Perbedaan antara Sukrosa Gradien dan Sucrose Cushion Ultracentrifugation

Itu perbedaan utama Antara Sukrosa Gradien dan Sucrose Cushion Ultracentrifugation adalah itu Pada gradien sukrosa ultrasentrifugasi, gradien sukrosa kontinu digunakan, sedangkan pada bantal sukrosa ultrasentrifugasi, gradien sukrosa terputus digunakan.

Sukrosa gradien dan bantalan sukrosa ultrasentrifugasi adalah dua jenis teknik serupa yang digunakan untuk memisahkan jenis makromolekul tertentu. Dalam kedua teknik, gradien kepadatan sukrosa digunakan. Tetapi pada gradien sukrosa ultrasentrifugasi, gradien kerapatan kontinu digunakan sementara, pada bantalan sukrosa ultrasentrifugasi, gradien kepadatan terputus digunakan.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu sukrosa gradien ultracentrifugation
3. Apa itu Sucrose Cushion Ultracentrifugation
4. Kesamaan antara Sucrose Gradient dan Sucrose Cushion Ultracentrifugation
5. Perbandingan berdampingan - gradien sukrosa vs bantalan sukrosa ultrasentrifugasi dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu sukrosa gradien ultracentrifugation?

Sukrosa gradien ultrasentrifugasi adalah teknik yang dapat digunakan untuk fraksinasi makromolekul seperti DNA, RNA dan protein. Ada beberapa langkah dalam teknik ini. Mereka adalah persiapan gradien sukrosa, sentrifugasi, pemisahan dan elusi. Persiapan gradien adalah langkah utama dalam teknik ini. Dalam teknik ini, sampel yang mengandung makromolekul ukuran berbeda dilapisi pada permukaan kolom gradien sukrosa. Saat menyentrifugasi, sedimen makromolekul berukuran berbeda melalui kolom gradien sukrosa pada tingkat yang berbeda. Sedimentasi tergantung pada beberapa faktor, termasuk gaya sentrifugasi, bentuk ukuran dan kepadatan makromolekul, kepadatan dan viskositas gradien. Di akhir sentrifugasi, makromolekul dipisahkan secara spasial dengan kepadatan. Makromolekul yang lebih besar (makromolekul densitas tinggi) sedimen ke bawah. Yang lebih ringan (makromolekul densitas rendah) tetap di bagian atas gradien. Oleh karena itu, molekul terpisah sebagai pita yang berbeda. Maka pita harus dipisahkan, dan pemurnian makromolekul spesifik dari sukrosa harus dilakukan.

Gambar 01: Ultracentrifugasi gradien sukrosa

Di sisi aplikasi, metode ini secara luas digunakan untuk fraksinasi molekul DNA. Sukrosa gradien ultrasentrifugasi umumnya digunakan untuk mengkarakterisasi ukuran dan komposisi kompleks protein. Selain itu, teknik ini digunakan untuk pemurnian parsial mRNA.

Apa itu Sucrose Cushion Ultracentrifugation?

Sukrosa bantal ultrasentrifugasi adalah teknik lain yang memungkinkan fraksinasi makromolekul. Tidak seperti gradien kepadatan sukrosa ultrasentrifugasi, ultrasentrifugasi bantalan sukrosa menggunakan gradien kepadatan terputus. Konsentrasi sukrosa meningkat dari atas ke bawah dalam langkah -langkah diskrit. Dalam teknik ini, pemisahan dicapai dengan menempatkan ekstrak yang diklarifikasi di atas volume kecil larutan sukrosa dalam tabung centrifuge, bantal sukrosa yang disebut. Ini memungkinkan pemisahan yang lebih baik dalam sentrifugasi berkecepatan tinggi. Saat molekul terpisah sebagai pita antara bantalan sukrosa, pita putih dapat dikumpulkan dan dimurnikan. Selain itu, kotoran dapat dihilangkan lebih lanjut dengan menggunakan metode bantalan sukrosa. Metode bantal sukrosa memungkinkan 60-70% tabung diisi dengan sampel. Oleh karena itu, metode bantal sukrosa memungkinkan volume sampel yang lebih besar diproses.

Apa kesamaan antara gradien sukrosa dan ultrasentrifugasi bantalan sukrosa?

• Sukrosa gradien dan sucrose cushion ultracentrifugation adalah dua teknik yang digunakan untuk memisahkan campuran makromolekul.
• Di kedua metode, gradien sukrosa digunakan.
• Sentrifugasi adalah langkah dalam kedua metode.
• Sedimen molekul sebagai pita atau zona di setiap metode.

Apa perbedaan antara gradien sukrosa dan ultrasentrifugasi bantalan sukrosa?

Sukrosa gradien ultrasentrifugasi adalah teknik yang menggunakan gradien sukrosa kontinu dalam tabung centrifuge sementara bantalan sukrosa ultrasentrifugasi adalah teknik yang menggunakan gradien sukrosa terputus. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara gradien sukrosa dan ultrasentrifugasi bantalan sukrosa.

Selain itu, ultrasentrifugasi bantalan sukrosa memungkinkan volume sampel yang lebih besar untuk diproses saat ultrasentrifugasi gradien sukrosa memungkinkan volume sampel yang relatif rendah untuk diproses.

Di bawah infografis Tabulasi lebih banyak perbedaan antara gradien sukrosa dan bantalan sukrosa ultrasentrifugasi.

Ringkasan -Sukrosa Gradien vs Sukrosa Bantal Ultrasentrifugasi

Sukrosa gradien ultrasentrifugasi memisahkan makromolekul menggunakan gradien sukrosa kontinu. Sebaliknya, ultrasentrifugasi bantalan sukrosa menggunakan gradien sukrosa terputus untuk memisahkan jenis partikel tertentu dalam campuran. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara gradien sukrosa dan ultrasentrifugasi bantal sukrosa. Metode bantalan sukrosa memungkinkan pengumpulan partikel yang utuh secara morfologis karena tidak menyebabkan tekanan mekanis, tidak seperti ultrasentrifugasi gradien sukrosa, yang menghancurkan molekul ke bagian bawah tabung. Selain itu, ultrasentrifugasi bantalan sukrosa memungkinkan volume sampel yang lebih besar diproses daripada ultrasentrifugasi gradien sukrosa.

Referensi:

1. Dijkstra, Jeanne, dan Cees P. de Jager. “Sentrifugasi gradien kepadatan."Springerlink, Springer, Berlin, Heidelberg, 1 Jan. 1998, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Gradien Kepadatan"-MLW3559 di Wikibooks Inggris. - Ditransfer dari en.wikibooks ke commons. (CC BY-SA 2.5) Via Commons Wikimedia