Apa perbedaan antara elemen transposable kelas I dan kelas II

Itu Perbedaan utama antara elemen transposable kelas I dan kelas II adalah bahwa elemen transposable kelas I adalah retrotransposon, sedangkan elemen transposable kelas II adalah transposon DNA.

Elemen transposable adalah urutan DNA yang dapat mengubah posisinya dalam genom. Terkadang itu menciptakan dan membalikkan mutasi. Ini juga dapat mengubah identitas genetik dan ukuran genom sel. Proses ini sering menghasilkan duplikasi bahan genetik yang sama. Elemen transposable pertama kali ditemukan oleh Barbara McClintock, dan dia memenangkan Hadiah Nobel untuk penemuannya pada tahun 1983. Elemen transposable dapat dikategorikan ke dalam dua kelas berdasarkan mekanisme transposisi: elemen transposable kelas I dan kelas II.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa elemen transposable kelas I
3. Apa elemen transposable kelas II
4. Kesamaan - Elemen Transposable Kelas I dan Kelas II
5. Elemen Transposable Kelas I vs Kelas II Dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa elemen transposable kelas I?

Elemen Transposable Kelas I adalah retrotransposon. Retrotransposon adalah jenis komponen genetik yang menyalin dan menempelkan dirinya ke lokasi genomik yang berbeda dengan mengubah RNA kembali menjadi DNA melalui proses yang disebut transkripsi terbalik. Proses ini dikatalisis oleh enzim transkriptase terbalik. Retrotransposon biasanya menggunakan transposisi RNA menengah. Elemen transposable kelas I biasanya disalin dalam dua tahap. Pertama, mereka ditranskripsi dari DNA ke RNA. Kemudian RNA yang diproduksi kemudian ditranskripsi terbalik ke DNA. Kemudian, DNA yang disalin ini dimasukkan kembali ke genom pada posisi baru. Karakteristik retrotransposon sangat mirip dengan retrovirus seperti HIV.

Gambar 01: Elemen Transposable Kelas I

Retrotransposon dapat dibagi menjadi tiga jenis.

1. Retrotransposon dengan pengulangan terminal panjang (LTR), yang mengkodekan transkriptase terbalik,
2. Retrotransposon dengan elemen nuklir yang diselingi panjang (garis) yang menyandikan reverse transcriptase tetapi tidak memiliki LTR dan ditranskripsikan oleh RNA polimerase II,
3. Retrotransposon dengan elemen nuklir pendek (SINE) yang tidak menyandikan untuk transkriptase terbalik dan ditranskripsikan oleh RNA polimerase III.

Selain itu, karena mekanisme yang sama dengan retrotransposon, retrovirus juga dapat dianggap sebagai elemen transposable.

Apa elemen transposable kelas II?

Elemen Transposable Kelas II adalah transposon DNA. Elemen Transposable Kelas II memiliki mekanisme transposisi pemotongan dan paste yang tidak melibatkan perantara RNA. Transposisi dikatalisis oleh beberapa enzim transposase. Enzim ini dapat secara khusus atau non-spesifik mengikat DNA. Transposase membuat potongan terhuyung -huyung di situs target DNA yang menghasilkan ujung lengket. Kemudian ini memotong transposon DNA ke situs target lainnya.

Gambar 02: Elemen Transposable Kelas II

Biasanya, DNA polimerase mengisi celah yang dihasilkan dari ujung lengket, dan DNA ligase menutup tulang punggung gula-fosfat.  Selain itu, transposisi ini menghasilkan duplikasi situs target. Situs penyisipan transposon DNA dapat diidentifikasi dengan pengulangan langsung, diikuti dengan pengulangan terbalik. Tetapi tidak semua transposon DNA menunjukkan mekanisme transposisi pemotongan dan paste. Misalnya, beberapa transposon menunjukkan transposisi replikasi di mana transposon mereplikasi diri mereka ke situs target baru.

Kesamaan antara elemen transposable kelas I dan kelas II

1. Elemen Transposable Kelas I dan Kelas II adalah elemen genetika seluler atau gen melompat.
2. Keduanya dapat mengubah posisi mereka dalam genom.
3. Mereka terdiri dari urutan DNA.
4. Mereka adalah elemen genetik yang egois.
5. Mereka sangat penting dalam fungsi dan evolusi genomik.

Perbedaan antara elemen transposable kelas I dan kelas II

Elemen transposable kelas I adalah retrotransposon, sedangkan elemen transposable kelas II adalah transposon DNA. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara elemen transposable kelas I dan kelas II. Selanjutnya, elemen transposable kelas I menggunakan intermediet RNA dalam mekanisme transposisi. Di sisi lain, elemen transposable kelas II menggunakan intermediet DNA dalam mekanisme transposisi.

Infografis berikut ini mengkompilasi perbedaan antara elemen transposable kelas I dan kelas II dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -Elemen Transposable Kelas I Vs Kelas II

Elemen transposable dikenal sebagai elemen genetik seluler atau gen lompat. Mereka adalah urutan DNA. Elemen transposable dikategorikan ke dalam dua kelas berdasarkan mekanisme transposisi sebagai elemen transposable kelas I dan kelas II. Elemen transposable kelas I adalah retrotransposon, sedangkan elemen transposable kelas II adalah transposon DNA. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara elemen transposable kelas I dan kelas II.

Referensi:

1. “9.6: Kelas elemen transposable.”Libretexts Biology, Libretexts.
2. Wessler, Susan R. “Elemen yang dapat ditransposisi dan evolusi genom eukariotik.”PNA, Akademi Ilmu Pengetahuan Nasional.

Gambar milik:

1. "Retrotransposon" oleh Mariuswalter - karya sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia
2. "Elemen Transposable (2)" oleh Arvid Ågren dan Andrew G. Clark - (CC dengan 2.5) Via Commons Wikimedia