Penting untuk memiliki pengetahuan umum tentang komposisi dan struktur DNA untuk memahami perbedaan antara DNA hulu dan hilir. DNA terdiri dari rantai polinukleotida. Nukleotida adalah blok bangunan yang menciptakan rantai polinukleotida dan masing-masing nukleotida terbuat dari tiga komponen: gula lima karbon, basa nitrogen, dan gugus fosfat. Gugus fosfat dan gugus OH melekat pada karbon posisi 5 'dan 3' posisi karbon molekul gula dalam nukleotida, masing -masing. Nukleotida bergabung bersama oleh ikatan fosfodiester yang terbentuk antara kelompok fosfat 5 'dari satu nukleotida dan kelompok 3' OH dari nukleotida yang berdekatan. Jika rantai polinukleotida memiliki gugus fosfat 5 'gratis, ia ditugaskan sebagai akhir 5'; Jika memiliki grup OH 3 'GRATIS, itu ditugaskan sebagai ujung 3'. Oleh karena itu, untaian DNA biasanya memiliki 5 'dan 3' berakhir sesuai dengan posisi akhir rantai polinukleotida. DNA juga ada sebagai bentuk untai ganda. Dua untaian saling antiparalel. Oleh karena itu, DNA memiliki dua untaian yang berjalan menuju arah 5 'hingga 3' dan 3 'hingga 5' arah. DNA hulu dan hilir dirujuk dengan mengacu pada transkripsi dan sintesis untai mRNA 5 'ke 3'. Jika DNA dipertimbangkan menuju 5 ujung untai pengkodean dari situs inisiasi transkripsi, ia dikenal sebagai DNA hulu. Jika DNA dipertimbangkan menuju ujung 3 'dari untaian pengkodean dari situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai DNA hilir. Ini adalah perbedaan utama antara DNA hulu dan hilir.
ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu DNA hulu
3. Apa itu DNA hilir
4. Perbandingan berdampingan - DNA hulu vs hilir
5. Ringkasan
Gen adalah hereditas unit struktural dan fungsional yang terletak pada DNA suatu organisme. Itu disimpan dengan instruksi untuk membangun protein. Gen ini memiliki wilayah spesifik molekul DNA. Saat diperlukan, ia menyalin dan diterjemahkan menjadi protein melalui sintesis untai mRNA. Biasanya untaian pengkodean gen berjalan dari 5 'ke 3' arah. Ketika ditranskripsikan, ia menghasilkan untai mRNA ke arah yang sama 5 'hingga 3'. Selama transkripsi, untai antisense 3 'hingga 5' disajikan sebagai untai templat dan memulai sintesis mRNA. Ada situs inisiasi transkripsi di gen. Dengan mengacu pada situs inisiasi transkripsi, wilayah DNA menuju ujung 5 'untai pengkodean dikenal sebagai DNA hulu. Promotor gen biasanya terletak di wilayah hulu DNA. Pada gen eukariotik, ada kotak TATA, elemen proksimal promotor, dan penambah di daerah hulu ke gen. Wilayah hulu gen dirujuk dengan angka negatif. DNA hulu gen adalah yang paling penting untuk transkripsi.
Situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai titik +1 gen. Wilayah DNA dari +1 titik menuju ujung 3 'untai pengkodean dikenal sebagai DNA hilir. Dengan kata lain, hilir gen berasal dari situs inisiasi transkripsi menuju ujung 5 'untai templat. Oleh karena itu, DNA hilir daerah gen termasuk unit transkripsi dan urutan lainnya seperti urutan terminator. Promotor dapat mempengaruhi urutan hilir gen. Bagian hilir dari suatu gen dirujuk dengan angka positif. DNA hilir suatu gen adalah daerah aktual yang memberikan produk protein.
Gambar 01: DNA hulu dan hilir
DNA hulu vs hilir | |
Wilayah DNA menuju akhir 5 'dari urutan pengkodean dari situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai DNA hulu. | Wilayah DNA menuju ujung 3 'untai pengkodean dari situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai DNA hilir. |
Elemen | |
Promotor dan penambah terletak di DNA hulu | Unit transkripsi dan urutan Terminator terletak di DNA hilir. |
Penomoran | |
Nukleotida di wilayah hulu dirujuk dengan angka negatif | Nukleotida dirujuk dengan angka positif. |
Fungsi | |
Wilayah ini berisi elemen yang diperlukan untuk mengatur dan memulai transkripsi | Wilayah ini berisi instruksi untuk menghasilkan protein dan mengakhiri transkripsi |
Mudah untuk mengidentifikasi hulu dan hilir untai RNA. Berkenaan dengan situs referensi, wilayah menuju ujung 5 'untai RNA dikenal sebagai RNA hulu sedangkan wilayah menuju ujung 3' dikenal sebagai RNA hilir hilir. Namun, dalam DNA, ada dua untaian yang berjalan di kedua arah 5 'hingga 3' dan 3 'hingga 5'. Oleh karena itu, perbedaan antara DNA hulu dan hilir rumit. Oleh karena itu, ini dibedakan dengan mengacu pada transkripsi gen. Dari situs inisiasi transkripsi menuju 5 ujung untai indera, wilayah DNA dikenal sebagai DNA hulu sedangkan dari situs inisiasi transkripsi menuju ujung 3 'untai indera dikenal sebagai DNA hilir hilir. Inilah perbedaan antara hulu dan hilir DNA.
Referensi:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi, dan Jonatha M. Gott. “Peran berbeda untuk sekuens hulu dan hilir dari situs physarumediting.”RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, September. 2009. Web. 18 Mar. 2017
Gambar milik:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro, dan Luísa Romão. “Regulasi ekspresi gen dengan bingkai bacaan terbuka hulu dan penyakit manusia.”PLOS Genetika. Perpustakaan Sains Umum, N.D. Web. 18 Mar. 2017.