Perbedaan antara proteomik yang ditargetkan dan yang tidak ditargetkan

Perbedaan utama antara proteomik yang ditargetkan dan yang tidak ditargetkan adalah bahwa Proteomik yang ditargetkan bertujuan untuk mengukur kelimpahan protein spesifik sementara proteomik yang tidak ditargetkan tidak menargetkan protein tertentu.

Proteomik adalah studi skala besar protein, strukturnya, dan fungsinya. Ini mempelajari seluruh pelengkap protein dalam sel, jaringan atau organisme dalam kondisi tertentu. Ada dua jenis proteomik sebagai proteomik yang ditargetkan dan proteomik yang tidak ditargetkan.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Target Proteomik
3. Apa itu proteomik yang tidak ditargetkan
4. Kesamaan antara proteomik yang ditargetkan dan yang tidak ditargetkan
5. Perbandingan berdampingan - proteomik yang ditargetkan vs yang tidak ditargetkan dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu Target Proteomik?

Seperti namanya, proteomik yang ditargetkan menargetkan protein spesifik atau peptida dalam campuran protein yang kompleks untuk analisis. Kemudian menganalisis keberadaan dan kuantitas protein spesifik yang dipilih sebelumnya. Metode ini dimungkinkan hanya untuk satu sampel atau di beberapa sampel. Metode ini cocok bahkan untuk kelompok protein tertentu. Ini menghasilkan data yang lebih tepat, kuantitatif dan sensitif. Selain itu, spektrometri massa ditambah dengan proteomik yang ditargetkan menghasilkan pengukuran yang lebih akurat yang dapat diandalkan. Metode ini menggunakan Triple Quadrupole Mass Spectrometer (QQQ) untuk analisisnya.

Gambar 01: Proteomik

Proteomik yang ditargetkan adalah metode yang cocok jika Anda ingin memverifikasi jika target knockdown benar -benar dirobohkan atau ketika Anda ingin mengukur protein/peptida tertentu dalam serum darah, cairan otak atau dalam lisat sel dll. Anda juga dapat menggunakannya jika Anda ingin memeriksa apakah protein tertentu diekspresikan secara berbeda di seluruh sampel atau selama percobaan kursus waktu.

Apa itu proteomik yang tidak ditargetkan?

Proteomik yang tidak ditargetkan, seperti namanya, tidak menargetkan protein atau peptida tertentu untuk analisisnya. Discovery Proteomics adalah nama lain untuk proteomik yang tidak ditargetkan. Faktanya, ini adalah analisis yang lebih 'global'. Secara umum, melakukan proteomik yang tidak ditargetkan adalah menjawab pertanyaan “apa protein atau protein dalam sampel ini atau beberapa sampel?". Metode ini tidak sensitif sebagai proteomik yang ditargetkan. Tetapi dapat mengidentifikasi dan mengukur banyak protein termasuk protein baru. Proteomik yang tidak ditargetkan dapat menghasilkan pengukuran kuantitatif dan kualitatif.

Apa kesamaan antara proteomik yang ditargetkan dan yang tidak ditargetkan?

• Protein yang ditargetkan dan tidak ditargetkan mengukur protein dalam sampel.
• Mereka penting dalam analisis proteome.
• Metode ini menggunakan spektrometri massa.

Apa perbedaan antara proteomik yang ditargetkan dan yang tidak ditargetkan?

Pertama, proteomik yang ditargetkan adalah penentuan keberadaan dan kuantitas protein atau peptida tertentu dalam campuran protein yang kompleks. Sebaliknya, proteomik yang tidak ditargetkan adalah studi kuantitatif dan kualitatif protein yang ada dalam sampel atau sampel tanpa menargetkan protein tertentu. Proteomik yang ditargetkan dilakukan dengan protein yang dipilih atau ditargetkan sementara proteomik yang tidak ditargetkan dilakukan untuk mengetahui jenis protein dalam sampel ini. Selain itu, proteomik yang ditargetkan lebih sensitif daripada proteomik yang tidak ditargetkan.

Ringkasan -Proteomik yang ditargetkan vs yang ditargetkan

Singkatnya, proteomik yang ditargetkan dan tidak ditargetkan adalah dua jenis studi protein. Seperti namanya, proteomik yang ditargetkan menargetkan protein spesifik sementara proteomik yang tidak ditargetkan tidak menargetkan protein tertentu. Ini adalah perbedaan antara proteomik yang ditargetkan dan yang tidak ditargetkan.

Referensi:

1. “Proteomik yang ditargetkan.Inti Proteomik UC Davis, tersedia di sini.
2. “Proteomik/Pengantar Proteomik.Teori/mode musik - Wikibooks, buku terbuka untuk dunia terbuka, tersedia di sini.

Gambar milik:

1."Proteomik" oleh XXL7441 di Wikibooks Inggris - ditransfer dari EN.Wikibooks to Commons (domain publik) melalui Commons Wikimedia