Itu perbedaan utama antara urutan yang dilestarikan dan konsensus adalah itu Urutan yang dilestarikan mengacu pada urutan asam nukleat yang serupa atau asam amino yang terjadi pada spesies yang berbeda atau yang sama dari generasi ke generasi sementara urutan konsensus adalah urutan nukleotida yang umum ditemui atau urutan asam amino yang ditemukan di daerah DNA atau RNA atau protein yang sangat dilestarikan.
Organisme memiliki karakteristik yang serupa serta berbeda. Saat mempelajari hubungan antara organisme dan mengklasifikasikannya, genom atau susunan genetik organisme sangat penting. Ada beberapa urutan nukleotida atau asam amino yang umum di antara organisme yang berbeda. Urutan yang dilestarikan adalah urutan asam nukleat atau asam amino yang konsisten di antara spesies. Oleh karena itu, mereka secara filogenetik penting saat menghasilkan pohon filogenetik. Dalam urutan yang dilestarikan, ada sekuens nukleotida spesifik yang lebih umum ditemukan. Mereka dikenal sebagai urutan konsensus.
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa urutan yang dilestarikan
3. Apa urutan konsensus
4. Kesamaan antara urutan yang dilestarikan dan konsensus
5. Perbandingan berdampingan - Urutan konsensus yang dilestarikan vs dalam bentuk tabel
6. Ringkasan
Urutan yang dilestarikan adalah urutan asam nukleat atau urutan asam amino yang serupa di antara spesies. Oleh karena itu, konsisten di seluruh spesies di seluruh evolusi. Secara umum, urutan ini dipertahankan oleh seleksi alam. Mereka tetap tidak berubah jauh mendukung pohon filogenetik. Oleh karena itu, urutan yang dilestarikan penting dalam membangun pohon filogenetik. Dipercaya bahwa urutan yang sangat dilestarikan sering memiliki nilai fungsional yang penting. Mereka juga berguna dalam mengidentifikasi penyakit genetik. Namun, sekuens yang dilestarikan mungkin pengkodean atau urutan asam nukleat non-coding. Selain itu, urutan yang dilestarikan menunjukkan tingkat mutasi yang lebih lambat. Oleh karena itu, mereka menunjukkan perubahan yang sangat minim dalam komposisi mereka; Terkadang, mereka tidak menunjukkan perubahan dari seluruh generasi.
Gambar 01: Urutan Konservasi
Komponen RNA ribosom hadir di semua domain kehidupan, urutan homeobox dalam eukariota, dan tmRNA pada bakteri adalah beberapa contoh dari sekuens yang sangat terkonservasi. Identifikasi urutan yang dilestarikan mudah ketika mendekati bioinformatika, terutama alat perataan urutan, digunakan. Selain itu, penyelarasan beberapa urutan memfasilitasi visualisasi urutan yang dilestarikan.
Urutan konsensus adalah urutan yang umumnya ditemukan di wilayah DNA atau RNA yang dilestarikan. Ini adalah urutan nukleotida yang sangat spesifik. Sebagai contoh, ada urutan konsensus di -10 sebagai tataat (kotak pribnow) di E. coli promotor, yang merupakan urutan yang sangat dilestarikan. Demikian pula, ada urutan konsensus lain: TTGaca di E. coli Promotor di -35 juga. Urutan konsensus juga dikenal sebagai "kotak".
Gambar 02: Urutan Konsensus
Selain DNA dan RNA, protein juga memiliki urutan konsensus asam amino. Situs pengikatan protein sering diwakili oleh urutan konsensus. Enzim pembatasan juga memiliki urutan konsensus. Selain itu, situs sambungan juga merupakan urutan konsensus. Mirip dengan urutan yang dilestarikan, urutan konsensus dapat dihitung dan divisualisasikan oleh alat bioinformatika.
Urutan yang dilestarikan adalah urutan asam nukleat atau asam amino yang konsisten di antara spesies sedangkan sekuens konsensus sangat spesifik dan basa atau asam amino yang umum ditemukan di daerah yang dilestarikan tertentu. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara urutan yang dilestarikan dan konsensus. Selain itu, perbedaan lain antara urutan yang dilestarikan dan konsensus adalah bahwa urutan yang dilestarikan secara filogenetik penting sementara sekuens konsensus sering merupakan situs pengikatan protein, situs sambungan, situs pemotongan enzim restriksi, dll.
Urutan yang dilestarikan adalah urutan asam nukleat atau protein yang serupa di antara spesies hidup. Promotor, situs pengikatan ribosom, asal usul replikasi dan urutan asam amino protein histone adalah beberapa contoh dari sekuens yang dilestarikan. Sebaliknya, urutan konsensus adalah basa spesifik atau asam amino yang lebih sering ditemukan dalam urutan yang dikonservasi. -10 kotak, -35 kotak E. coli Promotor, situs pengikatan protein, situs sambungan dan enzim restriksi yang mengenali situs adalah beberapa contoh urutan konsensus. Dengan demikian, ini adalah ringkasan perbedaan antara urutan yang dilestarikan dan konsensus.
1. “Urutan Konservasi”. En.Wikipedia.Org, 2020, tersedia di sini.
1. "Histone Alignment" oleh Thomas Shafee - karya sendiri (CC oleh 4.0) Via Commons Wikimedia
2. “Kozak Consensus Sequence” oleh West0856 di Inggris Wikipedia (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia