Itu Perbedaan utama antara cyanol xylene dan bromophenol blue adalah bahwa dalam gel agarosa 1%, cyanol xylene bermigrasi lebih lambat, sedangkan bromophenol biru bermigrasi lebih cepat.
Cyanol xylene dan bromophenol biru penting sebagai penanda warna yang dapat digunakan dalam memantau proses elektroforesis gel agarosa dan elektroforesis gel poliakrilamida.
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu cyanol xylene
3. Apa itu Bromophenol Blue
4. Xylene cyanol vs bromophenol biru dalam bentuk tabel
5. Ringkasan - Xylene Cyanol vs Bromophenol Blue
Cyanol xylene adalah penanda warna elektroforesis atau pewarna pelacak. Ini berguna dalam memantau proses elektroforesis gel agarosa dan elektroforesis gel poliakrilamida. Saat zat ini dicampur dengan sampel, konsentrasi zat ini biasanya sekitar 0.005% hingga 0.03%. Beberapa sinonim yang dapat kita gunakan untuk cyanol xylene termasuk asam biru 147, sianol xylene, cyanol xylene FF, ff sianol xylene, dll.
Formula kimia senyawa ini adalah C25H27N2Nao6S2. Massa molar cyanol xylene adalah 538.61 g/mol. Zat ini dapat bermigrasi pada tingkat sekitar 4 - 5 kilobase pasangan fragmen DNA dalam gel agarosa 1%. Namun, ini tergantung pada buffer yang kami gunakan. Biasanya, sianol xylene pada gel poliakrilamida 6% dapat bermigrasi dengan kecepatan sekitar 140 fragmen DNA pasangan dasar. Di sisi lain, dapat bermigrasi dalam 20% elektroforesis gel poliakrilamida pada tingkat 25 pangkalan oligonukleotida.
Jumlah donor ikatan hidrogen dari cyanol xylene adalah 2m, dan jumlah akseptor ikatan hidrogen adalah 8. Jumlah ikatan yang dapat diputar dari senyawa ini dapat diberikan sebagai 7. Kompleksitas cyanol xylene dapat digambarkan sebagai 1120 derajat. Ini memiliki jumlah stereocenter obligasi yang ditentukan dari 1.
Bromophenol Blue adalah indikator pH yang berguna yang berguna sebagai penanda warna elektroforesis dan pewarna. Ini memiliki nama kimia 3 ', 3 ", 5', 5" -tetrabromophenolsulfonphthalein, BPB. Formula kimia senyawa ini adalah C19H10Br4HAI5S. Massa molar senyawa ini adalah 669.96 g/mol. Itu tidak berbau, dan kepadatannya dapat diberikan sebagai 2.2 g/ml. Titik lelehnya adalah 273 derajat Celcius, dan titik didihnya adalah 279 derajat Celcius. Kita dapat menyiapkannya dengan perlahan menambahkan bromin berlebih ke larutan panas fenolsulfonftalein dalam asam asetat glasial.
Bromophenol Blue berguna sebagai indikator asam-basa dalam kisaran antara pH 3.0 hingga 4.6. Itu mampu berubah dari kuning pada pH 3.0 hingga pH 4.6. Selain itu, ini adalah reaksi yang dapat dibalikkan. Secara struktural, bromophenol blue mirip dengan fenolftalein.
Selain itu, kita dapat menggunakannya sebagai penanda warna untuk memantau proses elektroforesis gel agarosa dan elektroforesis gel poliakrilamida. Zat ini dapat membawa muatan negatif pada pH sedang, di mana ia dapat bermigrasi ke arah yang sama dengan DNA atau protein dalam gel. Tingkat migrasi dapat bervariasi sesuai dengan kepadatan gel dan komposisi buffer. Namun, dalam gel agarosa 1% khas dalam 1 kali buffer TAE atau buffer TBE, zat ini bermigrasi pada tingkat yang sama dengan fragmen DNA sekitar 300 pasangan basa.
Xylene Cyanol dan Bromophenol Blue adalah penanda warna yang penting. Perbedaan utama antara cyanol xylene dan bromophenol biru adalah bahwa dalam gel agarosa 1%, cyanol xylene bermigrasi lebih lambat, sedangkan bromophenol biru bermigrasi lebih cepat.
Di bawah ini adalah ringkasan perbedaan antara cyanol xylene dan bromophenol biru dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Cyanol xylene dan bromophenol biru penting karena penanda warna yang digunakan dalam memantau proses elektroforesis gel agarosa dan elektroforesis gel poliakrilamida. Perbedaan utama antara cyanol xylene dan bromophenol biru adalah bahwa pada gel agarosa 1%, cyanol xylene bermigrasi lebih lambat sedangkan bromophenol biru bermigrasi lebih cepat.
1. “Xylene Cyanole FF." Pusat Nasional Informasi Bioteknologi. Basis Data Senyawa Pubchem, U.S. Perpustakaan Kedokteran Nasional.
1. "Xylencyanol" oleh Kopiersperre - karya sendiri (domain publik) melalui Commons Wikimedia
2. "Bromophenol Blue" oleh Panoramix303 - Pekerjaan Sendiri (Domain Publik) Via Commons Wikimedia