Perbedaan antara konsensus PCR dan PAN PCR

Itu perbedaan utama Antara konsensus PCR dan PAN PCR adalah itu Konsensus PCR selalu menargetkan daerah yang dilestarikan sedangkan PAN PCR menargetkan daerah variabel untuk mengidentifikasi berbagai jenis kelompok

Polymerase Chain Reaction (PCR) adalah teknik amplifikasi gen yang terdiri dari tiga langkah utama sebagai denaturasi, anil dan ekstensi. Ini banyak digunakan dalam diagnostik dan identifikasi molekuler. Konsensus PCR dan teknik PCR PAN didasarkan pada target primer yang digunakan setiap tipe PCR.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu konsensus PCR 
3. Apa itu pan PCR
4. Kesamaan antara konsensus PCR dan PAN PCR
5. Perbandingan Berdampingan - Konsensus PCR vs Pan PCR dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu konsensus PCR?

Konsensus PCR adalah teknik PCR yang menargetkan daerah yang dilestarikan untuk spesies atau genera tertentu. Oleh karena itu, daerah yang sangat dilestarikan dipilih untuk amplifikasi. Melalui metode ini, organisme dapat diidentifikasi dan dibedakan berdasarkan konsensus mereka. Metode ini mengidentifikasi wilayah yang dilestarikan untuk spesies tertentu. Misalnya, wilayah bakteri 16S rRNA tetap menjadi daerah yang dilestarikan di antara bakteri. Oleh karena itu, hanya satu set primer yang diperlukan untuk amplifikasi. Dalam kebanyakan kasus, spesifik primer universal dapat digunakan untuk wilayah yang dilestarikan.

Gambar 01: Teknik PCR

Dengan mengikuti metode PCR konsensus, karakterisasi spesies dan hubungan evolusi dapat disimpulkan. Berdasarkan efisiensi amplifikasi organisme sampel tertentu, konsensus organisme terhadap kelompok juga dapat disimpulkan. Selanjutnya, melakukan konsensus PCR sangat penting dalam studi filogenetik. Ini memungkinkan identifikasi suatu spesies dan menafsirkan penyimpangan organisme tertentu yang ditunjukkan dalam hal leluhur bersama.

Apa itu pan PCR?

PAN PCR adalah mode multiplexing dari PCR. Dalam teknik ini, strain yang berbeda diamplifikasi menggunakan berbagai target primer. Target, bagaimanapun, bisa menjadi target umum untuk kelompok regangan. Dengan demikian, dalam pan PCR, lebih dari dua set primer dapat digunakan sekaligus. Ini dapat terjadi dalam metode reaksi tabung tunggal atau sebagai metode reaksi multi-tabung. Pan PCR lebih memakan waktu dan lebih kompleks dibandingkan dengan PCR konsensus. Karena alasan ini, interpretasi hasil PCR mungkin juga lebih kompleks di PRCR PRC.

Aplikasi utama PAN PCR adalah dalam diagnostik molekuler. Ini memungkinkan membedakan antara berbagai jenis spesies dengan amplifikasi target. PAN PCR adalah teknik yang ideal untuk mengidentifikasi berbagai jenis spesies tunggal yang menyebabkan penyakit. Dalam kebanyakan kasus, otomatisasi teknik PAN PCR untuk berbagai kondisi kesehatan sangat penting dan merupakan teknik yang andal dan sangat efisien.

Apa kesamaan antara konsensus PCR dan PRCR?

• Konsensus PCR dan PAN PCR adalah dua jenis teknik PCR.
• Kedua prosedur mengikuti prosedur tiga langkah umum - denaturasi, anil dan ekstensi.
• Mereka menggunakan primer yang spesifik target.
• Kedua reaksi terjadi pada pengendara sepeda termal.
• Reaksi ini bisa otomatis.
• Keduanya dapat digunakan dalam diagnostik dan identifikasi molekuler; Namun, keakuratannya bervariasi.
• Prosedur ini membutuhkan validasi.

Apa perbedaan antara konsensus PCR dan PAN PCR?

Baik konsensus dan PRCR mengikuti prosedur rutin yang sama. Namun, perbedaan utama antara konsensus PCR dan PAN PCR didasarkan pada target primer setiap prosedur menggunakan. Sementara konsensus PCR selalu menargetkan daerah yang dilestarikan, PAN PCR menargetkan daerah variabel untuk mengidentifikasi berbagai jenis kelompok. Karena perbedaan ini, protokol perancangan primer, jumlah set primer yang digunakan, dan aplikasi spesifik bervariasi.

Infografis di bawah ini merangkum perbedaan antara konsensus PCR dan PRCR.

Ringkasan -Konsensus PCR vs Pan PCR

PCR, diperkenalkan oleh Mulli, memainkan peran revolusioner penting dalam aplikasi biologi molekuler. Konsensus dan PRC PCR adalah dua jenis PCR berdasarkan daerah target primer mereka. Sementara konsensus PCR menargetkan daerah yang dilestarikan, PAN PCR menargetkan daerah variabel dan memainkan peran penting dalam identifikasi regangan. Karena perbedaan dasar ini antara konsensus PCR dan PAN PCR, fungsi spesifik dari masing -masing jenis PCR juga bervariasi dari analisis filogenetik hingga karakterisasi molekuler hingga diagnostik molekuler.

Referensi:

1. Merkelbach-Bruse, S, dkk. “Reaksi berantai konsensus polimerase dan uji imunosorben terkait enzim untuk deteksi papillomavirus manusia dan mengetik spesimen serviks.”Patologi Molekuler Diagnostik: The American Journal of Surgical Patology, Bagian B, U.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional, Mar. 1999, tersedia di sini.
2. Yang, Joy Y, dkk. “Pan-PCR, metode komputasi untuk merancang tes pengetik bakteri berdasarkan data urutan seluruh genom.”Jurnal Mikrobiologi Klinis, Masyarakat Amerika untuk Mikrobiologi, MAR. 2013, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Reaksi Rantai Polimerase" oleh Enzoklop - karya sendiri (CC BY -SA 3.0) Via Commons Wikimedia