Apa perbedaan antara CIS dan transplicing trans

Itu Perbedaan utama antara CIS dan splicing trans adalah bahwa splicing cis adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan intron dan bergabung dengan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama, sedangkan trans-splicing adalah mekanisme antar molekul yang menghilangkan intron atau outron dan bergabung dengan ekson yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama.

Splicing RNA adalah bentuk pemrosesan RNA sebelum sintesis protein. Dalam proses ini, transkrip RNA pra-messenger yang baru dibuat diubah menjadi RNA messenger dewasa. RNA messenger dewasa membantu menghasilkan molekul protein. Selama splicing RNA, intron (daerah non-coding) dihilangkan, dan ekson (daerah pengkodean) bergabung bersama untuk membuat mRNA dewasa. CIS dan Trans Splicing adalah dua jenis mekanisme splicing RNA.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu splicing cis
3. Apa itu splicing trans
4. Kesamaan -CIS dan Trans Splicing
5. CIS vs Trans Splicing dalam bentuk tabel
6. Ringkasan -CIS VS Trans Splicing

Apa itu splicing cis?

CIS Splicing adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan intron dan bergabung dengan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama. Splicing CIS normal memproses molekul RNA tunggal. Cis splicing adalah proses splicing khas pra mRNA yang dilakukan oleh spliceosome. Di intron, situs donor (5 'akhir intron), situs cabang (dekat ujung 3' intron) dan situs akseptor (3 'akhir intron) sangat penting untuk splicing. Situs donor splice mencakup urutan invarian GU di ujung 5 'intron. Situs akseptor sambungan di ujung 3 'intron memiliki urutan ag invarian. Hulu dari urutan AG, ada wilayah yang disebut daerah pirimidin (saluran polypyrimidine). Lebih jauh hulu dari saluran polipirimidin, ada titik cabang yang mencakup nukleotida adenosin. Nukleotida ini terlibat dalam pembentukan Lariat.

Gambar 01: CIS dan Trans Splicing

Spliceosom utama adalah U1, U2, U4, U5 dan U6. Di antara mereka, U1 dan U2 sangat penting. Dalam splicing cis, U1 berikatan dengan situs splice 5 ', dan U2 berikatan dengan titik cabang di dekat situs splice 3'. U5/U4/U6 mengikat ekson di situs 5 ', dengan U6 mengikat U2. Kemudian, U1 dirilis. U5 bergeser dari ekson ke intron, dan U6 mengikat di situs sambungan 5 '. Selanjutnya, U4 juga dirilis. U6/U2 mengkatalisasi transesterifikasi, membuat akhir 5 'intron mengikat ke nukleotida pada intron. Ini memicu formasi Lariat. Dalam pembentukan Lariat, U5 mengikat ekson di situs splice 3 ', dan situs 5' dibelah. Pada fase akhir splicing, u2/u5/u6 tetap terikat ke lariat, dan situs 3 'dibelah. Selain itu, ekson diikat menggunakan hidrolisis ATP dalam fase ini.

Apa itu splicing trans?

Trans splicing adalah mekanisme antarmolekul yang menghilangkan intron atau outron dan bergabung dengan ekson yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama. Dalam trans-splicing, tidak ada situs sambungan 5 'pada molekul pra mRNA untuk protein U1 untuk mengikat. Sebaliknya, Capped Splice Leader (SL) RNA ditransoksikan untuk berurutan di Outron.

Gambar 02: Trans Splicing

Outron adalah wilayah pra mRNA antara tutup 5 'dan situs splice trans.  Namun, protein U2 mengikat ke situs sambungan 3 'biasanya. Setelah menghapus Outron, Exon Pemimpin Splice (SL) disambung ke ekson pertama pada pra mRNA. Selanjutnya, trans-splicing adalah mekanisme yang diamati pada mikroorganisme tertentu seperti protista kelas kinetoplastae untuk mengekspresikan gen.

Apa kesamaan antara cis dan splicing trans?

• CIS dan Trans Splicing adalah dua jenis mekanisme splicing RNA.
• Di kedua mekanisme, intron dihilangkan.
• Juga, di kedua mekanisme, ekson bergabung untuk membentuk mRNA dewasa.
• Kedua mekanisme ditemukan dalam eukariota.
• Mekanisme ini tidak ada dalam prokariota.

Apa perbedaan antara CIS dan transplicing trans?

Penyambungan CIS adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan intron dan bergabung dengan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama, sedangkan trans-splicing adalah mekanisme antar molekul yang menghilangkan intron atau outron dan bergabung dengan ekson yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara CIS dan transplicing trans. Selanjutnya, dalam splicing cis, intron dihilangkan untuk membentuk mRNA dewasa. Di sisi lain, dalam transplicing intron atau outron dihilangkan untuk membentuk mRNA dewasa.

Infografis berikut ini mencantumkan perbedaan antara CIS dan trans splicing dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -CIS VS Trans Splicing

Penyambungan RNA adalah bentuk pemrosesan RNA sebelum proses sintesis protein. CIS dan Trans Splicing adalah dua jenis mekanisme splicing RNA yang ditemukan dalam eukariota. Penyambungan CIS adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan intron dan bergabung dengan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama, sedangkan trans-splicing adalah mekanisme antar molekul yang menghilangkan intron atau outron dan bergabung dengan ekson yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama. Dengan demikian, ini menyimpulkan diskusi tentang perbedaan antara cis dan splicing trans.

Referensi:

1. “RNA splicing: intron, ekson dan spliceosome.Berita Alam, Grup Penerbitan Alam.
2. “Trans splicing."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.

Gambar milik:

1. "Trans-splicing" von ab-ab (cc by-sa 3.0) Via Commons Wikimedia
2. "Figura-Trans-Splicing" oleh JMRR-UAM-Karya Sendiri (CC BY-SA 4.0) Via Commons Wikimedia