Apa perbedaan antara ITS1 dan ITS2

Itu perbedaan utama antara ITS1 dan ITS2 adalah bahwa ITS1 adalah DNA spacer yang terletak antara 18 dan 5.Gen 8s rRNA dalam eukariota, sedangkan ITS2 adalah DNA spacer yang terletak di antara 5.Gen RRNA 8S dan 28S dalam eukariota.

Spacer transkrip internal (ITS) adalah spacer DNA yang biasanya terletak di antara RNA ribosom subunit kecil dan gen RNA ribosom subunit besar dalam kromosom atau di daerah transkripsi yang sesuai dalam molekul transkrip prekursor rRNA polikistronik polikistronik. Pada bakteri dan archaea, hanya ada satu gen antara 16s dan 23S rRNA. Tetapi dalam eukariota, ada dua DNA spacer -nya: ITS1 (antara 18 dan 5.Gen rRNA 8S) dan ITS2 (antara 5.8S dan 28S rRNA). Oleh karena itu, ITS1 dan ITS2 adalah dua DNA spacer yang ditemukan antara gen rRNA dalam eukariota.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu ITS1 
3. Apa itu2
4. Kesamaan - ITS1 dan ITS2
5. ITS1 vs ITS2 dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu ITS1?

ITS1 adalah DNA spacer yang terletak antara 18 dan 5.8s gen rRNA dalam eukariota. Itu mengacu pada sepotong DNA spacer nonfungsional yang terletak di antara gen rRNA. ITS1 memiliki variasi panjang yang lebih besar dari ITS2. Variasi panjang ITS1 kira-kira (200-300bp). Penanda seperti ITS1 telah membuktikan efisiensinya dalam menjelaskan hubungan filogenetik di antara taksa yang berbeda. Selain itu, DNA spacer ITS1 kurang dilestarikan dari DNA spacer ITS2. Strukturnya hanya dilestarikan di unit taksonomi yang jauh lebih kecil. Setiap kluster ribosom eukariotik juga berisi daerah yang disebut spacer transkrip eksternal (5 'dan 3' ETS).

Gambar 01: Wilayah ITS1

DNA spacer ITS1 sangat dekat dengan spacer transkrip 5'external (5 'ETS). Selain itu, jika ada yang ingin memperkuat wilayah ITS1 untuk studi hubungan filogenetik, mereka harus menggunakan pasangan primer tertentu (primer terbalik dan maju) untuk tujuan ini. Untuk memperkuat wilayah ITS1, dua set primer biasanya digunakan dalam protokol PCR laboratorium. Mereka adalah NTR ITS1 dan ITS2 Reverse atau ITS1 Foward dan ITS4 Reverse.

Apa itu2?

ITS2 adalah DNA spacer yang terletak di antara 5.Gen RRNA 8S dan 28S dalam eukariota. Wilayah ITS2 memiliki variasi panjang yang lebih pendek dari wilayah ITS1. Variasi panjang ITS2 kira-kira (180-240bp). Namun, wilayah ITS2 lebih dilestarikan daripada wilayah ITS1 di banyak unit taksonomi. Itu mengidentifikasi bahwa semua urutan ITS2 berbagi inti umum dari struktur sekunder. Selain itu, 40% wilayah ITS2 dilestarikan di antara semua angiospermae, sementara dimungkinkan untuk menyelaraskan 50% dari wilayah ITS2 di seluruh keluarga dan tingkat yang lebih tinggi.

Gambar 02: Wilayah ITS2

Terlepas dari ruang lingkup konservasi, penggunaan wilayah ITS2 juga sangat populer seperti wilayah ITS1 dalam studi hubungan filogenetik, terutama dalam barcode DNA jamur. Untuk memperkuat wilayah ITS2, set primer spesifik umumnya digunakan dalam protokol PCR laboratorium. Itu adalah ITS1 Foward dan ITS4 Reverse. Tetapi ketika protokol PCR menggunakan set primer ini, ia juga memperkuat wilayah ITS1 bersama dengan wilayah ITS2. Selanjutnya, DNA spacer ITS2 sangat dekat dengan spacer transkrip 3 eksternal (3 'ETS).

Kesamaan antara ITS1 dan ITS2

• ITS1 dan ITS2 adalah dua DNA spacer yang terletak di antara gen rRNA.
• Mereka hanya hadir dalam eukariota.
• Keduanya dapat diperkuat dengan menggunakan pasangan primer tertentu.
• Keduanya dieksisi dalam pematangan rRNA sebagai produk sampingan non-fungsional.
• Keduanya sangat penting untuk studi hubungan filogenetik, terutama dalam barcode DNA jamur.

Perbedaan antara ITS1 dan ITS2

ITS1 adalah DNA spacer antara 18 dan 5.Gen RRNA 8S dalam eukariota sementara ITS2 adalah DNA spacer yang terletak di antara 5.Gen RRNA 8S dan 28S dalam eukariota. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara ITS1 dan ITS2. Selain itu, ITS1 memiliki variasi panjang yang lebih besar dibandingkan dengan ITS2. Di sisi lain, ITS2 memiliki variasi panjang yang lebih pendek dibandingkan dengan ITS1. Ini adalah perbedaan lain antara ITS1 dan ITS2.

Infografis di bawah ini mencantumkan perbedaan antara ITS1 dan ITS2 dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -ITS1 vs ITS2

Wilayah transkrip internal (ITS) adalah bagian non-fungsional DNA spacer yang terletak di antara gen rRNA. Di bakteri dan archaea, hanya ada satu wilayahnya. Namun dalam eukariota, ada dua daerahnya: ITS1 dan ITS2. ITS1 adalah DNA spacer yang terletak antara 18 dan 5.Gen 8S rRNA dalam eukariota, sedangkan ITS2 adalah DNA spacer yang terletak di antara 5.Gen RRNA 8S dan 28S dalam eukariota. Dengan demikian, ini adalah ringkasan perbedaan antara ITS1 dan ITS2.

Referensi:

1. “Spacer transkrip internal."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.
2. Schoch, Conrad L., et al. “Nuklir Ribosomal Internal Spacer Transcibed (ITS) sebagai penanda barcode DNA universal untuk jamur.”PNA, Akademi Ilmu Pengetahuan Nasional.

Gambar milik:

1. "Eucaryot rDNA" oleh - Firaun Han Diasumsikan - Tidak Ada Sumber yang Dapat dibaca Mesin. Pekerjaan sendiri diasumsikan (berdasarkan klaim hak cipta) (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia
2. “Molecularmarkerssymbiodinium” oleh Allisonmlewis - karya sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia