Apa perbedaan antara garis dan sinus

Itu Perbedaan utama antara garis dan sinus adalah garis (elemen nuklir panjang diselingi) adalah jenis retrotransposon non-LTR yang lebih panjang sedangkan SINE (elemen nuklir pendek yang diselingi) adalah jenis retrotransposon non-LTR yang jauh lebih pendek.

Retrotransposon non-LTR tidak mengandung pengulangan terminal panjang (LTR). Namun, mereka mengandung gen untuk reverse transcriptase, protein pengikat RNA, nuclease, dan domain ribonuclease h. Retrotransposon non-LTR memiliki pengulangan singkat. Pengulangan ini memiliki urutan pangkalan yang terbalik di sebelah satu sama lain. Selain itu, retrotransposon non-LTR juga memiliki pengulangan langsung yang ditemukan dalam transposon LRT.  Retrotransposon non-LTR termasuk dalam dua kategori sebagai garis dan sinus.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa garis itu 
3. Apa itu Sines
4. Kesamaan -Garis vs Sines
5. Baris vs sinus dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa garis itu?

Garis (elemen nuklir panjang yang diselingi) adalah retrotransposon non-LTR lebih lama. Mereka tersebar luas dalam genom eukariota. Mereka biasanya make up 21.1% dari genom manusia. Setiap baris sekitar 7000 pasangan basa. Garis dapat ditranskrip menjadi mRNA dan diterjemahkan ke dalam protein yang dapat berfungsi sebagai enzim transkriptase terbalik. Transkripsi terbalik ini menghasilkan salinan DNA dari garis RNA. Salinan DNA ini dapat diintegrasikan ke dalam genom di situs baru.

Gambar 01: Baris dan Sines

Genom manusia hanya memiliki satu garis berlimpah yang disebut Line-1. Elemen Line-1 sekitar 6000 pasangan basa. Ada sekitar 100.000 elemen garis-1 terpotong dalam genom manusia. Mutasi acak dapat terjadi dalam baris. Karena mutasi acak, garis dapat merosot. Mereka tidak lagi ditranskripsikan atau diterjemahkan. Selain itu, garis dikelompokkan menjadi lima kelompok utama seperti L1, RTE, R2, I dan Jockey. Kelima kelompok ini semakin membagi menjadi 28 clades lainnya.

Garis biasanya diperbanyak melalui mekanisme yang disebut target prima mekanisme transkripsi terbalik (TPRT). Penyisipan garis menyebabkan penyakit manusia seperti hemofilia A, kanker, gangguan Mendel, dll. Hipometilasi garis juga memicu jenis kanker tertentu.

Apa itu Sines?

Sines (unsur nuklir pendek diseling) adalah jenis retrotransposon non-LTR yang jauh lebih pendek. Panjangnya sekitar 100 hingga 700. Sines juga merupakan elemen DNA yang memperkuat diri mereka sendiri di seluruh genom eukariotik melalui perantara RNA. Sines membentuk sekitar 13% dari genom mamalia.  Daerah internal Sines berasal dari tRNA. Itu tetap sangat dilestarikan. Mereka sering hadir di banyak spesies vertebrata dan invertebrata. Variasi jumlah salinan dan mutasi pada sinus dapat dimasukkan untuk membangun klasifikasi spesies berbasis filogeni.

Sines dapat dikelompokkan menjadi tiga jenis utama: inti-sinus, v-siny, dan amnsines. Elemen ALU adalah sinus yang paling umum di primata. Selain itu, ada lebih dari 50 penyakit manusia yang terkait dengan penyisipan sinus. Ketika mereka memasukkan dalam atau dekat ekson, mereka dapat menyebabkan splicing yang tidak tepat atau mengubah bingkai membaca. Hal ini menyebabkan fenotip penyakit seperti kanker payudara, kanker usus besar, leukemia, hemofilia, fibrosis kistik, kanker usus besar, penyakit penyok, neurofibromatosis, dll.

Apa kesamaan antara garis dan sinus?

• Baris dan Sinesare Dua jenis retrotransposon non-LTR.
• Keduanya tidak memiliki daerah terminal panjang (LTR).
• Keduanya sebagian besar ditemukan di eukariota.
• Keduanya tidak otonom.

Apa perbedaan antara garis dan sinus?

Garis adalah retrotransposon non-LTR lebih panjang, sedangkan SINE adalah retrotransposon non-LTR yang jauh lebih pendek. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara garis dan sinus. Selanjutnya, kode baris untuk enzim transkriptase terbalik, sedangkan sinus tidak kode untuk enzim transkriptase terbalik. Dengan demikian, ini adalah perbedaan lain antara garis dan sinus.

Lebih banyak perbedaan antara garis dan sinus tercantum di bawah ini dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -Garis vs Sines

Retrotransposon terutama ditemukan di semua eukariota tetapi tidak ada di prokariota. Kira -kira, 37% genom manusia mengandung retrotransposon. Retrotransposon terutama dua jenis: retrotransposon LTR dan non-LTR. Retrotransposon non-LTR tidak mengandung pengulangan terminal panjang (LTR), yang ada dalam retrotransposon LTR. Retrotransposon non-LTR lebih lanjut dibagi menjadi dua kategori: baris dan sinus. Garis adalah retrotransposon non-LTR lebih panjang, sedangkan SINE adalah retrotransposon non-LTR yang jauh lebih pendek. Dengan demikian, ini adalah ringkasan perbedaan antara garis dan sinus.

Referensi:

1. “Retrotransposon."Tinjauan umum | Topik ScienceDirect.
2. Hancks, Dustin C., dan Haig h. Kazazian. “Peran untuk penyisipan retrotransposon dalam penyakit manusia.”DNA seluler, Biomed Central, 6 Mei 2016.

Gambar milik:

1. "Line1s and Sines" oleh Mariuswalter - karya sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia