Perbedaan antara proteomik dan metabolomik

Itu perbedaan utama Antara proteomik dan metabolomik adalah itu Proteomik adalah studi tentang semua protein dari suatu organisme sementara metabolomik adalah studi dari semua metabolit suatu organisme.

Genomik adalah studi tentang susunan genetik suatu organisme. Proteomik dan metabolomik adalah dua ilmu omic yang terkait dengan genomik. Proteome mengacu pada semua protein dalam sel atau organisme. Metabolome, di sisi lain, mengacu pada semua metabolit suatu organisme. Dengan demikian, studi tentang proteom adalah proteomik sedangkan studi metabolom adalah metabolomik. Baik proteomik dan metabolomik penting dalam diagnostik penyakit dan karakterisasi dan skrining organisme. Selain itu, keduanya terhubung dalam banyak aspek biologi sel, terutama dalam pensinyalan sel, degradasi protein dan generasi dan modifikasi pasca-translasi.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu proteomik
3. Apa itu metabolomik
4. Kesamaan antara proteomik dan metabolomik
5. Perbandingan berdampingan - proteomik vs metabolomik dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu proteomik?

Proteome adalah pelengkap protein total dalam sel, jaringan atau organisme. Oleh karena itu, proteomik adalah studi tentang proteome suatu organisme. Dalam proteomik, karakteristik protein yang berbeda dianalisis. Oleh karena itu, proteomik terutama berfokus pada struktur, orientasi, fungsi, interaksi protein, modifikasi, aplikasi dan pentingnya protein. Itulah sebabnya banyak proyek penelitian dilakukan di bidang proteomik saat ini.

Studi proteomik pertama dilakukan untuk mengidentifikasi kandungan protein di Escherichia coli. Pemetaan kadar protein total dilakukan dengan menggunakan gel dua dimensi (2D). Setelah keberhasilan proyek ini, para ilmuwan beralih untuk mengkarakterisasi kandungan protein total pada hewan seperti kelinci percobaan dan tikus. Saat ini, pemetaan protein manusia dilakukan dengan menggunakan elektroforesis gel 2D.

Ada banyak keuntungan mempelajari proteomik karena protein adalah molekul yang mengatur sebagian besar aktivitas karena sifat katalis protein. Dengan demikian, studi tentang seluruh protein dapat memberikan informasi mengenai status kesehatan suatu organisme. Selain itu, proteomik memiliki banyak aplikasi dalam anotasi genom, identifikasi penyakit dan diagnostik, melakukan studi ekspresi protein selama eksperimen dan modifikasi protein dan studi interaksi, dll.

Gambar 01: Proteomik

There are different techniques involved in proteomics, including the extraction of the total protein, separation of them using 2D gel electrophoresis, sequencing of the extracted proteins using methods such as Edmund's sequencing method or mass spectrometry and analysis of structural and functional properties of the protein using alat perangkat lunak dan bioinformatika berbasis komputer.

Apa itu metabolomik?

Metabolomik adalah studi dari semua metabolit dalam sel, jaringan atau organisme. Ini mencakup identifikasi dan kuantifikasi metabolit seluler menggunakan berbagai alat analitik dan statistik canggih. Metabolomik adalah studi penting karena mengungkapkan informasi mengenai metabolisme suatu organisme.

Gambar 02: Metabolomik

Untuk mempelajari substrat dan produk reaksi metabolik, metabolomik menggunakan spektrometri massa sebagai platform analitik. Spektrometri massa menghasilkan metabolit dan konsentrasinya, mencerminkan keadaan biokimia sel atau jaringan yang sebenarnya. Oleh karena itu, metabolomik dapat dianggap sebagai representasi terbaik dari fenotip molekul suatu organisme. Selain itu, metabolomik dapat dianggap sebagai perpanjangan proteomik karena sebagian besar metabolit dihasilkan karena aktivitas enzim yang merupakan protein.

Apa kesamaan antara proteomik dan metabolomik?

• Proteomik dan metabolomik adalah dua ilmu omic yang terkait dengan genomik.
• Metabolomik dapat dianggap sebagai perpanjangan dari proteomik.
• Proteome dan metabolom terkait erat dengan banyak penelitian.

Apa perbedaan antara proteomik dan metabolomik?

Proteomik adalah studi skala besar protein termasuk struktur dan fungsinya, dalam sel atau organisme. Sementara itu, metabolomik adalah studi tentang profil metabolit dalam sel, jaringan atau organisme dalam serangkaian kondisi tertentu. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara proteomik dan metabolomik. Selain itu, proteomik terutama menyangkut serangkaian protein lengkap sementara metabolomik terutama menyangkut set lengkap metabolit, termasuk beragam molekul kecil seperti peptida, karbohidrat, lipid, nukleosida, dan produk katabolik senyawa eksogen, dll. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan lain antara proteomik dan metabolomik.

Infografis di bawah ini merangkum perbedaan antara proteomik dan metabolomik.

Ringkasan -Proteomik vs Metabolomik

Organisme hidup dapat dipelajari dengan menggunakan genom, protein, dan metabolitnya. Genomik, proteomik dan metabolomik adalah tiga bidang yang mempelajari make-up genetik, protein dan metabolit sel atau organisme, masing-masing. Proteomik penting karena merupakan cerminan dinamis dari kedua gen dan lingkungan. Metabolomik sangat penting karena secara langsung mencerminkan status reaksi biokimia sel saat ini atau status metabolisme suatu organisme. Dengan demikian, ini merangkum perbedaan antara proteomik dan metabolomik.

Referensi:

1. P, Surat. “Bagaimana metabolome dan proteome terkait?Berita, 26 Feb. 2019, tersedia di sini.
2. Horgan, Richard P, dan Louise C Kenny. “Tinjauan Sac 'Omic' Teknologi: Genomik, Transkriptomik, Proteomik dan Metabolomik.”Obstetri dan Ginekologi, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18 Juli 2011, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Proteomik" oleh XXL7441 di Wikibooks Inggris - ditransfer dari EN.wikibooks ke commons. (Domain publik) via commons wikimedia
2. "Skema Metabolomik" oleh LMAPS (Talk) - Saya membuat karya ini sepenuhnya oleh diri saya (CC BY -SA 3.0) Via Commons Wikimedia