Apa perbedaan antara TAQ dan PFU polimerase

Itu perbedaan utama Antara Taq dan PFU polimerase adalah bahwa Taq polimerase memiliki aktivitas proofreading eksonuklease 5'-3 'sementara PFU polimerase memiliki aktivitas proofreading eksonuklease 3'-5'.

DNA polimerase mengkatalisasi sintesis DNA selama replikasi. DNA polimerase menggunakan untai DNA template untuk mensintesis untai DNA komplementer. Selain fungsinya sebagai polimerase, ini membantu dalam perbaikan proofreading dan kerusakan DNA melalui aktivitas exonuclease -nya. TAQ dan PFU polimerase adalah dua enzim polimerase utama. Taq polimerase milik keluarga A, sedangkan PFU polimerase milik keluarga B. Mereka bersifat replikasi dan perbaikan polimerase dan memainkan peran penting dalam reaksi berantai polimerase (PCR).

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Taq Polymerase
3. Apa itu PFU polimerase
4. Kesamaan -TAQ dan PFU polimerase
5. Taq vs PFU polimerase dalam bentuk tabel
6. Ringkasan -TAQ vs PFU polimerase

Apa itu Taq Polymerase?

Taq polimerase adalah DNA polimerase 1 termostabil yang dinamai setelah penemuannya dari mikroorganisme eubakteri termofilik Thermus aquaticus. T. Aquaticus adalah bakteri yang hidup dalam kondisi yang sangat panas seperti mata air panas dan ventilasi hidrotermal. Taq Polimerase diidentifikasi sebagai enzim yang resisten terhadap suhu tinggi; Oleh karena itu digunakan secara luas selama PCR. Taq polimerase memiliki struktur yang mirip dengan E. coli polimerase a. Ini terdiri dari domain eksonuklease 5'-3 'fungsional di akhir terminal asam amino. Dua domain yang tersisa bertindak dalam koordinasi melalui gerakan domain yang digabungkan.

Gambar 01: Taq polimerase

Suhu optimal Taq polimerase untuk aktivitasnya adalah 75-80 ° C. Enzim memiliki kemampuan untuk mereplikasi untai DNA 1000 bp dalam waktu kurang dari sepuluh detik pada 72 ° C. Pada 75-80 ° C, enzim mencapai laju polimerisasi yang optimal, yaitu 150 nukleotida per detik per molekul enzim. Penggunaan Taq Polimerase memfasilitasi spesifisitas primer yang tinggi dan mengurangi produksi produk non-spesifik seperti dimer primer.

Apa itu PFU polimerase?

PFU polimerase adalah enzim yang ditemukan di archaeon hiper-termofilik Pyrococcus furiosus. Ini membantu untuk menyalin DNA organisme selama pembelahan sel. Enzim milik keluarga B dari DNA polimerase dan terdiri dari domain eksonuklease 3'-5 '. Mirip dengan Taq polimerase, PFU polimerase juga digunakan untuk memperkuat DNA dalam PCR.

Gambar 02: PFU polimerase

PFU polimerase memiliki sifat termostabil dan proofreading yang tinggi. Enzim memiliki aktivitas proofreading eksonuklease 3'-5 '. Oleh karena itu, ketika DNA berkumpul dari ujung 5' -3 ', aktivitas eksonuklease PFU polimerase akan membantu menghilangkan nukleotida yang tidak cocok dari arah 3' - 5 '. Akibatnya, fragmen PCR yang dihasilkan oleh Pfu Polimerase terdiri dari kesalahan yang lebih sedikit. Pfu polimerase juga menunjukkan kesetiaan replikasi yang lebih tinggi secara signifikan. Namun, Pfu polimerase lebih lambat dan membutuhkan sekitar satu hingga dua menit per siklus untuk amplifikasi pada 72 ° C.

Apa kesamaan antara TAQ dan PFU polimerase?

• TAQ dan PFU polimerase adalah enzim polimerase.
• Selain itu, mereka digunakan sebagai enzim dalam PCR.
• TAQ dan PFU polimerase adalah enzim termostabil.
• Mereka diisolasi dari organisme prokariotik.
• Keduanya terdiri dari aktivitas proofreading exonuclease.

Apa perbedaan antara TAQ dan PFU polimerase?

Taq polimerase memiliki aktivitas proofreading eksonuklease 5'-3 ', sedangkan PFU polimerase memiliki aktivitas proofreading eksonuklease 3'-5'. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara TAQ dan PFU polimerase. Taq polimerase dinamai setelah bakteri Thermus aquaticus, Sementara PFU polimerase dinamai setelah archaeon Pyrococcus furiosus. Selain itu, Taq polimerase termasuk dalam kelompok DNA polimerase sementara PFU polimerase termasuk dalam kelompok DNA polimerase B B.

Infografis di bawah ini menyajikan perbedaan antara TAQ dan PFU polimerase dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan- TAQ vs PFU polimerase

TAQ dan PFU polimerase adalah dua enzim polimerase utama. Taq polimerase memiliki aktivitas proofreading eksonuklease 5'-3 ', sedangkan PFU polimerase memiliki aktivitas proofreading eksonuklease 3'-5'. Ini adalah perbedaan utama antara TAQ dan PFU polimerase. Taq polimerase milik keluarga A, sedangkan PFU polimerase milik keluarga B. Jadi, ini merangkum perbedaan antara TAQ dan PFU polimerase.

Referensi:

1. Ishino, Sonoko, dan Yoshizumi Ishino. “DNA polimerase sebagai reagen yang berguna untuk bioteknologi - sejarah penelitian perkembangan di lapangan."Perbatasan dalam Mikrobiologi, Vol. 5.
2. “PFU DNA polimerase."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.

Gambar milik:

1. "PDB 1KTQ EBI" oleh Jawahar Swaminathan dan Staf MSD di European Bioinformatics Institute - (domain publik) melalui Commons Wikimedia
2. “PFU Polymerase PCNA Pita Kompleks 3A2F Bio R 500” oleh RCSB (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia