun tinggi. | Konsentrasi gel pemisah rendah. |
Konten poliakrilamida | |
Gel penumpukan mengandung sekitar 7% poliakrilamida. | Gel pemisah mengandung sekitar 10% poliakrilamida. |
ph | |
PH dari gel stacking adalah 6.8. | PH gel pemisah adalah 8.8. |
Ukuran pori | |
Ukuran pori besar hadir dalam penumpukan gel. | Ukuran pori kecil hadir dalam pemisahan gel. |
Resolusi | |
Gel penumpukan memberikan resolusi yang lebih baik. | Memisahkan gel memberikan resolusi yang buruk. |
Gel penumpukan dan gel pemisah adalah dua jenis gel poliakrilamida yang digunakan untuk mendapatkan pemisahan molekul protein yang lebih baik dalam sampel yang diberikan. Perbedaan antara penumpukan gel dan pemisahan gel adalah bahwa pH gel susun adalah 6.8 sedangkan pH gel pemisah adalah 8.8.
1.“Elektroforesis gel poliakrilamida."Elektroforesis gel poliakrilamida (teori): Biologi Molekuler Lab Virtual II: Bioteknologi dan Teknik Biomedis: Amrita Vishwa Vidyapeetham Virtual Lab. Tersedia disini
2.“Bagaimana SDS-Page bekerja."Bighesize Bio, 16 Feb. 2018. Tersedia disini
3.“SDS-Page Stacking Gel-Bich 608 (Polimenis-Pettigrew)."Situs Google. Tersedia disini
1.'SDS-PAGE Acrylamide Gel'by Bensaccount at English Wikipedia, (CC oleh 3.0) Via Commons Wikimedia
2.'Gel Electrophoresis Apparatus' oleh Jeffrey M. Vinocur - pekerjaan sendiri, (cc -by 2.5) Via Commons Wikimedia