Metabolit adalah molekul kecil yang terlibat dalam reaksi metabolisme dalam sel. Metabolit termasuk perantara metabolik, hormon, metabolit sekunder, molekul pensinyalan, dll. Mereka adalah molekul fungsi reaksi biokimia sel. Satu set lengkap metabolit sampel biologis atau organisme tunggal dikenal sebagai metabolome. Metabolome adalah koleksi dinamis yang berubah setiap detik di dalam tubuh. Metabolomik dan metabonomi adalah dua istilah yang terkait dengan studi metabolom suatu organisme. Perbedaan utama antara metabolomik dan metabonomi adalah bahwa Metabolomik lebih peduli tentang metabolisme endogen normal dan profil metabolik pada tingkat seluler atau organ ketika Metabonomi lebih peduli dengan memperluas profil metabolik dengan informasi gangguan metabolisme karena faktor lingkungan, penyakit, mikroorganisme usus dan membandingkan profil metabolik, dll. Metabolomik terutama didorong oleh spektrometri massa, dan metabonomi menggunakan spektroskopi NMR untuk analisis metabolit.
ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu metabolomik
3. Apa itu metabonomi
4. Perbandingan berdampingan - metabolomik vs metabonomi
5. Ringkasan
Metabolomik adalah studi tentang proses metabolisme yang terjadi dalam sel, biofluida, jaringan atau organisme. Ini termasuk identifikasi dan kuantifikasi metabolit seluler menggunakan alat analitik dan statistik yang baik. Metabolomik dianggap sebagai studi penting karena mengungkapkan informasi tentang metabolisme suatu organisme.
Untuk mempelajari substrat dan produk reaksi metabolik, metabolomik menggunakan spektrometri massa sebagai platform analitik. Spektrometri massa mengungkapkan jenis metabolit dan konsentrasinya, mencerminkan keadaan biokimia sel atau jaringan yang sebenarnya. Oleh karena itu, metabolomik dapat dianggap sebagai perwakilan terbaik dari fenotipe molekuler suatu organisme. Metabolomik adalah teknologi omic dari molekul kecil organisme dan dibandingkan dengan studi OMIC lainnya; Metabolomik sangat penting karena secara langsung mencerminkan status reaksi biokimia saat ini.
Metabolomik juga dapat dianggap sebagai perpanjangan proteomik karena dihasilkan karena aktivitas enzim yang merupakan protein seperti yang ditunjukkan pada gambar berikut.
Gambar 01: Skema Metabolomik
Metabonomi didefinisikan sebagai pengukuran kuantitatif respons metabolik multiparametrik pada waktu tertentu dalam kaitannya dengan tekanan patofisiologis atau modifikasi genetik. Ini biasanya diterapkan pada penelitian yang dilakukan tentang nutrisi manusia dan respons terhadap obat atau penyakit. Pendekatan ini dipelopori oleh Jeremy Nicholson di Imperial College, London dan telah digunakan di sejumlah bidang termasuk toksikologi, diagnosis penyakit, nutrisi, dll. Secara historis, metabonomi adalah salah satu metode pertama untuk menerapkan ruang lingkup biologi sistem untuk studi metabolisme.
Metabonomi lebih peduli tentang membandingkan profil biokimia daripada mengidentifikasi senyawa metabolisme individu dalam metabolomik. Oleh karena itu, metabonomi dapat didefinisikan sebagai subset metabolomik. Ini terutama menekankan perbandingan profil metabolik populasi yang berbeda sehubungan dengan penyakit, tekanan lingkungan, modifikasi genetik, nutrisi, obat -obatan, dll. Karena metabolit adalah penanda baik yang menandakan kondisi penyakit, efek obat, tekanan lingkungan, paparan racun, dll.
Studi metabonomi mengungkapkan metabolit intraseluler dan ekstraseluler. Ini menggunakan teknik throughput tinggi untuk menganalisis sejumlah besar metabolit secara bersamaan dan berulang kali, memungkinkan penyelidikan temporal dari status fisiologis sel. Ini juga mengungkapkan korelasi antara metabolit dan status patologis organisme. Untuk mendukung studi metabonomi, genomik dan proteomik dapat digunakan karena mereka saling terkait seperti yang ditunjukkan pada gambar di atas.
Metabolomik vs Metabonomi | |
Metabolomik adalah studi tentang set lengkap metabolit suatu organisme | Metabonomi adalah studi kuantitatif dari respons metabolik multiparametrik dari sistem kehidupan dalam dasar temporal terhadap rangsangan patofisiologis atau modifikasi genetik. |
Perhatian utama | |
Metabolomik lebih peduli dengan profil metabolik dan mengidentifikasi metabolit individu yang ada dalam sel. | Metabonomi lebih peduli dengan membandingkan metabolit atau profil metabolik populasi dalam kaitannya dengan modifikasi genetik, penyakit, tekanan lingkungan, rangsangan patologis, obat -obatan, dll. |
Informasi | |
Metabolomik terutama difokuskan pada metabolisme endogen. | Metabonomi tidak terbatas pada metabolisme endogen. Ini meluas untuk menemukan informasi tentang gangguan metabolisme yang disebabkan oleh faktor internal dan eksternal seperti pola makanan, racun, proses penyakit, dll. |
Alat analitik | |
Menggunakan spektrometri massa sebagai platform analitik utama | Metabonomi menggunakan spektroskopi NMR sebagai platform analitik utama. |
Metabolom mewakili set lengkap molekul kecil yang disebut metabolit yang ada dalam sel atau dalam suatu organisme. Metabolomik adalah studi tentang seluruh metabolom untuk menghasilkan profil metabolisme. Metabolomik memungkinkan para ilmuwan untuk mengukur status fisiologis sel atau organisme yang sebenarnya. Metabonomi adalah bagian dari metabolomik yang meluas untuk mengekstraksi informasi tentang respons metabolisme multiparametrik dari sistem kehidupan terhadap rangsangan patofisiologis dan modifikasi genetik. Metabonomi tidak hanya peduli dengan profil metabolik individu seperti metabolomik; Ini membandingkan profil metabolik dalam kaitannya dengan faktor -faktor lain seperti tekanan lingkungan, penyakit, racun, dll. Baik metabolomik dan metabonomi melibatkan studi metabolit organisme untuk mengukur status fisiologis sel yang sebenarnya. Oleh karena itu, kadang -kadang keduanya dianggap sebagai sinonim, tanpa mempertimbangkan perbedaan antara metabolomik dan metabonomi.
Referensi:
1. Roessner, Ute, dan Jairus Bowne. “Apa itu metabolomik."Bioteknik - apa itu metabolomik? N.P., Apr. 2009. Web. 24 Apr. 2017
2. Jeremy J. Ramsden (1). “Metabolomik dan metabonomi."Springer. Springer London, 01 Jan. 1970. Web. 25 Apr. 2017
Gambar milik:
1. “Skema Metabolomik” oleh LMAPS (Talk) - Karya Sendiri (CC BY -SA 3.0) Via Commons Wikimedia