Blotting adalah teknik penting untuk mendeteksi urutan spesifik DNA, RNA, dan protein dari campuran mereka dalam biologi molekuler. Itu dilakukan dengan menggunakan membran yang disebut blot. Ada berbagai teknik blotting seperti Northern, Southern dan Western blotting. Memilih membran yang tepat untuk proses blotting harus dilakukan dengan cermat untuk mencegah pengikatan spesifik dan deteksi yang salah. Nitroselulosa, Nilon, dan PVDF biasanya digunakan membran dalam teknik blotting. Mereka memiliki karakteristik yang berbeda. Perbedaan utama antara nitroselulosa dan membran nilon adalah bahwa itu membran nitroselulosa memiliki potensi imobilisasi protein tinggi sedangkan membran nilon memiliki potensi imobilisasi asam nukleat yang tinggi. Namun, kedua jenis membran sering digunakan dalam teknik blotting.
ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu membran nitroselulosa
3. Apa itu membran nilon
4. Perbandingan berdampingan -nitroselulosa vs membran nilon
5. Ringkasan
Membran nitroselulosa adalah filter membran yang umum digunakan dalam teknik asam nukleat dan protein. Ini memiliki potensi pengikatan protein yang tinggi. Oleh karena itu, membran nitroselulosa banyak digunakan dalam teknik blotting barat. Membran nitroselulosa kompatibel dengan semua teknik hibridisasi dan menunjukkan kapasitas pengikatan yang unggul tanpa gangguan. Membran nitroselulosa bersifat hidrofilik alami. Mereka membuat interaksi hidrofilik dengan molekul dan secara efisien melumpuhkannya ke dalam membran. Membran nitroselulosa komersial tersedia dalam dua ukuran pori: 0.45 dan 0.2 μm.
Gambar 01: Membran nitroselulosa yang digunakan di Western blotting
Membran nilon adalah jenis lain dari membran komersial yang digunakan dalam teknik blotting. Itu alternatif digunakan dengan membran nitroselulosa untuk blotting selatan dan utara. Membran nilon ideal untuk blotting selatan daripada nitroselulosa karena afinitasnya yang tinggi untuk mengikat dengan DNA. Karena beberapa fitur unik membran nilon, para peneliti biasanya menggunakan membran nilon untuk blotting selatan dan utara alih -alih lebih dari membran nitroselulosa. Membran nilon juga direkomendasikan untuk stripping dan reprobing, tidak seperti nitroselulosa.
Gambar 02: membran nilon yang digunakan untuk blotting selatan
Membran nitroselulosa vs nilon | |
Membran nitroselulosa rapuh. | Membran nilon kurang rapuh. |
Penanganan | |
Mereka sulit ditangani. | Mereka mudah ditangani. |
Reprobing | |
Membran nitroselulosa yang tidak didukung sulit untuk ditegur. | Penanggulangannya mudah dengan membran nilon. |
Kompatibilitas dengan berbagai kondisi penyimpanan | |
Membran nitroselulosa memiliki kekuatan yang lebih sedikit untuk menahan berbagai kondisi penyimpanan. | Membran nilon merespons lebih kuat terhadap berbagai kondisi penyimpanan. |
Menggunakan | |
Diperlukan prewetting. | Prewetting tidak diperlukan untuk membran nilon. |
Sifat hidrofilik | |
Membran nitroselulosa bersifat hidrofilik tetapi kurang hidrofilik daripada membran nilon. | Mereka sangat hidrofilik. |
Potensi imobilisasi | |
Membran nitroselulosa memiliki afinitas yang lebih sedikit untuk asam nukleat. Tetapi memiliki afinitas tinggi terhadap protein. | Membran nilon memiliki potensi pengikatan yang tinggi dengan asam nukleat daripada membran nitroselulosa. |
Membran nitroselulosa dan nilon adalah lembaran khusus yang digunakan dalam teknik blotting untuk mereproduksi pola banding pada gel. Mereka memungkinkan kemungkinan mendeteksi urutan tertentu atau protein dari campuran dengan melumpuhkannya pada membran. Setelah molekul diimobilisasi pada membran, dapat digunakan sebagai substrat untuk analisis hibridisasi dengan probe berlabel. Membran nitroselulosa biasanya digunakan untuk deteksi protein dalam teknik blotting barat karena afinitas pengikatannya yang tinggi dengan protein. Membran nilon sering digunakan untuk blotting selatan dan utara. Inilah perbedaan antara nitroselulosa dan membran nilon.
Referensi:
1. Hayes, hlm. C., C. R. Serigala, dan j. D. Hayes. “Teknik blotting untuk studi DNA, RNA, dan protein.BMJ: British Medical Journal. U.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional, 14 Okt. 1989. Web. 07 Apr. 2017
2. Mahmood, Tahrin, dan Ping-Chang Yang. “Western blot: teknik, teori, dan pemotretan masalah.Jurnal Ilmu Kedokteran Amerika Utara. Medknow Publications & Media Pvt Ltd, September. 2012. Web. 07 Apr. 2017
Gambar milik:
1. "Transfer Western Blot" oleh Bensaccount di Inggris Wikipedia (CC oleh 3.0) Via Commons Wikimedia