Perbedaan antara probe DNA dan RNA

Itu perbedaan utama antara probe DNA dan RNA adalah itu Probe DNA adalah fragmen DNA yang komplementer untuk menargetkan urutan nukleotida sementara probe RNA adalah peregangan RNA untai tunggal yang merupakan sekuens asam nukleat komplementer dari sekuens target.

Probe adalah urutan pendek DNA atau RNA yang disintesis secara artifisial yang dapat diberi label radioaktif atau dengan molekul nonradioaktif. Itu dapat memiliki panjang 100 hingga 1000 pangkalan. Probe berguna dalam mendeteksi urutan nukleotida target yang melengkapi urutan probe. Setelah ditambahkan, probe dapat dihidridisasi dengan urutan komplementer atau urutan target dan membuatnya terlihat untuk mengidentifikasi urutan target karena membawa radioaktivitas. Probe adalah alat molekuler penting untuk di banyak daerah mikroba dan molekuler seperti deteksi penyakit genetik, dalam virologi, dalam patologi forensik, dalam pengujian ayah, dalam sidik jari DNA, RFLP, sitogenetika molekuler, in situ hibridisasi, dll.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu probe DNA
3. Apa itu Probe RNA
4. Kesamaan antara probe DNA dan RNA
5. Perbandingan berdampingan - probe DNA vs RNA dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu probe DNA?

Probe DNA adalah hamparan DNA untai tunggal. Mereka dapat digunakan untuk mendeteksi keberadaan sekuens asam nukleat komplementer (urutan target) dengan hibridisasi. Setelah probe DNA hibridisasi dengan urutan komplementer, ia membentuk hibrida untai ganda. Untuk mendeteksinya, probe DNA umumnya diberi label dengan radioisotop, biotin, epitop atau fluorofor. Probe DNA yang diberi label biotin dapat dideteksi dengan alkali fosfatase berlabel streptavidin dengan sejumlah metode enzimatik dan kimia.

Gambar 01: Probe DNA

Urutan nukleotida dari probe DNA diketahui. Mereka adalah urutan pendek dengan panjang 100 hingga 1000 pasangan basa. Probe DNA panjang dapat dihasilkan oleh teknologi DNA rekombinan. Mereka juga dapat dihasilkan oleh PCR dan kloning. Di laboratorium mikrobiologi klinis, probe DNA sudah tersedia untuk diagnosis cepat penyakit menular.

Apa itu Probe RNA?

Probe RNA adalah bentangan RNA satu untai tunggal. Mereka adalah urutan komplementer untuk menargetkan urutan dalam sampel. Mereka biasanya disintesis dengan RNA polimerase dari bakteriofag SP6, T7, atau T3 oleh in vitro transkripsi DNA. Probe RNA panjang dapat dihasilkan oleh in vitro transkripsi dari DNA plasmid linierisasi. Secara umum, probe RNA sangat mengikat dan lebih ketat dengan urutan komplementernya daripada probe DNA. Mirip dengan probe DNA, probe RNA juga dapat diberi label saat sedang ditranskripsi.

Apa kesamaan antara probe DNA dan RNA?

• Probe DNA dan RNA adalah urutan nukleotida untai tunggal.
• Keduanya dirancang dan disintesis secara artifisial.
• Selain itu, mereka dapat diberi label dengan radioisotop, epitop, biotin atau fluorofor.
• Mereka memiliki afinitas yang kuat terhadap urutan target DNA atau RNA tertentu.
• Mereka digunakan dalam berbagai blotting dan in situ Teknik hibridisasi untuk mendeteksi urutan asam nukleat target.
• Kedua jenis probe dapat dihidridisasi dengan urutan pelengkapnya.
• Mereka juga digunakan dalam identifikasi mikroorganisme dan diagnosis penyakit menular, diwariskan, dan lainnya.

Apa perbedaan antara probe DNA dan RNA?

Probe DNA adalah bentangan pendek DNA yang saling melengkapi dengan urutan target. Di sisi lain, probe RNA adalah bentangan RNA satu-untai pendek yang saling melengkapi dengan urutan target. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara probe DNA dan RNA. Selanjutnya, probe DNA mengandung a, t, c dan g sementara probe RNA mengandung a, u, c dan g.

Selain itu, perbedaan lebih lanjut antara probe DNA dan RNA adalah stabilitas termodinamika mereka. Probe RNA menunjukkan stabilitas termodinamika yang lebih besar dibandingkan dengan probe DNA.

Di bawah infografis Tabulasi perbedaan penting antara probe DNA dan RNA.

Ringkasan -Probe DNA vs RNA

Probe adalah fragmen kecil DNA atau RNA yang digunakan untuk mendeteksi keberadaan urutan spesifik dalam sampel DNA atau RNA dengan hibridisasi molekuler. Probe DNA adalah fragmen DNA untai tunggal pendek sedangkan probe RNA adalah sekuens RNA untai tunggal pendek. Mereka dikenal urutan. Stabilitas termodinamika lebih besar pada probe RNA daripada probe DNA. Probe RNA mengikat dengan erat urutan komplementernya daripada mengikat probe DNA. Dengan demikian, ini merangkum perbedaan antara probe DNA dan RNA.

Referensi:

1. “Probe RNA.”RNA Probe - Tinjauan Umum | Topik ScienceDirect, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. “Lightcycler Probe” (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia