Perbedaan antara elektroforesis gel dan halaman SDS

Perbedaan utama - elektroforesis gel vs halaman SDS
 

Elektroforesis gel adalah teknik yang memisahkan makromolekul dalam medan listrik. Ini adalah metode umum dalam biologi molekuler untuk memisahkan DNA, RNA dan protein dari campuran sesuai dengan ukuran molekulnya. Halaman SDS adalah jenis elektroforesis gel yang digunakan untuk memisahkan protein dari campuran protein berdasarkan ukurannya. Elektroforesis gel adalah istilah yang digunakan untuk merujuk pada teknik normal yang diterapkan untuk DNA, RNA, dan pemisahan protein ketika Halaman SDS adalah salah satu jenis elektroforesis gel. Ini adalah perbedaan utama antara elektroforesis gel dan halaman SDS.

ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu elektroforesis gel
3. Apa itu halaman SDS
4. Perbandingan berdampingan - elektroforesis gel vs halaman SDS
5. Ringkasan

Apa itu elektroforesis gel?

Elektroforesis gel adalah teknik umum yang digunakan di laboratorium untuk memisahkan molekul bermuatan seperti DNA, RNA, protein, dll. dari campuran mereka. Gel digunakan dalam elektroforesis gel. Itu bertindak sebagai saringan molekuler. Ada dua jenis gel yang digunakan dalam elektroforesis gel yaitu agarosa dan poliakrilamida. Pemilihan persiapan gel dan gel adalah faktor penting yang harus dipertimbangkan dalam elektrofores gel karena ukuran pori gel harus dimanipulasi dengan hati -hati untuk pemisahan molekul yang baik melalui elektroforesis gel. Elektroforesis gel memiliki medan listrik yang terhubung ke dua ujung gel. Salah satu ujung gel menunjukkan muatan positif sementara ujung lainnya bermuatan negatif.

DNA dan RNA adalah molekul bermuatan negatif. Setelah mereka dimuat ke dalam gel dari ujung negatif gel dan diterapkan pada medan listrik, mereka bermigrasi melalui pori -pori gel ke ujung gel yang bermuatan positif. Kecepatan migrasi tergantung pada muatan dan ukuran molekul. Molekul yang lebih kecil dengan mudah bermigrasi melalui pori -pori gel daripada molekul yang lebih besar. Oleh karena itu, molekul yang lebih kecil menempuh jarak jauh melalui gel dan molekul yang lebih besar menempuh jarak pendek. Untuk mengamati perjalanan molekul pada gel, jenis pewarna khusus digunakan. Medan listrik diterapkan untuk periode waktu tertentu dan berhenti untuk mencegah hilangnya molekul dan untuk menjaga molekul pada posisi yang ditempuhnya. Pita yang berbeda dapat diamati dalam gel. Pita -pita ini mewakili molekul dari berbagai ukuran. Oleh karena itu, elektroforesis gel berguna untuk membedakan molekul sesuai dengan ukurannya.

Elektroforesis gel dimasukkan ke dalam berbagai teknik sebagai teknik preparatif dalam biologi molekuler seperti PCR, RFLP, kloning, sekuensing DNA, blotting selatan, pemetaan genom, dll.

Gambar 01: elektroforesis gel agarosa

Apa itu halaman SDS?

Elektroforesis gel sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel (Halaman SDS) adalah jenis elektroforesis gel yang digunakan untuk memisahkan protein. Ketika elektroforesis gel digunakan untuk memisahkan protein, perawatan khusus diperlukan karena protein tidak diisi secara negatif seperti DNA dan RNA dan tidak bermigrasi ke ujung positif atau ujung negatif. Oleh karena itu, protein didenaturasi dan dilapisi dengan muatan negatif sebelum elektroforesis gel. Ini dilakukan dengan menggunakan deterjen yang disebut natrium dodecyl sulfate (SDS). Elektroforesis gel yang menggunakan SDS dan gel poliakrilamida untuk media pendukung dikenal sebagai halaman SDS. Teknik ini umumnya digunakan dalam biokimia, genetika, forensik dan biologi molekuler.

Selama halaman SDS, protein dicampur dengan SDS. SDS membuka protein menjadi bentuk linier dan melapisinya dengan muatan negatif yang sebanding dengan massa molekulnya. Karena muatan negatif, molekul protein bermigrasi menuju ujung muatan positif dari gel dan terpisah sesuai dengan massa molekulnya. Di halaman SDS, poliakrilamida digunakan sebagai dukungan yang solid untuk gel. Pemisahan protein yang sebenarnya terutama tergantung pada sifat gel. Oleh karena itu, persiapan gel poliakrilamida harus dilakukan dengan cermat dan konsentrasi poliakrilamida yang benar harus digunakan. Gel poliakrilamida menunjukkan resolusi tinggi daripada gel agarosa. Oleh karena itu, halaman SDS dianggap sebagai teknik resolusi tinggi untuk pemisahan protein.

Halaman SDS adalah jenis elektroforesis gel denaturasi. Ini memiliki keterbatasan besar dalam analisis protein. Karena SDS mendenaturasi protein sebelum pemisahan, itu tidak memungkinkan deteksi aktivitas enzimatik, interaksi pengikatan protein, kofaktor protein, dll.

Gambar 02: Halaman SDS

Apa perbedaan antara elektroforesis gel dan halaman SDS?

Ringkasan -Elektroforesis Gel vs Halaman SDS

Elektroforesis gel adalah teknik umum yang digunakan untuk pemisahan dan analisis DNA, RNA dan protein berdasarkan ukuran dan muatannya. Ada dua jenis utama elektroforesis gel yaitu elektroforesis gel agarosa dan elektroforesis gel poliakrilamida. Gel agarosa digunakan terutama untuk pemisahan asam nukleat; Ketika resolusi yang lebih tinggi diperlukan, gel poliakrilamida digunakan. Halaman SDS adalah jenis elektroforesis gel yang biasa digunakan untuk memisahkan campuran protein yang kompleks. Ini dianggap sebagai teknik pemisahan protein resolusi tinggi. Ini adalah perbedaan antara elektroforesis gel dan halaman SDS.

Referensi:
1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig, dan David H. Petering. “Native SDS-PAGE: Pemisahan elektroforetik resolusi tinggi protein dengan retensi sifat asli termasuk ion logam terikat. www.NCBI.nlm.nih.pemerintah. N.P., Mei 2014. Web. 7 Apr. 2017
2. Stellwagen, Nancy C. “Elektroforesis DNA dalam gel agarosa, gel poliakrilamida dan dalam larutan gratis.”Elektroforesis. U.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional, Juni 2009. Web. 07 Apr. 2017

Gambar milik:
1. “GelelektrophoreseApparatur” (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia
2. “DNA Agarose Gel Electrophoresis” oleh Sekolah Sumber Daya Alam dari Ann Arbor - DNA Lab (CC oleh 2.0) Via Commons Wikimedia