Apa perbedaan antara crrna tracrrna dan gRNA

Itu perbedaan utama between crRNA tracrRNA and gRNA is that crRNA is one of the two types of RNA of CRISPR, which is complementary to the target DNA sequence, while tracrRNA is the second type of RNA of CRISPR, which serves as a binding scaffold for the Cas nuclease and GRNA adalah salah satu dari dua komponen utama sistem bakteri dan archaea CRISPR-CAS9 yang mengenali DNA target dan memandu protein CAS untuk membuat istirahat untai ganda dalam DNA target.

Crispr berarti pengulangan palindromik pendek yang diselingi dikelompokkan. Ini adalah salah satu sistem kekebalan tubuh pada bakteri dan archaea. Bakteri dan archaea menggunakan sistem ini untuk melindungi diri dari patogen virus. Ini adalah salah satu mekanisme paling menakjubkan yang melibatkan modifikasi genetik yang sukses. Mekanisme ini (CRISPR-CAS9) digunakan sebagai alat pengeditan gen baru dalam bioteknologi. Ini telah membawa kemajuan baru ke bioteknologi, terutama di bidang rekayasa genetika.

Ada dua komponen utama dari sistem CRISPR-CAS9. Mereka adalah panduan nuklease RNA (GRNA) dan CRISPR (CAS) CRISPR. Panduan RNA adalah urutan RNA spesifik yang memandu protein CAS untuk memecah DNA target. Panduan RNA terdiri dari dua jenis RNA. Mereka adalah CRISPR RNA (CrRNA) dan TracrrNA. Nuklease terkait CRISPR (CAS) adalah endonuklease non-spesifik yang membuat istirahat untai ganda dalam DNA target. Dengan membuat double-strand break pada DNA target, bakteri dan archaea mengarahkan mekanisme perbaikan endogennya untuk menonaktifkan DNA virus.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu crrna  
3. Apa itu tracrrna 
4. Apa itu GRNA
5. Kesamaan - crrna tracrrna dan gRNA
6. crrna vs tracrrna vs gRNA dalam bentuk tabel
7. Ringkasan - crrna vs tracrrna vs gRNA

Apa itu crrna?

CrRNA atau CRISPR RNA adalah salah satu dari dua jenis RNA panduan. Secara struktural, ini adalah urutan 17-20 nukleotida. Fitur CrRNA yang paling berharga adalah melengkapi DNA target. Oleh karena itu, CrRNA cocok dengan urutan DNA virus. Spesifisitas sistem CRISPR-CAS 9 tergantung pada crrna. Pada bakteri, crRNA ada menyatu dengan urutan tracrrna, yang merupakan jenis kedua CRISPR RNA. Produksi CrRNA dipicu oleh paparan ulang bakteri ke virus. Saat terpapar, transkripsi gen yang dikodekan untuk crrna terjadi. Kemudian, mekanisme pertahanan dimulai terhadap virus.

Gambar 01: Sistem CRISPR-CAS9

Apa itu tracrrna?

CrRNA atau TracrrNA yang diaktifkan adalah bagian kedua dari Guiderna atau CRISPR RNA. Itu diucapkan sebagai pelacak RNA.  Tracrrna berfungsi sebagai perancah pengikatan untuk protein endonuclease cas 9. Dengan kata lain, Tracrrna berfungsi sebagai pegangan untuk memandu Cas9 menuju DNA target. Secara struktural, tracrrna memiliki 42 nukleotida. Itu ada dikombinasikan dengan crrna.

Apa itu GRNA?

Panduan RNA atau GRNA adalah salah satu dari dua komponen utama sistem kekebalan CRISPR-CAS9. Ini adalah urutan RNA spesifik yang terdiri dari dua elemen: crrna dan tracrrna. GRNA Mengenali DNA target dan mengarahkan protein CAS untuk membuat istirahat untai ganda dalam DNA target. Untuk melakukannya, CrRNA terdiri dari urutan komplementer DNA target sementara tracrrna memandu protein CAS yang bekerja sebagai pegangan.

Gambar 02: GRNA

Merancang GRNA yang benar adalah langkah penting dalam alat pengeditan gen CRISPR-CAS9. Oleh karena itu, keberhasilan dan efisiensi pengeditan sistem CRISPR tergantung pada urutan GRNA yang benar. GRNA dapat diekspresikan dalam sel dari plasmid yang ditransfeksi. Saat plasmid kloning dimasukkan ke dalam sel, sel inang menghasilkan GRNA. GRNA yang paling umum dihasilkan terdiri dari 100 pasangan basa.

Apa kesamaan antara crrna tracrrna dan gRNA?

• CrRNA, TracrrNA dan GRNA adalah sekuens RNA yang ditemukan pada bakteri dan archaea.
• Mereka semua termasuk dalam sistem CRISPR.
• GRNA terbuat dari crrna dan tracrrna.
• Mereka terlibat dalam mengenali DNA bakteriofag dan membimbing endonuklease menuju DNA target.
• Oleh karena itu, ketiga jenis RNA terlibat dalam mengarahkan cas9 nuclease untuk membuat istirahat untai ganda dalam menyerang bahan genetik asing.
• Keberhasilan percobaan CRISPR tergantung pada ketiga jenis RNA.

Apa perbedaan antara crrna tracrrna dan gRNA?

CrRNA adalah bagian dari GRNA CRISPR yang melengkapi DNA target, sedangkan tracrrNA adalah bagian kedua dari GRNA, yang berfungsi sebagai perancah pengikatan untuk CAS nuclease CAS. GRNA adalah kombinasi CrRNA dan TracrrNA, dan merupakan salah satu dari dua komponen sistem CRISPR-CAS9, yang mengenali DNA target dan memandu nuklease untuk membuat istirahat untai ganda dalam DNA target. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara crrna tracrrna dan gRNA.

Tabel berikut merangkum perbedaan antara crrna tracrrna dan gRNA.

Ringkasan - crrna vs tracrrna vs gRNA

Sistem CRISPR-CAS9 adalah sistem kekebalan bakteri dan archaea. Sistem ini digunakan sebagai alat pengeditan gen dalam bioteknologi. CRISPR terdiri dari dua jenis RNA, yaitu CRISPR RNA (CrRNA) dan Transactivating CRISPR RNA (TracrRNA). Mereka secara kolektif dikenal sebagai Guiderna atau GRNA. RNA ini mengenali urutan target patogen yang menyerang dan memandu endonucleases untuk membuat istirahat untai ganda dalam DNA target. Begitu istirahat untai ganda dilakukan dalam bahan genetik asing, mekanisme perbaikan endogen (gabungan akhir nonhomolog; NHEJ) menonaktifkan DNA asing dengan memperkenalkan mutasi. Dengan demikian, ini merangkum perbedaan antara crrna tracrrna dan gRNA.

Referensi:

1. “Panduan RNA."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.
2. Karvelis, Tautvydas, dkk. “Panduan CrRNA dan TracrRNA yang dimediasi Cas9-Mediated DNA dalam Streptococcus thermophilus.”Biologi RNA, Landes Bioscience, Mei 2013.

Gambar milik:

1. “CRISPR-CAS9 Mode of Action” oleh Viktoriaselm-Pekerjaan Sendiri (CC BY-SA 4.0) Via Commons Wikimedia
2. "GRNA-CAS9" oleh Marius Walter-File: GRNA-CAS9.PNG (CC BY-SA 4.0) Via Commons Wikimedia