Perbedaan antara klon dengan sekuensing klon dan sekuensing senapan

Itu perbedaan utama Antara klon dengan sekuensing klon dan sekuensing senapan terletak pada metode perilaku mereka. Metode sekuensing klon dengan klon melibatkan pemetaan kromosom dan kloning sebelum diurut.

Klon dengan sekuensing klon dan klon dengan sekuensing senapan adalah dua metode sekuensing genom modern. Klon dengan sekuensing klon adalah metode sekuensing yang lebih andal. Namun, metode sekuensing clone by shotgun lebih cepat dan lebih murah. Artikel ini berfokus pada perbedaan halus antara klon dengan sekuensing klon dan sekuensing senapan.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu klon dengan sekuensing klon 
3. Apa itu Klon dengan Sequencing Shotgun
4. Kesamaan antara klon dengan sekuensing klon dan sekuensing senapan
5. Perbandingan berdampingan - Klon dengan sekuensing klon vs sekuensing senapan dalam bentuk tabel
6. Ringkasan

Apa itu klon dengan sekuensing klon?

Klon dengan sekuensing klon adalah metode sekuensing genom. Itu membutuhkan pemetaan masing -masing kromosom sebelum pemisahan DNA. Setelah pemetaan, DNA harus dipecah menjadi fragmen sepanjang 150 kilobase. Fragmen -fragmen ini kemudian siap untuk diurutkan. Langkah selanjutnya adalah penyisipan fragmen DNA ke dalam kromosom buatan bakteri (BAC) dan kemudian ke dalam sel bakteri. Karena fragmen sekarang berada di dalam sel bakteri, setiap kali ketika bakteri membelah, fragmen DNA yang dimasukkan juga membelah dan menghasilkan banyak salinan yang identik. Kemudian, DNA klon bakteri individu terfragmentasi menjadi 500 pasangan basa fragmen panjang. Mereka adalah fragmen yang lebih kecil dan tumpang tindih. Selanjutnya, sekuensing terjadi dengan penyisipan fragmen -fragmen ini ke dalam vektor dengan urutan DNA yang diketahui. Mulai dari urutan vektor yang diketahui, sekuensing berlanjut hingga urutan yang tidak diketahui.

Setelah menyelesaikan sekuensing, perlu mengidentifikasi area urutan tumpang tindih. Setelah itu, bergabung dengan fragmen terjadi untuk membentuk fragmen yang lebih besar yang awalnya disajikan dalam BACS. Selanjutnya, perakitan fragmen yang lebih besar ke dalam kromosom terjadi sesuai dengan peta genom.

Gambar 01: Sekuensing klon dengan klon

Keuntungan signifikan dari klon dengan sekuensing klon adalah bahwa peta genom yang sudah disiapkan sebelumnya membantu perakitan yang andal dari fragmen yang lebih besar. Tapi, kerugian dari metode sekuensing ini adalah memakan waktu untuk menghasilkan peta genom dan membuat klon. Namun, ini adalah metode yang lebih disukai selama 'Proyek Genom Manusia'.

Apa itu Klon dengan Sequencing Shotgun?

Klon dengan Sequencing Shotgun adalah metode sekuensing yang secara acak memecah urutan DNA menjadi banyak fragmen kecil dan memasang kembali urutan dengan mengamati daerah yang tumpang tindih. Genom mamalia yang lebih besar sulit untuk dikloning dan berkumpul. Itu karena kompleksitas dan ukuran struktural mereka. Meskipun metode sekuensing klon dengan klon dapat diandalkan, dibutuhkan waktu lama untuk mengurutkan genom organisme kompleks. Oleh karena itu, klon dengan sekuensing senapan telah menjadi metode sekuensing yang lebih murah yang dapat dilakukan lebih cepat. Oleh karena itu, para ilmuwan modern mengandalkan metode sekuensing ini untuk mengatasi genom yang kompleks.

Gambar 02: Sekuensing Klon dengan Shotgun

Selama metode sekuensing klon dengan senapan, tidak ada pemetaan genom konvensional dan langkah kloning terjadi. Awalnya, seluruh genom terfragmentasi menjadi berbagai ukuran dari 20 kilobase hingga 300 kilobase. Selanjutnya, pengurutan terjadi. Kemudian, menggunakan perangkat lunak komputer yang canggih, perlu untuk merakit fragmen dengan melihat daerah yang tumpang tindih.

Sekuensing klon dengan senapan membantu meningkatkan keakuratan urutan genom yang ada. Keuntungan utama dari metode ini adalah bahwa itu jauh lebih cepat dan lebih murah daripada metode sekuensing klon dengan klon. Namun, proses ini tidak melibatkan penggunaan peta genetik. Oleh karena itu, kesalahan selama kumpulan lebih mungkin terjadi. Dengan demikian, ini adalah kerugian utama dalam metode sekuensing klon dengan senapan.

Apa kesamaan antara klon dengan sekuensing klon dan sekuensing senapan?

• Kedua klon dengan sekuensing klon dan sekuensing senapan adalah dua metode sekuensing genom.
• Selama kedua teknik sekuensing, perakitan fragmen yang rusak terjadi dengan mengidentifikasi daerah yang tumpang tindih.
• Juga, pemecahan DNA menjadi fragmen yang lebih kecil diperlukan untuk sekuensing klon dan senapan.

Apa perbedaan antara sekuensing klon dengan klon dan sekuensing senapan?

Teknik sekuensing klon dengan klon melibatkan dua langkah utama: pemetaan kromosom dan kloning. Sebaliknya, sekuensing klon dengan senapan tidak mengikuti dua langkah ini; secara acak memecah urutan DNA menjadi banyak fragmen kecil dan menyusun kembali urutan dengan mengamati daerah yang tumpang tindih. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan utama antara sekuensing klon dengan klon dan sekuensing senapan. Karena faktor ini, sekuensing klon dengan klon adalah proses yang mahal dan memakan waktu sementara sekuensing clone by shotgun lebih cepat dan lebih murah.

Namun, kesalahan selama perakitan cenderung terjadi selama klon dengan sekuensing klon. Oleh karena itu, ia memiliki keandalan yang tinggi. Namun, sekuensing clone by shotgun relatif merupakan teknik yang kurang dapat diandalkan. Jadi, ini juga perbedaan yang signifikan antara sekuensing klon dengan sekuensing klon dan sequencing senapan.

Info-grafik di bawah ini menyajikan informasi lebih lanjut mengenai perbedaan antara sekuensing klon dengan klon dan sekuensing senapan.

Ringkasan -Klon dengan sekuensing klon vs sequencing senapan

Dalam meringkas perbedaan antara klon dengan sekuensing klon dan sekuensing senapan, sekuensing klon dengan sekuensing klon dan sekuensing senapan adalah dua metode sekuensing genom. Namun, teknik sekuensing klon dengan klon melibatkan pemetaan genom dan proses kloning sementara sekuensing clone by shotgun tidak. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara sekuensing klon dengan klon dan sekuensing senapan. Karena pemetaan genom terjadi selama klon dengan sekuensing klon, kesalahan cenderung terjadi selama perakitan urutan. Tapi, sekuensing klon dengan senapan adalah proses yang jauh lebih cepat dan lebih murah. Namun, itu relatif kurang dapat diandalkan. Klon dengan sekuensing klon adalah metode sekuensing yang disukai selama 'Proyek Genom Manusia'. Tapi, ahli biologi molekuler modern lebih bergantung pada klon dengan sekuensing senapan.

Referensi:

1. “Apa itu sekuensing klon-oleh-klon?Fakta, tim keterlibatan publik di kampus Wellcome Genome, 17 Nov. 2014, tersedia di sini.
2. “Apa itu sekuensing senapan?Fakta, tim keterlibatan publik di kampus Wellcome Genome, 17 Nov. 2014, tersedia di sini.

Gambar milik:

1. “Langkah Kloning Molekul” oleh Alexpicardal97 - Karya Sendiri, CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia
2. “Shotgun Sequencing LG” oleh National Human Genome Research Institute - National Institutes of Health. Lembaga Penelitian Genom Manusia Nasional. “Berbicara Glosari Istilah Genetik.”Diperoleh 17 November 2016 (domain publik) melalui Commons Wikimedia