Apa perbedaan antara transposon DNA dan retrotransposon

Apa perbedaan antara transposon DNA dan retrotransposon

Itu perbedaan utama Antara transposon DNA dan retrotransposon adalah bahwa transposon DNA adalah elemen genetik seluler yang berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme pemotongan dan pasta, sementara retrotransposon adalah elemen genetik seluler yang berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan copy dan mekanisme tempel.

Elemen genetik seluler (MGE) adalah segmen DNA yang mengkodekan enzim dan protein spesifik yang memediasi gerakan mereka dalam genom, atau yang dapat ditransfer dari satu spesies ke spesies lainnya. Mereka juga dikenal sebagai elemen genetik egois. Elemen transposable mewakili salah satu dari beberapa jenis elemen genetik seluler. Ada dua jenis utama elemen transposable: transposon DNA dan retrotransposon. Oleh karena itu, transposon DNA dan retrotransposon adalah elemen genetik seluler yang dapat berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu transposon DNA 
3. Apa retrotransposon
4. Kesamaan -transposon DNA dan retrotransposon
5. Transposon DNA vs retrotransposon dalam bentuk tabel
6. Ringkasan -Transposon DNA vs Retrotransposon

Apa itu transposon DNA?

Transposon DNA adalah elemen genetik seluler yang berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme pemotongan dan pasta. Mereka termasuk elemen transposable kelas II yang bergerak melalui perantara DNA. Ini bertentangan dengan elemen transposable kelas I (retrotransposon) yang bergerak melalui perantara RNA. Biasanya, transposon DNA bergerak dalam genom dengan menggunakan metode potongan dan pasta. Metode ini membutuhkan enzim transposase yang mengkatalisasi pergerakan DNA dari lokasi saat ini dalam genom dan penyisipan di lokasi baru.

Gambar 01: Transposon DNA

Transposisi ini membutuhkan tiga situs DNA pada transposon (dua di setiap ujung transposon yang disebut terminal terbalik dan satu di lokasi target). Enzim transposase akan berikatan dengan pengulangan terminal terbalik dari transposon dan memediasi sinapsis dari ujung transposon. Kemudian transposase enzim memutuskan elemen dari DNA mengapit dari situs donor asli dan memediasi bergabungnya transposon ke situs penyisipan baru dalam genom. Penambahan transposon ke lokasi baru menyebabkan celah pendek di kedua sisi segmen yang dimasukkan. Sistem host memperbaiki kesenjangan ini, menghasilkan duplikasi urutan target (TSD), yang merupakan karakteristik transposisi.

Apa retrotransposon?

Retrotransposon adalah elemen genetik seluler yang berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme salinan dan tempel. Mereka termasuk elemen transposable kelas I. Elemen Transposable Kelas I (retrotransposon) bergerak melalui perantara RNA dalam genom. Mereka adalah jenis komponen genetik yang menyalin dan menempelkan diri ke lokasi genomik yang berbeda.

Gambar 02: Retrotransposon

Pertama, mereka ditranskripsi dari DNA ke RNA. Kemudian RNA yang diproduksi ditranskripsi terbalik ke DNA. DNA yang disalin ini kemudian dimasukkan kembali ke genom di lokasi baru. Transkripsi terbalik dikatalisis oleh transcriptase terbalik. Reverse transcriptase sering dikodekan oleh retrotransposon itu sendiri. Integrasi dilakukan dengan enzim yang disebut integrase. Selain itu, biasanya tiga jenis: pengulangan terminal panjang (LTR), elemen nuklir panjang yang diselingi (garis), dan elemen nuklir yang diselingi pendek (SINE).

Apa kesamaan antara transposon DNA dan retrotransposon?

  • Transposon dan retrotransposon DNA adalah elemen genetik seluler.
  • Keduanya diklasifikasikan di bawah elemen transposable.
  • Keduanya dikenal sebagai gen lompat.
  • Mereka dapat berpindah dari satu tempat ke tempat lain di genom.
  • Mereka sangat penting evolusioner.

Apa perbedaan antara transposon DNA dan retrotransposon?

Transposon DNA adalah elemen genetik seluler yang berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme pemotongan dan pasta, sedangkan retrotransposon adalah elemen genetik seluler yang berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan copy dan mekanisme tempel. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara transposon DNA dan retrotransposon. Selanjutnya, transposon DNA termasuk elemen transposable kelas II, sedangkan retrotransposon termasuk elemen transposable kelas I.

Infografis di bawah ini menyajikan perbedaan antara transposon DNA dan retrotransposon dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -Transposon DNA vs Retrotransposon

Transposon dan retrotransposon DNA adalah elemen genetik seluler. Transposon DNA Berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme pasta potong. Retrotransposon berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme salinan dan tempel. Jadi, ini merangkum perbedaan antara transposon DNA dan retrotransposon.

Referensi:

1. Muñoz-López, Martín, dan José l García-Pérez. “Transposon DNA: Alam dan Aplikasi dalam Genomik.”Genomik Saat Ini, Bentham Science Publishers Ltd., Apr. 2010.
2. “Retroposon."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.

Gambar milik:

1. "DNA Transposon" oleh Mariuswalter - karya sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia
2. "Retrotransposon" oleh Mariuswalter - karya sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia