Perbedaan antara benzonase dan dnase

Perbedaan Utama - Benzonase vs DNase
 

Degradasi asam nukleat penting untuk banyak teknik biologi molekuler. Ini banyak digunakan dalam teknologi DNA rekombinan untuk menyingkirkan fragmen DNA dan RNA yang tidak diinginkan. Enzim degradasi asam nukleat disebut sebagai nuklease, dan mereka dapat dari berbagai jenis berdasarkan fungsi yang diperlukan. Nuklease yang menurunkan DNA dikenal sebagai DNAS sedangkan yang menurunkan RNA diketahui RNase. Enzim ini sebagian besar digunakan in vitro Eksperimen dimana di dalam Vitro Tes molekuler dilakukan untuk mengisolasi DNA murni, RNA atau protein. Benzonase adalah jenis nuklease yang menurunkan DNA dan RNA sedangkan DNAS hanya menurunkan DNA. Ini adalah perbedaan utama antara benzonase dan dnase.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu benzonase
3. Apa itu dnase
4. Kesamaan antara benzonase dan dnase
5. Perbandingan berdampingan - benzonase vs dnase dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu benzonase?

Benzonase adalah endonuklease yang direkayasa secara genetik dari Serratia Marcescens. Enzim ini diproduksi di E. coli Host dalam Skala Industri. Benzonase mampu membelah DNA untai ganda, DNA linier, DNA melingkar dan RNA untai tunggal. Dengan demikian benzonase penting secara komersial.  Enzim benzonase adalah dimer protein yang memiliki 245 asam amino identik, ~ 30 kDa subunit dengan dua ikatan disulfida penting. Benzonase membelah asam nukleat pada ujungnya 5 'dan menghasilkan fragmen dengan 5'ends gratis. Benzonase dapat membelah asam nukleat pada urutan apa pun tetapi lebih suka daerah kaya GC.

Benzonase disimpan di -20 ⁰C. PH optimal untuk aktivitas enzim ditemukan 8.0 - 9.2. Aplikasi benzonase meliputi persiapan sampel untuk elektroforesis gel 2D protein di mana benzonase menghilangkan asam nukleat terikat dan pengangkatan kontaminan asam nukleat dari persiapan protein rekombinan rekombinan. Ini juga digunakan untuk mengurangi viskositas ekstrak protein dan mencegah penggumpalan sel dalam campuran sel.

Apa itu dnase?

DNase adalah enzim hidrolitik nuklease yang hanya mampu membelah DNA untai ganda. Ada dua jenis utama DNAS: DNase I dan DNase II. DNase I berpartisipasi dalam membelah DNA untai ganda untuk menghasilkan polinukleotida dengan ujung bebas 5 '. DNase II terlibat dalam pembelahan DNA untai ganda untuk menghasilkan untaian polinukleotida dengan ujung atau overhang bebas 3 '.

Dnase i

DNase I berfungsi pada pH optimal antara 7.0 - 8.0. Aktivitas enzim tergantung pada banyak kofaktor ionik yang meliputi, CA²⁺, Mg²⁺ atau mn²⁺. Aktivitas mg²⁺ dan MN²⁺ memutuskan fungsi DNase I. Di hadapan MG²⁺, Dnase I membelah setiap untai dsDNA secara mandiri. Ini terjadi secara acak. Sebaliknya, di hadapan MN^2+, Enzim memecah kedua untai DNA di situs yang kira -kira sama. Pembelahan ini akan menghasilkan dua jenis fragmen DNA; satu jenis dengan ujung tumpul dan jenis lain dengan satu atau dua overhang nukleotida.

Gambar 02: DNase

DNase II

Fungsi DNase II pada pH optimal 4.5-5.0 dan ion logam divalen diperlukan untuk aktivitasnya, mirip dengan DNase I. Mekanisme DNase II diketahui terdiri dari tiga langkah utama.

1. Beberapa istirahat untai tunggal diinduksi dalam tulang punggung DNA.
2. Nukleotida dan oligonukleotida terlarut asam diproduksi.
3. Pergeseran hyperchromic non-linear terjadi pada fase terakhir.

Inhibitor utama enzim DNase termasuk chelator logam, logam transisi dan bahan kimia seperti natrium dodecyl sulfat dan β - mercaptoetanol.

Aplikasi utama DNase termasuk persiapan ekstrak RNA bebas DNA dan ekstrak protein, dan penghapusan DNA templat selama percobaan transkripsi in vitro.

Apa kesamaan antara benzonase dan dnase?

• Keduanya adalah enzim hidrolitik.
• Keduanya adalah nuklease.
• Keduanya berpartisipasi dengan membelah ikatan fosfodiester dari asam nukleat.
• Keduanya membutuhkan pH optimal dan suhu penyimpanan untuk mempertahankan aktivitas enzim.
• Inhibitor enzim termasuk agen pengkelat, logam transisi, dan bahan kimia deterjen.
• Aplikasi terutama difokuskan pada mendapatkan ekstrak kemurnian tinggi DNA, RNA, dan protein.
• Kedua enzim dapat diproduksi melalui rekayasa genetika.

Apa perbedaan antara benzonase dan dnase?

Ringkasan -Benzonase vs DNase

Enzim nuclease banyak digunakan dalam prosedur eksperimental yang berbeda sehubungan dengan biologi molekuler dan rekayasa genetika. Benzonase dan dnase adalah dua jenis nuklease. Benzonase terlibat dalam merendahkan DNA dan RNA sedangkan DNase terlibat dalam pembelahan DNA untai ganda. Ini adalah perbedaan dasar antara benzonase dan dnase. Saat ini, kedua jenis nuklease ini diproduksi melalui teknologi DNA rekombinan yang menghasilkan enzim berkualitas lebih tinggi yang dioptimalkan untuk produksi maksimum.

Unduh versi pdf dari benzonase vs dnase

Anda dapat mengunduh versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi pdf di sini perbedaan antara benzonase dan dnase

Referensi:

1.“Deoxyribonuclease I dari Bovine Pancreas D5025.”Sigma-Aldrich, tersedia di sini. Diakses 19 September. 2017.
2. “Deoxyribonuclease II.”Deoxyribonuclease II - Manual Enzim Worthington, tersedia di sini. Diakses 19 September. 2017.

Gambar milik:

1."Situs Hypersensitive DNase" oleh Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, dkk,. - Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, dkk. (2012) Korelasi antara distribusi situs DNase I hipersensitif dan ekspresi gen dalam sel HeLa S3. PLOS ONE 7 (8): E42414. doi: 10.1371/Jurnal.roti manis.0042414 (CC BY-SA 2.5) Via Commons Wikimedia