Apa perbedaan antara ligase T4 DNA dan E coli DNA ligase

Itu Perbedaan utama antara T4 DNA ligase dan E. coli DNA ligase adalah bahwa T4 DNA ligase adalah enzim yang diisolasi dari bakteriofag T4 sedangkan E. coli DNA ligase adalah enzim yang diisolasi dari bakteri E. coli.

Ligase DNA adalah jenis enzim spesifik yang memfasilitasi penggabungan untaian DNA bersama -sama melalui pembentukan ikatan fosfodiester. Ini memainkan peran penting dengan memperbaiki istirahat untai tunggal dan istirahat untai ganda dalam DNA organisme hidup. Selain itu, DNA ligase digunakan dalam perbaikan DNA dan replikasi DNA. Terlepas dari penggunaan di atas, DNA ligase juga memiliki penggunaan luas dalam percobaan biologi molekuler seperti teknologi DNA rekombinan. T4 DNA ligase dan E. coli Ligase DNA adalah dua jenis enzim ligase DNA.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu T4 DNA Ligase  
3. Apa itu ligase E coli DNA
4. Kesamaan -Ligase DNA T4 dan Ligase DNA E COLI
5. T4 DNA ligase vs e coli DNA ligase dalam bentuk tabel
6. Ringkasan -T4 DNA ligase vs e coli DNA ligase

Apa itu T4 DNA Ligase?

T4 ligase adalah enzim penggabungan DNA yang diisolasi dari bakteriofag T4. Bakteriofag T4 adalah virus yang menginfeksi Escherichia coli. Enzim ligase T4 adalah ligase DNA yang paling umum digunakan dalam penelitian laboratorium biologis molekuler. Biasanya, ligase T4 mengkatalisasi penggabungan dua untaian kohesif atau tumpul dari DNA untai ganda antara kelompok hidroksil 5 'fosfat dan 3' dari nukleotida yang berdekatan. Ini juga dapat mengkatalisasi bergabungnya RNA ke untai DNA atau RNA dalam molekul dupleks. Namun, enzim ini tidak akan bergabung dengan asam nukleat untai tunggal. Selain itu, ia juga dapat mengikat DNA ujung tumpul dengan efisiensi yang jauh lebih besar dari E. coli Ligase DNA.

Gambar 01: Ligase DNA T4

Enzim ini membutuhkan ATP sebagai kofaktor. Beberapa percobaan penelitian rekayasa genetika telah menghasilkan enzim ligase DNA yang lebih aktif daripada tipe T4 DNA tipe liar. Dalam salah satu pendekatan, mereka menciptakan molekul enzim fusi dengan menggabungkan ligase T4 DNA ke molekul P50 atau NF-kB NF-KB. Enzim ligase T4 baru ini 160% lebih aktif dalam ligasi tumpul untuk keperluan kloning daripada tipe liar T4 DNA ligase. Selanjutnya, suhu optimal untuk ligase DNA T4 untuk mengkatalisasi reaksi ligasi lebih tepat adalah 16 ° C.

Apa itu ligase E coli DNA?

E. coli DNA ligase adalah enzim yang terisolasi dari E. coli bakteri. Gen yang bertanggung jawab untuk membuat E. coli Ligase DNA adalah gen lig. Itu E. coli DNA, ligase serta kebanyakan ligase DNA prokariota, menggunakan energi yang diperoleh oleh NAD (nicotinamide adenine dinucleotide) untuk menciptakan ikatan fosfodiester.

Gambar 02: E. Coli DNA ligase

E. coli Ligase DNA adalah enzim ligasi yang dapat bergabung dengan fragmen DNA dengan mengkatalisasi pembentukan ikatan fosfodiester antara fragmen DNA untai ganda yang mengandung 5 'fosfat termini dan hydroxyl termini 5'. Selain itu, tidak mengikat DNA ujung tumpul kecuali dalam kondisi khusus seperti crowding molekuler dengan polietilen glikol. Itu juga tidak dapat bergabung dengan RNA ke DNA secara efisien. Selanjutnya, aktivitas E. coli Ligase DNA dapat ditingkatkan dengan adanya DNA polimerase 1 pada konsentrasi kanan. Namun, ketika konsentrasi enzim DNA polimerase 1 lebih tinggi, ia memiliki efek samping pada E. coli Aktivitas ligase DNA.

Apa kesamaan antara T4 DNA ligase dan E coli DNA ligase?

• T4 DNA ligase dan E-coli Ligase DNA adalah dua jenis enzim ligase DNA.
• Keduanya adalah protein yang terdiri dari asam amino.
• Enzim ini mengkatalisasi pembentukan ikatan fosfodiester antara 5 'fosfat dan 3' hidroksil termini dalam DNA dupleks.
• Mereka memiliki kegunaan yang luas dalam percobaan biologi molekuler seperti teknologi DNA rekombinan.

Apa perbedaan antara ligase T4 DNA dan E coli DNA ligase?

T4 DNA ligase adalah enzim yang diisolasi dari bakteriofag T4 sementara E. coli DNA ligase adalah enzim yang terisolasi dari E. coli bakteri. Dengan demikian, ini adalah perbedaan utama antara T4 DNA ligase dan E. coli Ligase DNA. Selanjutnya, sumber energi untuk ligase DNA T4 adalah ATP. Di sisi lain, sumber energi untuk E. coli Ligase DNA adalah NAD.

Infografis di bawah ini menyajikan perbedaan antara T4 DNA ligase dan E coli Ligase DNA dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.

Ringkasan -T4 DNA ligase vs e coli DNA ligase

T4 DNA ligase dan E. coli Ligase DNA adalah dua enzim yang mengkatalisasi pembentukan ikatan fosfodiester antara 5 'fosfat dan 3' hidroksil termini dalam DNA dupleks. T4 ligase adalah enzim yang diisolasi dari bakteriofag T4 sementara E. coli DNA ligase adalah enzim yang terisolasi dari E. coli bakteri. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara T4 DNA ligase dan E coli Ligase DNA.

Referensi:

1. “T4 DNA Ligase.”New England Biolabs: Reagents for the Life Sciences Industry.
2. “E. Coli DNA ligase.”New England Biolabs: Reagents for the Life Sciences Industry.

Gambar milik:

1. “Situs Diarahkan Mutatgenesis” oleh Mjeltsch - Karya Sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia
2. "DNA ketidakcocokan" oleh Kenji Fukui - NCBI (CC oleh 3.0) Via Commons Wikimedia