Perbedaan antara Synteny dan Collinearity

Itu perbedaan utama Antara synteny dan collinearity adalah itu Synteny adalah co-lokalisasi fisik lokus genetik pada kromosom yang sama pada spesies, sedangkan collinearity adalah co-lokalisasi fisik lokus genetik pada kromosom yang sama pada spesies yang berbeda yang melestarikan urutan yang sama.

Synteny dan collinearity adalah dua istilah yang digunakan secara bergantian dalam genomik. Kedua istilah menggambarkan pola lokalisasi gen pada kromosom pada spesies yang berbeda. Pengaturan gen terkait ini di antara taksa adalah informasi yang berharga saat menyimpulkan keturunan gen yang dibagikan. Synteny mengacu pada co-lokalisasi fisik lokus genetik pada kromosom yang sama pada spesies. Collinearity mengacu pada co-lokalisasi fisik lokus genetik pada kromosom yang sama pada spesies yang berbeda yang melestarikan urutan yang sama. Oleh karena itu, itu adalah bentuk synteny.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu synteny 
3. Apa itu collinearity
4. Kesamaan antara sintreny dan collinearity
5. Perbandingan berdampingan - Synteny vs collinearity dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu synteny?

Pada spesies yang berbeda, ada satu set gen yang terletak di kromosom yang sama. Dan, co-lokalisasi fisik gen ini pada kromosom yang sama pada spesies yang berbeda dikenal sebagai Synteny. Juga, gen -gen ini ditemukan sangat dekat satu sama lain pada satu kromosom. Urutan gen mungkin tidak selalu sama. Tapi, lokalisasi gen dekat satu sama lain pada kromosom yang sama terjadi secara synteny. Oleh karena itu, Synteny terutama menggambarkan pola distribusi gen pada kromosom. Pola-pola co-lokalisasi gen ini menunjukkan hubungan antara spesies yang berbeda dan evolusinya. Namun, synteny dapat terganggu karena penataan ulang kromosom seperti translokasi, inversi dan fusi kromosom, dll. Duplikasi, kehilangan dan rekombinasi homolog yang tidak setara.

Gambar 01: Synteny

Dipercayai bahwa semua gen yang terhubung bersifat sintenik. Namun, tidak semua gen syntenik harus dihubungkan. Mereka memiliki urutan kromosom yang umum. Manusia memiliki banyak gen sintenik dengan mamalia lain. Selain itu, banyak sereal memiliki gen sintenik.

Apa itu collinearity?

Collinearity adalah bentuk sintrain yang lebih spesifik di mana satu set gen terletak pada kromosom yang sama dari spesies yang berbeda dalam urutan yang sama seperti pada spesies leluhur. Oleh karena itu, jika ada penyimpangan dari collinearity, itu akan menjadi karakter filogenetik yang lebih andal karena collinearity menjelaskan keturunan gen bersama.

Gambar 02: Collinearity

Analisis kolinearitas multiway memberikan informasi yang jauh lebih dapat diandalkan tentang spesies terkait dan filogeni mereka.

Apa kesamaan antara sintreny dan collinearity?

• Baik sinteny dan collinearity, satu set lokus dalam dua spesies yang berbeda terletak di kromosom yang sama.
• Istilah-istilah ini menggambarkan co-lokalisasi fisik lokus genetik pada kromosom yang sama.
• Collinearity adalah bentuk yang lebih spesifik dari Synteny.
• Terkadang kedua istilah digunakan secara bergantian dalam genomik.
• Jika dua daerah memiliki kolinearitas, mereka jelas -jelas sintenous.
• Mereka berguna dalam menyimpulkan filogeni.

Apa perbedaan antara Synteny dan Collinearity?

Synteny dan collinearity adalah dua istilah yang digunakan secara bergantian dalam genomik. Synteny mengacu pada co-lokalisasi fisik satu set gen dalam kromosom yang sama pada spesies yang berbeda. Collinearity adalah bentuk synteny di mana himpunan gen diko-lokalisasi dalam urutan yang sama di antara spesies yang berbeda. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan utama antara synteny dan collinearity.

Ringkasan -Synteny vs Collinearity

Istilah Synteny dan Collinearity mengacu pada satu set gen yang terletak pada kromosom yang sama pada spesies yang berbeda. Faktanya, gen-gen ini diko-lokalisasi dalam kromosom yang sama pada spesies yang berbeda. Synteny menggambarkan co-lokalisasi fisik gen yang ditetapkan pada kromosom yang sama pada spesies yang berbeda, sedangkan collinearity adalah bentuk sintrain yang lebih spesifik di mana himpunan gen dilokalisasi dalam urutan yang sama. Dengan demikian, ini merangkum perbedaan antara synteny dan collinearity.

Referensi:

1. "Synteny". En.Wikipedia.Org, 2020, tersedia di sini.
2. “Genomik dan Genomik Komparatif”. Terintegrasi.Net, 2020, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Synteny-mouse-mouse" oleh Sinha Au, Meller J. - Bioinformatika BMC. 2007 Mar 8; 8: 82 [PMID: 17343765] (CC oleh 2.0) Via SScommons Wikimedia