Perbedaan antara DNA genomik dan isolasi DNA plasmid

Itu perbedaan utama antara DNA genomik dan isolasi DNA plasmid adalah bahwa Isolasi DNA genomik menargetkan ekstraksi DNA genom sedangkan isolasi DNA plasmid menargetkan ekstraksi DNA plasmid bakteri.

Isolasi DNA adalah proses kimia yang digunakan untuk mengisolasi DNA dari spesies yang berbeda atau dari sampel yang berbeda. Isolasi DNA penting dalam teknik biologi molekuler hilir, seperti elektroforesis gel, reaksi berantai polimerase dan teknik sekuensing DNA. Oleh karena itu, isolasi DNA adalah proses kimia penting dalam studi biologis molekuler. Berdasarkan tujuan penelitian, kadang -kadang perlu untuk mengisolasi DNA genomik. Selain itu, beberapa penelitian fokus pada mengisolasi DNA plasmid dari bakteri. Isolasi DNA genom adalah proses mengisolasi DNA genomik dari sampel prokariotik atau eukariotik. Langkah -langkah isolasi berbeda sesuai dengan jenis sel di mana DNA mengisolasi. Isolasi DNA plasmid adalah proses mengisolasi DNA plasmid dari sel bakteri. Dibandingkan dengan isolasi DNA genomik, proses keseluruhan kompleks dalam isolasi DNA plasmid.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu isolasi DNA genomik
3. Apa itu isolasi DNA plasmid
4. Kesamaan antara DNA genomik dan isolasi DNA plasmid
5. Perbandingan berdampingan - DNA genomik vs isolasi DNA plasmid dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu isolasi DNA genomik?

Isolasi DNA genom adalah proses mengekstraksi seluruh DNA genom suatu organisme. Proses khusus ini melibatkan tiga acara utama. Mereka adalah, lisis sel atau lisis nuklir, degradasi protein atau proteolisis dan presipitasi DNA genomik. Langkah lisis mungkin berbeda sesuai dengan jenis sel. Dalam prokariota, karena ada dinding sel peptidoglikan, langkah pertama harus menjadi kerusakan dinding sel. Di sisi lain, dalam eukariota, langkah lisis melibatkan pemecahan membran plasma dan membran nuklir untuk mengambil DNA ke eksterior. Sebaliknya, langkah -langkah khusus sangat penting untuk mengisap dinding tanaman dan sel jamur.

Gambar 01: Isolasi DNA genomik

Akibatnya, setelah langkah lisis selesai, akhirnya DNA akan datang ke supernatan. Secara bersamaan, degradasi protein juga terjadi dalam larutan karena penambahan proteinase k. Langkah selanjutnya adalah memisahkan DNA genom dan protein terdegradasi dari satu sama lain. Oleh karena itu, protein terdegradasi terpisah dengan presipitasi yang memungkinkan DNA genom tetap berada di supernatan. Setelah presipitasi protein, DNA genomik dapat diendapkan dan ditangguhkan kembali dalam buffer yang sesuai sampai membutuhkan percobaan.

DNA genomik, yang merupakan DNA linier mengandung semua informasi genetik suatu organisme. Dengan kata lain, genom adalah bahan keturunan dari organisme hidup yang bertanggung jawab atas semua aktivitas struktural dan fungsional sel sel. Ini terdiri dari urutan pengkodean dan non-coding DNA. Saat mengisolasi DNA genomik, itu termasuk seluruh genom organisme.

Apa itu isolasi DNA plasmid?

Isolasi DNA plasmid adalah proses isolasi DNA yang istimewa dan lebih rumit. Plasmid adalah DNA ekstrachromosomal yang ada di sebagian besar sel bakteri. Mereka adalah DNA sirkular yang tidak aktif yang mendukung bakteri untuk bertahan hidup dalam kondisi lingkungan yang keras. DNA plasmid terdiri dari gen resistan khusus yang memberikan keuntungan tambahan untuk bakteri seperti resistensi antibiotik, sifat virulensi dan sifat toksik.

Gambar 02: Isolasi DNA plasmid

Isolasi DNA plasmid juga melibatkan tiga proses utama; Lisis sel, proteinolisis dan presipitasi DNA. Meskipun mekanisme isolasi biokimia mirip dengan isolasi DNA genomik, prosesnya lebih kompleks dari itu. Proses lisis sel adalah proses terpenting dalam prosedur ini. Yang terpenting, DNA genom dan DNA plasmid tidak boleh dicampur satu sama lain. Oleh karena itu, proses lisis yang jauh lebih ringan dimasukkan ke dalam prosedur isolasi DNA plasmid. Oleh karena itu, dalam sebagian besar prosedur isolasi DNA plasmid menggunakan deterjen; Sodium dodecyl sulfate untuk lisis sel.

Apa kesamaan antara DNA genomik dan isolasi DNA plasmid?

• DNA genomik dan isolasi DNA plasmid fokus pada ekstraksi DNA suatu organisme.
• Keduanya mengikuti proses keseluruhan yang sama yang meliputi lisis sel, degradasi protein dan presipitasi DNA.
• Selain itu, DNA yang dihasilkan dari kedua proses itu penting untuk proses hilir.
• Selain itu, kedua proses isolasi mencakup langkah -langkah untuk memurnikan dan menyimpan DNA di bawah kondisi penyimpanan yang ditentukan.
• Selain itu, proteinase K digunakan dalam kedua metode untuk mendegradasi protein.

Apa perbedaan antara DNA genomik dan isolasi DNA plasmid?

Isolasi DNA genomik berfokus pada mengekstraksi seluruh DNA genom dari organisme target sementara isolasi DNA plasmid berfokus pada mengisolasi DNA plasmid dari spesies bakteri tertentu. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan utama antara DNA genomik dan isolasi DNA plasmid. Selain itu, perbedaan lain antara DNA genomik dan isolasi DNA plasmid adalah dalam prosedur. Isolasi DNA genom adalah prosedur yang kurang kompleks dibandingkan dengan isolasi DNA plasmid. Oleh karena itu, ketika mengisolasi DNA plasmid, perlu untuk mengambil tindakan pencegahan untuk mencegah pencampuran DNA genomik dan plasmid satu sama lain.

Infograohic di bawah ini memberikan rincian lebih lanjut tentang perbedaan antara DNA genomik dan isolasi DNA plasmid.

Ringkasan -DNA genomik vs isolasi DNA plasmid

Isolasi DNA adalah proses penting dalam teknik biologi molekuler. Ada dua jenis DNA yaitu DNA genomik dan DNA plasmid (DNA ekstra-kromosom). Berdasarkan persyaratan, beberapa prosedur yang dilakukan untuk mengisolasi DNA genomik sementara beberapa prosedur fokus mengisolasi hanya DNA plasmid dari bakteri. Oleh karena itu, langkah -langkah yang terlibat dalam kedua proses sedikit berbeda satu sama lain. Namun, proses keseluruhannya sama di kedua isolasi. DNA terisolasi dari kedua proses memiliki penggunaan yang sangat besar dalam proses hilir seperti kloning, elektroforesis gel dan reaksi rantai polimerase. Pada akhir protokol isolasi DNA genomik, seluruh DNA genom organisme dapat diisolasi sebagai produk akhir sementara pada akhir protokol isolasi DNA plasmid, DNA plasmid dari masing -masing bakteri dapat diisolasi sebagai produk akhir. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan antara DNA genomik dan isolasi DNA plasmid.

Referensi:

1.“Ekstraksi DNA dari bakteri." Ekstraksi DNA dari bakteri. Tersedia disini 

Gambar milik:

1."Ekstraksi DNA" oleh Joo Nath - karya sendiri, (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia 
2.”Miniprep Plasmid” oleh Retama - karya sendiri, (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia