Perbedaan antara penanda yang dapat dipilih dan gen reporter

Perbedaan Kunci - Gen Marker Vs Reporter yang Dapat Dipilih
 

Teknik Rekayasa Genetika digunakan untuk mentransfer gen penting dari organisme ke organisme lain. Penyisipan gen asing ke genom organisme lain dan membuatnya diekspresikan dalam sel inang adalah langkah paling sulit dalam transfer gen. Untuk mendeteksi keberhasilan proses transformasi, penanda yang dapat dipilih dan gen reporter digunakan dalam molekul rekombinan. Penanda yang dapat dipilih adalah urutan DNA atau gen yang mengekspresikan dan memilih sel yang diubah dari sel yang tidak ditransformasikan. Gen reporter adalah gen lain yang digunakan untuk membedakan sel yang ditransformasikan dan untuk mengukur atau mendeteksi bagaimana fungsi gen yang dimasukkan dalam inang. Perbedaan utama antara penanda yang dapat dipilih dan gen reporter adalah bahwa Penanda yang dapat dipilih digunakan untuk menyaring sel-sel yang tidak ditransformasi dan menandakan sel yang ditransformasikan sementara gen reporter digunakan untuk mengukur tingkat ekspresi gen dalam host.

ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa yang dapat dipilih penanda
3. Apa itu gen reporter
4. Perbandingan berdampingan - Gen Marker Vs Reporter yang Dapat Dipilih
5. Ringkasan

Apa itu penanda yang dapat dipilih?

Dalam rekayasa genetika, gen yang menarik dimasukkan ke dalam vektor yang cocok dan diubah menjadi organisme inang. Namun, transformasi hanya berhasil dalam sel inang yang kompeten, dan ada kemungkinan sel inang untuk menolak penyerapan DNA asing. Oleh karena itu, diferensiasi sel yang diubah dan tidak ditransformasi penting untuk melanjutkan eksperimen lebih lanjut. Oleh karena itu, para peneliti menggabungkan gen penanda yang dapat dipilih ke vektor untuk pemilihan sel yang ditransformasikan dengan mudah dari sel yang tidak ditransformasi. Penanda yang dapat dipilih adalah urutan DNA, terutama gen yang berguna dalam identifikasi sel yang diubah. Gen penanda ini menunjukkan sifat yang sesuai dengan seleksi buatan sel yang ditransformasikan dari sel yang tidak ditransformasi pada media.

Penanda terpilih yang paling umum digunakan dalam biologi molekuler adalah gen resisten antibiotik. Gen resistensi antibiotik dimasukkan ke dalam vektor dan diubah menjadi sel inang terutama menjadi bakteri inang. Antibiotik tertentu dimasukkan ke dalam media penanaman bakteri.  Karena adanya penanda selektif, dalam kondisi selektif, hanya sel yang mengandung penanda yang dapat dipilih yang sesuai yang dapat bertahan hidup. Sel yang tidak ditransformasi tidak dapat tumbuh dalam media yang mengandung antibiotik. Oleh karena itu, karena penanda yang dapat dipilih yang tahan antibiotik, sel yang diubah dengan mudah diidentifikasi.

Gen yang memberikan sifat untuk antimetabolit, herbisida digunakan sebagai penanda selektif dalam vektor kloning dalam rekayasa genetika tanaman. Namun, cotransformasi penanda selektif ini menjadi organisme yang dimodifikasi secara genetik ini memiliki efek negatif pada lingkungan dan manusia. Pelepasan bakteri resisten antibiotik dapat meningkatkan resistivitas antibiotik patogen manusia. Ini dapat mencemari produk atau biomassa dengan antibiotik dan dapat kehilangan tekanan selektif sebagai akibat dari degradasi antibiotik dan inaktivasi.

Gambar 01: Vektor plasmid untuk transfer gen dengan penanda yang dapat dipilih

Apa itu gen reporter?

Gen reporter adalah gen yang memungkinkan deteksi atau pengukuran ekspresi gen yang dimasukkan. Gen reporter ini dapat dilampirkan pada urutan regulasi gen yang menarik untuk menandakan lokasi atau level ekspresi. Oleh karena itu, selama ekspresi gen di bawah promotor yang sama, mereka ditranskripsikan ke dalam urutan mRNA tunggal dan kemudian diterjemahkan ke dalam protein yang dapat menunjukkan tingkat ekspresi gen.

Gen reporter dari berbagai jenis, dan mereka mengandung karakteristik yang dapat diidentifikasi secara visual yang biasanya terlibat dalam protein fluoresen dan bercahaya. Gen yang mengkode protein fluorescent dan enzim, mengubah substrat yang tidak terlihat menjadi produk luminescent atau berwarna dengan menandakan ekspresi gen yang berhasil dan memberikan peluang untuk kuantifikasi ekspresi gen.

Gambar 02: Ekspresi Gen Reporter

Apa perbedaan antara penanda yang dapat dipilih dan gen reporter?

Ringkasan -Gen Marker Vs Reporter yang Dapat Dipilih

Penanda yang dapat dipilih memungkinkan sel yang ditransformasikan untuk tumbuh dalam media selektif yang diberi dosis antibiotik atau herbisida tertentu. Mereka digunakan untuk seleksi awal sel yang ditransformasikan. Gen reporter digunakan untuk mengukur tingkat ekspresi gen yang diinginkan dimasukkan. Mereka juga memungkinkan diferensiasi sel yang diubah dan tidak ditransformasi. Ini adalah perbedaan antara penanda yang dapat dipilih dan gen reporter. Baik penanda yang dapat dipilih dan gen reporter dianggap sebagai penanda penting dalam rekayasa genetika.

Referensi:
1. Ziemienowicz, Alicja. “Penanda dan gen reporter yang dapat dipilih tanaman.”Springerlink. Springer-Verlag, n.D. Web. 23 Mar. 2017.
2. Shih, Chen-Han, Hsiao-Yin Chen, Hung-Chieh Lee, dan Huai-Jen Tsai. “Gen kromoprotein ungu berfungsi sebagai penanda seleksi baru untuk transgenesis mikroalga nannochloropsis oculata.”Plos satu. Perpustakaan Sains Umum, N.D. Web. 25 Mar. 2017

Gambar milik:
1. "Plasmid with Insert" oleh Michael Jeltsch - karya sendiri (CC BY -SA 4.0) Via Commons Wikimedia
2. "Gen Reporter" dengan Transcontrol di EN.Wikipedia (CC BY-SA 3.0) Via Commons Wikimedia